摘要 | 第9-11页 |
ABSTRACT | 第11-13页 |
本论文缩略词表 | 第14-16页 |
第一章 前言 | 第16-36页 |
1 甘蓝雄性不育的类型 | 第16-19页 |
1.1 细胞质雄性不育 | 第17页 |
1.2 细胞核雄性不育 | 第17-18页 |
1.3 隐性核不育 | 第18-19页 |
2 花药发育研究进展 | 第19-29页 |
2.1 花的结构 | 第19-20页 |
2.2 花药发育时间顺序 | 第20页 |
2.3 花药发育主要事件 | 第20-21页 |
2.4 花药发育参与的关键基因 | 第21-25页 |
2.5 绒毡层的重要功能及关键转录因子 | 第25-27页 |
2.6 四分体细胞壁及花粉壁发育相关基因功能及机理 | 第27-29页 |
3 十字花科植物基因组的研究 | 第29-35页 |
3.1 全基因组复制 | 第29-31页 |
3.2 WGT/WGD后基因的偏向性丢失和保留 | 第31-33页 |
3.3 三个亚基因组LF、MF1和MF2之间优势基因表达 | 第33-35页 |
4 本研究的目的与意义 | 第35-36页 |
第二章 甘蓝显性不育基因MS-CD1克隆 | 第36-57页 |
第一节 前言 | 第36页 |
第二节 材料与方法 | 第36-45页 |
1 实验材料 | 第36-37页 |
2 方法 | 第37-45页 |
2.1 植物基因组提取方法 | 第37-38页 |
2.2 植物RNA提取方法 | 第38页 |
2.3 芥蓝基因组重测序开发INDEL标记 | 第38-40页 |
2.4 芥蓝花药转录组测序 | 第40-41页 |
2.5 植物组织直接PCR法 | 第41-42页 |
2.6 INDEL分子标记 | 第42-43页 |
2.7 甘蓝基因结构预测 | 第43页 |
2.8 基因序列结构和进化分析 | 第43-44页 |
2.9 候选区域基因及候选基因同源基因QRT-PCR分析 | 第44-45页 |
第三节 结果和分析 | 第45-56页 |
1 甘蓝显性核不育基因MS-CD1所在候选区域杂合度严重 | 第45页 |
2 SCAR标记定位到甘蓝染色体上 | 第45-47页 |
3 通过重测序获得新的INDEL标记图位克隆候选基因 | 第47-49页 |
4 新基因的预测 | 第49-51页 |
5 候选基因的确定 | 第51-53页 |
5.1 基因组测序 | 第51页 |
5.2 转录本测序 | 第51页 |
5.3 表达量分析 | 第51-53页 |
6 比较基因组学分析 | 第53-54页 |
7 候选基因同源基因表达分析 | 第54-56页 |
第四节 讨论 | 第56-57页 |
第三章 甘蓝显性不育基因MS-CD1花药转录组分析 | 第57-81页 |
第一节 前言 | 第57-58页 |
第二节 材料与方法 | 第58-59页 |
1 实验材料 | 第58页 |
2 方法 | 第58-59页 |
2.1 cDNA文库构建 | 第58-59页 |
2.2 测序结果的分析 | 第59页 |
2.3 转录组差异表达基因QRT-PCR分析 | 第59页 |
第三节 结果和分析 | 第59-79页 |
1 转录组测序及基因表达READS MAPPING到甘蓝基因组上 | 第59-61页 |
2 芥蓝MS-CD1与拟南芥不育基因比较 | 第61-65页 |
3 可育、不育花蕾差异表达转录本 | 第65-68页 |
4 MS-CD1阻碍花粉母细胞壁的降解 | 第68-76页 |
5 MS-CD1在花粉壁发育过程中起到关键作用 | 第76-77页 |
6 QRT-PCR验证 | 第77-78页 |
7 MS-CD1蛋白阻碍条件下差异表达基因及其同源基因的表达 | 第78-79页 |
8 甘蓝三个亚基因组(LF,MF1和MF2)上差异表达基因的偏分布 | 第79页 |
第四节 讨论 | 第79-81页 |
第四章 利用四种雄性不育甘蓝表达谱鉴定绒毡层特异表达基因 | 第81-105页 |
第一节 前言 | 第81-82页 |
第二节 材料与方法 | 第82-83页 |
1 实验材料 | 第82页 |
2 方法 | 第82-83页 |
2.1 实验数据的获得与处理 | 第82-83页 |
2.2 拟南芥转录组数据的获得 | 第83页 |
第三节 结果与分析 | 第83-103页 |
1 四种甘蓝雄性不育类型细胞学缺陷 | 第83-86页 |
1.1 四种甘蓝雄性不育类型的光学镜观察 | 第83-84页 |
1.2 四种甘蓝雄性不育类型的电镜观察 | 第84-86页 |
1.3 花药发育顺序打断模型 | 第86页 |
2 芯片分析 | 第86-87页 |
3 RT-PCR验证 | 第87-89页 |
4 四种甘蓝雄性不育材料绒毡层特异表达基因的鉴定 | 第89-90页 |
5 绒毡层特异基因表达顺序 | 第90-98页 |
6 四种雄性不育关键基因的功能分析 | 第98-101页 |
7 四种雄性不育花药发育调控网络的探索 | 第101-103页 |
第四节 讨论 | 第103-105页 |
参考文献 | 第105-122页 |
攻博期间参与发表及投稿论文 | 第122-123页 |
致谢 | 第123页 |