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砂梨体内与高温脱除ASGV相关差异表达基因功能的初步研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第12-13页
引言第13-14页
第一章 文献综述第14-21页
    1.1 ASGV(Apple stem grooving virus,ASGV)的研究进展第14-16页
        1.1.1 ASGV的分类地位和生物学特性第14页
        1.1.2 ASGV的生物学特性第14页
        1.1.3 ASGV的分子生物学特性第14-15页
        1.1.4 ASGV的致病机理第15-16页
    1.2 果树病毒脱除研究进展第16-18页
        1.2.1 茎尖培养脱毒第16页
        1.2.2 热处理脱毒第16页
        1.2.3 热处理结合组织培养脱毒第16-17页
        1.2.4 高温诱发基因沉默脱除病毒第17-18页
    1.3 侵染性克隆技术第18-19页
        1.3.1 侵染性克隆技术第18页
        1.3.2 RNA病毒的cDNA侵染性克隆的构建策略第18-19页
    1.4 选题的目的和意义第19-21页
第二章 热处理对感染ASGV的砂梨离体组织基因表达的影响第21-34页
    2.1 研究材料第21-22页
        2.1.1 供试植株材料第21页
        2.1.2 研究所用试剂第21-22页
    2.2 研究方法第22-26页
        2.2.1 RNA-seq文库构建第22页
        2.2.2 转录测序结果分析第22-24页
        2.2.3 引物设计第24-25页
        2.2.4 植物总RNA提取第25页
        2.2.5 总RNA的DNA消化第25页
        2.2.6 cDNA合成第25页
        2.2.7 qRT-PCR扩增第25页
        2.2.8 qRT-PCR数据分析第25-26页
    2.3 结果和分析第26-32页
        2.3.1 热处理条件下感染ASGV的砂梨组培苗茎尖部位差异表达基因的筛选第26页
        2.3.2 差异表达基因功能分类第26-28页
        2.3.3 差异表达基因的GO功能分析和KEGG代谢通路分析第28-30页
        2.3.4 qPCR验证热处理条件下砂梨差异表达基因转录组测序结果并分析其在砂梨茎尖和基部的表达模式第30-31页
        2.3.5 热处理对梨离体植株不同部位ASGV基因表达量的影响第31-32页
        2.3.6 热处理条件下感染ASGV的砂梨Pp899基因表达量分析第32页
    2.4 小结与讨论第32-34页
第三章 热处理条件下参与沉默途径相关的砂梨基因的克隆及其表达量分析第34-45页
    3.1 研究材料第34-35页
        3.1.1 材料来源第34页
        3.1.2 载体和菌株第34页
        3.1.3 研究所用试剂第34-35页
    3.2 研究方法第35-39页
        3.2.1 引物设计第35-36页
        3.2.2 植物DNA提取第36页
        3.2.3 PCR扩增第36-37页
        3.2.4 PCR产物的回收、克隆及测序第37页
        3.2.5 结果分析所用软件第37页
        3.2.6 qRT-PCR第37页
        3.2.7 沉默载体构建第37-38页
        3.2.8 农杆菌感受态的制备和转化第38页
        3.2.9 农杆菌接种方法第38-39页
    3.3 结果与分析第39-44页
        3.3.1 砂梨沉默相关基因PCR产物电泳检测结果第39-40页
        3.3.2 砂梨沉默相关基因氨基酸水平系统发育树分析第40-41页
        3.3.3 热处理条件下触发梨寄主茎尖部位基因沉默途径的关键基因的表达量分析第41-42页
        3.3.4 基因沉默途径中关键基因功能初步验证第42-44页
    3.4 小结和讨论第44-45页
第四章 ASGV-Js2分离物全基因组侵染性克隆构建及验证第45-53页
    4.1 研究材料第45-46页
        4.1.1 指示植物、菌种和质粒第45页
        4.1.2 研究所用试剂第45-46页
    4.2 研究方法第46-50页
        4.2.1 引物设计第46页
        4.2.2 ASGV-Js2分离物全基因组序列拼接第46-48页
        4.2.3 侵染性克隆构建第48-50页
    4.3 结果与分析第50-52页
        4.3.1 ASGV-Js2侵染性克隆构建与鉴定第50页
        4.3.2 侵染性克隆验证第50-52页
    4.4 小结与讨论第52-53页
第五章 全文结论和展望第53-54页
参考文献第54-58页
附录 常用试剂和配方第58-60页
致谢第60-61页
作者简介第61-62页
附件第62页

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