| 术语/缩略词表 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 前言 | 第11页 |
| 研究背景 | 第11-16页 |
| 1.1 肝癌，肿瘤细胞的转移 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组，蛋白质组和组学数据整合分析 | 第12-13页 |
| 1.3 国内外研究现状和存在的问题 | 第13-14页 |
| 1.4 研究内容 | 第14-16页 |
| 1 组学数据的基本信息分析和差异表达基因筛选 | 第16-28页 |
| 1.1 材料与方法 | 第16-21页 |
| 1.1.1 生物学模型和数据集 | 第16-17页 |
| 1.1.2 数据搜库和质量控制 | 第17-18页 |
| 1.1.3 组学数据基本信息分析 | 第18-19页 |
| 1.1.4 差异表达基因/蛋白的筛选 | 第19-21页 |
| 1.2 结果与讨论 | 第21-27页 |
| 1.2.1 转录组数据的基本信息分析 | 第21-22页 |
| 1.2.2 蛋白质组数据的基本信息分析 | 第22-26页 |
| 1.2.3 两个组学数据集之间的重叠部分 | 第26页 |
| 1.2.4 差异表达基因/蛋白的筛选 | 第26-27页 |
| 1.3 本章小结 | 第27-28页 |
| 2 转移潜能递进的肝癌细胞系模型多组学差异表达基因的整合分析和蛋白质组动态变化模式的构建 | 第28-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-30页 |
| 2.1.1 数据集 | 第28-29页 |
| 2.1.3 转移潜能递进的肝癌细胞系模型的蛋白质组动态变化模式构建 | 第29-30页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第30-39页 |
| 2.2.1 组学数据相关性随基因与癌症相关性上升而上升 | 第30-33页 |
| 2.2.2 多组学差异表达谱的基因功能分析 | 第33-35页 |
| 2.2.3 蛋白质组动态变化模式的构建 | 第35-39页 |
| 2.3 本章小结 | 第39-40页 |
| 3 组学数据分析方法在大规模数据分析中的应用 | 第40-47页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-43页 |
| 3.1.1 实验设计 | 第41-42页 |
| 3.1.2 数据集和质量控制 | 第42-43页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第43-46页 |
| 3.2.1 多种组学数据的整合分析 | 第43-45页 |
| 3.2.2 富集策略亚蛋白质组数据的整合分析 | 第45-46页 |
| 3.3 本章小结 | 第46-47页 |
| 总结与讨论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 附录和附图 | 第53-57页 |
| 代表性论著 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-61页 |
| 个人简介 | 第61-62页 |
