| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第12-28页 |
| 1 遗传图谱构建概述 | 第12-15页 |
| 1.1 遗传图谱构建的理论基础 | 第12页 |
| 1.2 遗传图谱构建方法 | 第12-14页 |
| 1.3 遗传图谱应用 | 第14-15页 |
| 2 单核苷酸多态性（SNP）及其应用 | 第15-18页 |
| 2.1 SNP的起源和突变机制 | 第16页 |
| 2.2 SNP的优势 | 第16-17页 |
| 2.3 SNP的应用 | 第17-18页 |
| 3 简化基因组测序技术概述 | 第18-22页 |
| 3.1 降低代表性测序 | 第20页 |
| 3.2 RAD测序 | 第20-21页 |
| 3.3 改进的RAD测序技术 | 第21页 |
| 3.4 降低覆盖度测序分型 | 第21-22页 |
| 4 鱼类遗传图谱构建研究进展 | 第22-27页 |
| 4.1 模式鱼类遗传图谱研究 | 第22-23页 |
| 4.2 养殖鱼类遗传图谱 | 第23-24页 |
| 4.3 鲇形目鱼类遗传图谱 | 第24-27页 |
| 5 本研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 第2章 南方鲇高通量SNP标记的开发及验证 | 第28-57页 |
| 1 引言 | 第28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-38页 |
| 2.1 作图群体的构建 | 第28-29页 |
| 2.2 基因组DNA提取 | 第29-30页 |
| 2.3 DNA浓度与纯度的检测 | 第30页 |
| 2.4 RAD测序文库的构建及测序 | 第30-33页 |
| 2.5 RAD测序数据的预处理和SNP分型 | 第33-34页 |
| 2.6 Sanger测序验证分型准确性 | 第34-38页 |
| 3 结果 | 第38-52页 |
| 3.1 作图群体的选择与基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
| 3.2 RAD测序及初始数据的过滤 | 第39-43页 |
| 3.3 SNP识别及基因型分型 | 第43-49页 |
| 3.4 Sanger测序验证分型准确性 | 第49-52页 |
| 4 讨论 | 第52-56页 |
| 4.1 利用RAD测序技术开发SNP标记 | 第52-53页 |
| 4.2 Sanger测序验证分型准确性 | 第53-54页 |
| 4.3 利用高通量测序技术进行标记开发的策略 | 第54-56页 |
| 5 小结 | 第56-57页 |
| 第3章 南方鲇高密度遗传图谱的构建及利用JOINMAP 4.0 对遗传图谱的验证 | 第57-81页 |
| 第1节 南方鲇高密度遗传图谱的构建 | 第57-64页 |
| 1 引言 | 第57页 |
| 2 材料与方法 | 第57-58页 |
| 2.1 实验材料 | 第57-58页 |
| 2.2 实验方法 | 第58页 |
| 3 结果 | 第58-59页 |
| 3.1 高密度遗传图谱的构建 | 第58-59页 |
| 3.2 基因组长度估计和图谱覆盖度估计 | 第59页 |
| 4 讨论 | 第59-63页 |
| 5 小结 | 第63-64页 |
| 第2节 利用JOINMAP 4.0 对遗传图谱的验证 | 第64-81页 |
| 1 引言 | 第64页 |
| 2 材料与方法 | 第64-65页 |
| 2.1 实验材料 | 第64页 |
| 2.2 实验方法 | 第64-65页 |
| 3 结果 | 第65-70页 |
| 3.1 经标记筛选后得到的遗传图谱 | 第65-70页 |
| 3.2 用JoinMap作图得到的遗传图谱 | 第70页 |
| 4 讨论 | 第70-73页 |
| 4.1 经标记筛选后的遗传图谱与之前所构遗传图谱的比较 | 第70-71页 |
| 4.2 两种作图软件所构遗传图谱的比较 | 第71-73页 |
| 5 小结 | 第73-81页 |
| 结论与展望 | 第81-83页 |
| 1 研究结论 | 第81页 |
| 2 展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-94页 |
| 缩略表 | 第94-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
| 在校期间科研实践情况 | 第98页 |
