| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 前言 | 第11-37页 |
| 1.1 拟南芥的花药发育 | 第11-18页 |
| 1.2 花药壁的发育 | 第18页 |
| 1.3 绒毡层的发育功能 | 第18-20页 |
| 1.4 绒毡层发育相关基因 | 第20-23页 |
| 1.5 中层的发育与功能 | 第23-25页 |
| 1.6 激光显微切割技术 | 第25-33页 |
| 1.6.1 激光显微切割的原理及分类 | 第25-27页 |
| 1.6.2 激光显微切割技术的应用 | 第27-33页 |
| 1.7 植物转录组学研究 | 第33-35页 |
| 1.8 研究的目的和意义 | 第35-37页 |
| 2 材料与方法 | 第37-53页 |
| 2.0 植物材料 | 第37页 |
| 2.1 试剂与仪器 | 第37-38页 |
| 2.2 菌株与载体 | 第38-39页 |
| 2.3 植物材料的种植 | 第39页 |
| 2.4 激光显微切割及RNA-seq | 第39-41页 |
| 2.5 载体构建及植株转化 | 第41-44页 |
| 2.6 细胞学 | 第44-45页 |
| 2.7 RNA的抽提及反转录 | 第45-46页 |
| 2.8 荧光定量PCR | 第46页 |
| 2.9 原核表达与蛋白纯化 | 第46-47页 |
| 2.10 凝胶阻滞实验 | 第47-48页 |
| 2.11 烟草叶片瞬时表达 | 第48页 |
| 2.12 染色质免疫共沉淀 | 第48-53页 |
| 3 拟南芥绒毡层的激光显微切割及转录组测序与分析 | 第53-97页 |
| 3.1 拟南芥花序石蜡切片条件的优化 | 第53-57页 |
| 3.2 RNA-seq测序数据分析 | 第57-69页 |
| 3.2.1 RNA-seq测序数据量及质控结果 | 第57-59页 |
| 3.2.2 与参考序列比对分析 | 第59-61页 |
| 3.2.3 测序质量分析 | 第61页 |
| 3.2.4 基因表达量分析 | 第61-65页 |
| 3.2.5 表达基因的功能聚类 | 第65-66页 |
| 3.2.6 差异表达基因分析 | 第66-69页 |
| 3.3 绒毡层中表达基因的eFP分析 | 第69-70页 |
| 3.4 绒毡层与其他组织的转录组数据比较分析 | 第70-75页 |
| 3.5 dyt1,tdf1,ams,ms188突变体在绒毡层表达的下调基因分析 | 第75-91页 |
| 3.5.1 DYT1单独调控下游基因的功能分析 | 第77-79页 |
| 3.5.2 TDF1单独调控下游基因的功能分析 | 第79-82页 |
| 3.5.3 AMS单独调控下游基因的功能分析 | 第82-85页 |
| 3.5.4 MS188单独调控下游基因的分析 | 第85-89页 |
| 3.5.5 绒毡层基因调控网络的预测 | 第89-91页 |
| 3.6 小结与讨论 | 第91-97页 |
| 3.6.1 拟南芥绒毡层细胞的LMPC | 第91-92页 |
| 3.6.2 绒毡层表达基因 | 第92页 |
| 3.6.3 绒毡层的组织特异性 | 第92-93页 |
| 3.6.4 泛素/26S蛋白酶体降解途径与绒毡层发育 | 第93-94页 |
| 3.6.5 植物激素与绒毡层发育 | 第94-96页 |
| 3.6.6 绒毡层的基因调控网络 | 第96-97页 |
| 4 百合中层的激光显微切割及转录组测序与分析 | 第97-111页 |
| 4.1 百合与拟南芥花药发育的比较 | 第97-100页 |
| 4.2 RNA-seq测序数据分析 | 第100-106页 |
| 4.2.1 RNA-seq测序数据量及质控结果 | 第100-102页 |
| 4.2.2 转录组数据基因注释 | 第102-106页 |
| 4.3 数据分析与小结 | 第106-111页 |
| 5 AMS与bHLH010,089,091的关系 | 第111-119页 |
| 5.1 bHLH010,089,091作用于绒毡层通路哪个因子的下游? | 第111-112页 |
| 5.2 AMS体外结合bHLH010,089,091的启动子 | 第112-114页 |
| 5.3 AMS体内结合bHLH0089的启动子 | 第114页 |
| 5.4 AMS体外激活调控bHLH010,089,091 | 第114-115页 |
| 5.5 在ams突变体中表达bHLH010,089,091不能恢复绒毡层表型 | 第115-117页 |
| 5.6 小结与讨论 | 第117-119页 |
| 总结与展望 | 第119-121页 |
| 参考文献 | 第121-131页 |
| 附录 | 第131-151页 |
| 致谢 | 第151-153页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第153-155页 |
| 附件 | 第155页 |
