| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| ·猪肉质性状概述 | 第12-15页 |
| ·研究猪肉质性状的意义 | 第12页 |
| ·度量猪肉质性状的常用指标 | 第12-15页 |
| ·影响猪肉质性状的因素 | 第15页 |
| ·鉴定主效基因的主要方法 | 第15-20页 |
| ·候选基因法 | 第15-16页 |
| ·基因组扫描（标记-QTL 连锁分析） | 第16-19页 |
| ·全基因组关联分析 | 第19-20页 |
| ·GWAS 在家畜动物中的研究进展 | 第20-21页 |
| ·QTL 到 QTN 的研究 | 第21-23页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 材料与方法 | 第24-35页 |
| ·试验材料 | 第24-26页 |
| ·试验动物 | 第24-25页 |
| ·组织样品采集与保存 | 第25页 |
| ·主要试剂和溶液配制 | 第25-26页 |
| ·试验方法 | 第26-32页 |
| ·试验流程 | 第26-27页 |
| ·表型测定与记录 | 第27-30页 |
| ·猪基因组 DNA 的提取与检测 | 第30页 |
| ·SNP 基因型的判定 | 第30-32页 |
| ·数据整理与分析 | 第32-35页 |
| ·表型数据分析 | 第32-33页 |
| ·全基因组关联分析 | 第33页 |
| ·表型相关 | 第33页 |
| ·单倍型分析 | 第33-34页 |
| ·群体分层 | 第34页 |
| ·基因注释与位置候选基因的搜寻 | 第34-35页 |
| 第三章 结果与分析 | 第35-60页 |
| ·基因组 DNA 的提取和检测 | 第35-36页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第35页 |
| ·核酸分析仪检测 | 第35-36页 |
| ·猪肉质性状表型数据分析结果 | 第36-39页 |
| ·描述性统计分析 | 第36-37页 |
| ·肉质性状表型相关性分析 | 第37-39页 |
| ·SNP 质控结果 | 第39-41页 |
| ·全基因组 SNP 分型 | 第39页 |
| ·基因型质量控制 | 第39-41页 |
| ·肉质性状全基因组关联分析结果 | 第41-47页 |
| ·不同染色体显著水平 | 第41-42页 |
| ·不同肉质性状 GWAS 结果 | 第42-47页 |
| ·群体分层评估结果 | 第47-48页 |
| ·不同性状 GWAS 显著 SNPS 功能注释结果 | 第48-56页 |
| ·肌内脂肪含量 | 第48-50页 |
| ·大理石纹 | 第50-51页 |
| ·水分 | 第51-52页 |
| ·肉色评分 | 第52-53页 |
| ·a* | 第53页 |
| ·后腿瘦肉量 | 第53-54页 |
| ·瘦肉率 | 第54-55页 |
| ·瘦肉量 | 第55-56页 |
| ·单倍型分析结果 | 第56-60页 |
| 第四章 讨论 | 第60-75页 |
| ·群体分层讨论 | 第60页 |
| ·单倍型讨论 | 第60-62页 |
| ·GWAS 结果讨论 | 第62-64页 |
| ·肉品质性状结果讨论 | 第62-63页 |
| ·瘦肉量性状讨论 | 第63-64页 |
| ·关于全基因组关联分析 | 第64-66页 |
| ·GWAS 前景 | 第64-65页 |
| ·GWAS 方法局限性探讨 | 第65-66页 |
| ·关键候选基因讨论 | 第66-75页 |
| ·MYH 家族讨论 | 第66-67页 |
| ·GAS 家族讨论 | 第67-71页 |
| ·SLC 家族讨论 | 第71-75页 |
| 第五章 全文结论 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 作者简历 | 第100页 |