| 摘要 | 第11-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一章 立项依据 | 第14-20页 |
| 1.1 昆虫前胸腺 | 第14-16页 |
| 1.1.1 昆虫变态发育与蜕皮激素 | 第14-16页 |
| 1.1.2 前胸腺是促前胸腺激素的靶器官 | 第16页 |
| 1.1.3 前胸腺也存在一个外围生物钟? | 第16页 |
| 1.2 转录组研究 | 第16-18页 |
| 1.2.1 转录组 | 第16-17页 |
| 1.2.2 转录组测序在昆虫上的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 简单重复序列SSR | 第18页 |
| 1.4 选材依据 | 第18-19页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第19-20页 |
| 第二章 柞蚕与家蚕前胸腺的转录组比较 | 第20-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-22页 |
| 2.1.1 供试材料和前胸腺解剖 | 第20-21页 |
| 2.1.2 总RNA的提取 | 第21页 |
| 2.1.3 转录组数据的组装 | 第21页 |
| 2.1.4 转录组数据的分析 | 第21-22页 |
| 2.1.5 直系同源基因的筛选 | 第22页 |
| 2.1.6 基因表达量的标准化 | 第22页 |
| 2.2 结果与分析 | 第22-32页 |
| 2.2.1 测序产量统计及质量评价 | 第22-23页 |
| 2.2.2 转录组序列组装结果 | 第23-25页 |
| 2.2.3 Unigene的功能注释 | 第25-26页 |
| 2.2.4 与Nr数据库比对结果 | 第26-27页 |
| 2.2.5 GO功能分类 | 第27-28页 |
| 2.2.6 COG功能分类 | 第28-29页 |
| 2.2.7 KEGG代谢通路分析 | 第29-31页 |
| 2.2.8 柞蚕与家蚕直系同源基因的筛选 | 第31-32页 |
| 2.3 小结与讨论 | 第32-33页 |
| 第三章 前胸腺中生物钟基因的鉴定 | 第33-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第33-36页 |
| 3.1.1 供试材料 | 第33页 |
| 3.1.2 总RNA提取及检测 | 第33页 |
| 3.1.3 第一链cDNA的合成 | 第33-34页 |
| 3.1.4 RT-PCR检测 | 第34-35页 |
| 3.1.5 生物钟基因的鉴定与序列分析 | 第35-36页 |
| 3.1.6 同源比对与系统进化分析 | 第36页 |
| 3.2 结果与分析 | 第36-67页 |
| 3.2.1 前胸腺中生物钟基因的分离 | 第36-65页 |
| 3.2.1.1 cryptochrome 1 基因 | 第36-38页 |
| 3.2.1.2 cryptochrome 2基因 | 第38-41页 |
| 3.2.1.3 period基因 | 第41-44页 |
| 3.2.1.4 timeless基因 | 第44-48页 |
| 3.2.1.5 clock基因 | 第48-50页 |
| 3.2.1.6 cycle基因 | 第50-52页 |
| 3.2.1.7 shaggy基因 | 第52-54页 |
| 3.2.1.8 double-time基因 | 第54-56页 |
| 3.2.1.9 vrille基因 | 第56-58页 |
| 3.2.1.10 PAR-domain protein 1基因 | 第58-60页 |
| 3.2.1.11 slimb基因 | 第60-61页 |
| 3.2.1.12 casein kinase Ⅱ alpha基因 | 第61-63页 |
| 3.2.1.13 casein kinase Ⅱ beta基因 | 第63-65页 |
| 3.2.2 系统进化分析 | 第65页 |
| 3.2.3 RT-PCR分析 | 第65-67页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第67-68页 |
| 第四章 柞蚕转录组数据的SSR信息分析 | 第68-72页 |
| 4.1 方法 | 第68页 |
| 4.1.1 数据来源 | 第68页 |
| 4.1.2 SSR位点信息鉴别 | 第68页 |
| 4.1.3 数据统计 | 第68页 |
| 4.2 结果与分析 | 第68-71页 |
| 4.2.1 柞蚕转录组中SSR的分布 | 第68-69页 |
| 4.2.2 转录组SSR基序重复类型 | 第69-71页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 攻读学位论文期间发表文章 | 第81页 |
