| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 缩略词表 | 第10-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-26页 |
| 1.1 引言 | 第16页 |
| 1.2 对虾早期死亡综合征 | 第16-20页 |
| 1.2.1 对虾早期死亡综合征简介 | 第16-17页 |
| 1.2.2 对虾早期死亡综合征发病的环境因素 | 第17页 |
| 1.2.3 对虾早期死亡综合征病理学特征 | 第17-18页 |
| 1.2.4 对虾早期死亡综合征的发病机理 | 第18-19页 |
| 1.2.5 对虾早期死亡综合征病原菌的检测、鉴定 | 第19-20页 |
| 1.3 对虾早期死亡综合征疑似病原菌——副溶血性弧菌 | 第20-22页 |
| 1.3.1 副溶血性弧菌简介 | 第20-21页 |
| 1.3.2 引起AHPNS的副溶血性弧菌的基因序列分析 | 第21-22页 |
| 1.4 对虾早期死亡综合征的防控研究进展 | 第22-24页 |
| 1.5 对虾早期死亡综合征研究的意义及展望 | 第24-26页 |
| 第二章 对虾早期死亡综合征的病原菌的分离和初步鉴定 | 第26-32页 |
| 2.1 引言 | 第26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-28页 |
| 2.2.1 主要试剂和仪器 | 第26-27页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第27-28页 |
| 2.2.2.1 菌种分离、保藏 | 第27-28页 |
| 2.2.2.2 基因组DNA提取 | 第28页 |
| 2.2.2.3 16S rDNA基因的扩增、测序分析 | 第28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-31页 |
| 2.3.1 菌种分离结果 | 第28-29页 |
| 2.3.2 细菌 16S rDNA基因鉴定结果 | 第29-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 对虾早期死亡综合征病原菌的筛选和鉴定 | 第32-49页 |
| 3.1 引言 | 第32页 |
| 3.2 实验材料 | 第32-33页 |
| 3.2.1 实验菌株 | 第32页 |
| 3.2.2 主要试剂和仪器 | 第32-33页 |
| 3.2.3 试剂配制 | 第33页 |
| 3.3 实验方法 | 第33-38页 |
| 3.3.1 阳性菌株的筛选 | 第33-34页 |
| 3.3.2 阳性菌株常规毒力基因鉴定 | 第34-35页 |
| 3.3.3 阳性菌株的菌种鉴定及系统发育分析 | 第35页 |
| 3.3.4 阳性菌株的ERIC-PCR多样性分析 | 第35-36页 |
| 3.3.5 阳性菌株的质粒提取和酶切鉴定 | 第36页 |
| 3.3.6 阳性菌株的毒素基因扩增和测序 | 第36-37页 |
| 3.3.7 阳性菌株的总RNA提取和毒力基因表达量的测定 | 第37页 |
| 3.3.8 阳性菌株的毒素蛋白鉴定 | 第37-38页 |
| 3.4 结果与分析 | 第38-48页 |
| 3.4.1 阳性菌株筛选和毒力基因鉴定结果 | 第38-39页 |
| 3.4.2 菌种鉴定及系统发育分析结果 | 第39-41页 |
| 3.4.3 阳性菌株ERIC-PCR多样性分析结果 | 第41-42页 |
| 3.4.4 阳性菌株质粒提取和酶切鉴定结果 | 第42-44页 |
| 3.4.5 毒素基因测序结果和多样性分析 | 第44页 |
| 3.4.6 毒力基因pirA表达量测定的结果 | 第44-46页 |
| 3.4.7 毒素蛋白的鉴定结果 | 第46-48页 |
| 3.5 讨论 | 第48页 |
| 3.6 本章小结 | 第48-49页 |
| 第四章 南美白对虾动物模型的构建和攻毒验证实验 | 第49-60页 |
| 4.1 引言 | 第49-50页 |
| 4.2 动物模型的构建 | 第50-52页 |
| 4.2.1 对虾来源 | 第50页 |
| 4.2.2 主要设备、耗材 | 第50-51页 |
| 4.2.2.1 主要设备及性能参数 | 第50-51页 |
| 4.2.2.2 常规耗材 | 第51页 |
| 4.2.2.3 水源 | 第51页 |
| 4.2.3 主要监测指标 | 第51页 |
| 4.2.4 运行效果 | 第51-52页 |
| 4.3 攻毒验证实验 | 第52-54页 |
| 4.3.1 菌株选择 | 第52页 |
| 4.3.2 实验动物的蓄养和预处理 | 第52页 |
| 4.3.3 攻毒实验流程 | 第52-53页 |
| 4.3.3.1 菌液制备 | 第52页 |
| 4.3.3.2 攻毒模式和菌液浓度的选择 | 第52-53页 |
| 4.3.3.3 攻毒实验流程 | 第53页 |
| 4.3.4 肝胰腺组织切片 | 第53-54页 |
| 4.4 结果与分析 | 第54-58页 |
| 4.4.1 攻毒模式和浓度选择结果 | 第54-55页 |
| 4.4.2 阳性菌株攻毒实验结果 | 第55-57页 |
| 4.4.3 肝胰腺组织切片结果 | 第57-58页 |
| 4.5 讨论 | 第58-59页 |
| 4.6 本章小结 | 第59-60页 |
| 第五章 感染温度对两株致病菌株感染能力的影响及比较蛋白质组学分析 | 第60-79页 |
| 5.1 引言 | 第60页 |
| 5.2 材料和方法 | 第60-66页 |
| 5.2.1 菌株选择 | 第60页 |
| 5.2.2 实验设计与实验条件的选择 | 第60-61页 |
| 5.2.3 菌株培养 | 第61页 |
| 5.2.4 细菌RNA的提取和毒力基因表达量的测定 | 第61页 |
| 5.2.5 攻毒实验 | 第61页 |
| 5.2.6 比较蛋白质组学技术路线 | 第61-62页 |
| 5.2.7 蛋白样品提取 | 第62-63页 |
| 5.2.7.1 设备与试剂 | 第62页 |
| 5.2.7.2 蛋白提取步骤 | 第62页 |
| 5.2.7.3 蛋白浓度测定 | 第62-63页 |
| 5.2.8 LC-MS/MS分析 | 第63-66页 |
| 5.2.8.1 设备与耗材 | 第63页 |
| 5.2.8.2 蛋白样品准备 | 第63-64页 |
| 5.2.8.3 质谱分析 | 第64-66页 |
| 5.2.8.4 Maxquant软件分析 | 第66页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第66-78页 |
| 5.3.1 不同温度下毒力基因表达情况 | 第66-67页 |
| 5.3.2 攻毒实验结果 | 第67-69页 |
| 5.3.3 质谱分析结果 | 第69-78页 |
| 5.3.3.1 色谱结果 | 第69-70页 |
| 5.3.3.2 质谱结果 | 第70-71页 |
| 5.3.3.3 蛋白质相对定量分析 | 第71-72页 |
| 5.3.3.4 GO注释分析 | 第72-76页 |
| 5.3.3.5 KEGG功能富集分析 | 第76-78页 |
| 5.4 本章小结 | 第78-79页 |
| 全文总结 | 第79-80页 |
| 本文创新点 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-92页 |
| 攻读博士学位期间的学术成果 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93页 |
