| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-27页 |
| 1.1 穿膜多肽简介 | 第13-19页 |
| 1.1.1 穿膜多肽的分类 | 第13-14页 |
| 1.1.2 穿膜肽穿膜过程的实验研究 | 第14-17页 |
| 1.1.3 穿膜肽穿膜机理的模拟研究 | 第17-19页 |
| 1.2 生物膜简介 | 第19-21页 |
| 1.2.1 生物膜的特性与功能 | 第19-20页 |
| 1.2.2 分子动力学模拟的磷脂膜 | 第20-21页 |
| 1.3 分子动力学模拟 | 第21-25页 |
| 1.3.1 分子动力学方法 | 第22-23页 |
| 1.3.2 GROMACS软件 | 第23-24页 |
| 1.3.3 分子动力学模拟力场 | 第24-25页 |
| 1.4 本课题的研究背景及主要内容 | 第25-27页 |
| 第二章 传统的单膜模型中穿膜肽与磷脂膜的相互作用 | 第27-41页 |
| 2.1 前言 | 第27-28页 |
| 2.2 磷脂双分子膜和穿膜肽的选取 | 第28-30页 |
| 2.3 磷脂双分子层膜与穿膜肽的分子动力学模拟 | 第30-31页 |
| 2.3.1 模拟方法 | 第30页 |
| 2.3.2 模拟参数设置 | 第30-31页 |
| 2.4 模拟结果与讨论 | 第31-39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-41页 |
| 第三章 穿膜肽穿膜过程的PMF计算模拟 | 第41-47页 |
| 3.1 计算方法 | 第41-43页 |
| 3.1.1 平均力势PMF(Potential of mean force) | 第41页 |
| 3.1.2 伞形抽样(Umbrella Sampling) | 第41-43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-45页 |
| 3.3 本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 双膜模型的穿膜肽穿膜过程模拟 | 第47-65页 |
| 4.1 双膜模型 | 第47页 |
| 4.2 模拟细节 | 第47-48页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第48-63页 |
| 4.3.1 有无电势差存在的影响 | 第48-51页 |
| 4.3.2 不同大小的电势差模拟 | 第51-53页 |
| 4.3.3 穿膜肽的穿膜过程 | 第53-63页 |
| 4.4 本章小结 | 第63-65页 |
| 第五章 结论 | 第65-67页 |
| 5.1 结论 | 第65-66页 |
| 5.2 创新 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 致谢 | 第71-73页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第73-75页 |
| 作者和导师介绍 | 第75-76页 |
| 附件 | 第76-77页 |