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甘蓝显性核不育基因Ms-cd1的克隆与绒毡层特异表达基因的鉴定

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
本论文缩略词表第14-16页
第一章 前言第16-36页
    1 甘蓝雄性不育的类型第16-19页
        1.1 细胞质雄性不育第17页
        1.2 细胞核雄性不育第17-18页
        1.3 隐性核不育第18-19页
    2 花药发育研究进展第19-29页
        2.1 花的结构第19-20页
        2.2 花药发育时间顺序第20页
        2.3 花药发育主要事件第20-21页
        2.4 花药发育参与的关键基因第21-25页
        2.5 绒毡层的重要功能及关键转录因子第25-27页
        2.6 四分体细胞壁及花粉壁发育相关基因功能及机理第27-29页
    3 十字花科植物基因组的研究第29-35页
        3.1 全基因组复制第29-31页
        3.2 WGT/WGD后基因的偏向性丢失和保留第31-33页
        3.3 三个亚基因组LF、MF1和MF2之间优势基因表达第33-35页
    4 本研究的目的与意义第35-36页
第二章 甘蓝显性不育基因MS-CD1克隆第36-57页
    第一节 前言第36页
    第二节 材料与方法第36-45页
        1 实验材料第36-37页
        2 方法第37-45页
            2.1 植物基因组提取方法第37-38页
            2.2 植物RNA提取方法第38页
            2.3 芥蓝基因组重测序开发INDEL标记第38-40页
            2.4 芥蓝花药转录组测序第40-41页
            2.5 植物组织直接PCR法第41-42页
            2.6 INDEL分子标记第42-43页
            2.7 甘蓝基因结构预测第43页
            2.8 基因序列结构和进化分析第43-44页
            2.9 候选区域基因及候选基因同源基因QRT-PCR分析第44-45页
    第三节 结果和分析第45-56页
        1 甘蓝显性核不育基因MS-CD1所在候选区域杂合度严重第45页
        2 SCAR标记定位到甘蓝染色体上第45-47页
        3 通过重测序获得新的INDEL标记图位克隆候选基因第47-49页
        4 新基因的预测第49-51页
        5 候选基因的确定第51-53页
            5.1 基因组测序第51页
            5.2 转录本测序第51页
            5.3 表达量分析第51-53页
        6 比较基因组学分析第53-54页
        7 候选基因同源基因表达分析第54-56页
    第四节 讨论第56-57页
第三章 甘蓝显性不育基因MS-CD1花药转录组分析第57-81页
    第一节 前言第57-58页
    第二节 材料与方法第58-59页
        1 实验材料第58页
        2 方法第58-59页
            2.1 cDNA文库构建第58-59页
            2.2 测序结果的分析第59页
            2.3 转录组差异表达基因QRT-PCR分析第59页
    第三节 结果和分析第59-79页
        1 转录组测序及基因表达READS MAPPING到甘蓝基因组上第59-61页
        2 芥蓝MS-CD1与拟南芥不育基因比较第61-65页
        3 可育、不育花蕾差异表达转录本第65-68页
        4 MS-CD1阻碍花粉母细胞壁的降解第68-76页
        5 MS-CD1在花粉壁发育过程中起到关键作用第76-77页
        6 QRT-PCR验证第77-78页
        7 MS-CD1蛋白阻碍条件下差异表达基因及其同源基因的表达第78-79页
        8 甘蓝三个亚基因组(LF,MF1和MF2)上差异表达基因的偏分布第79页
    第四节 讨论第79-81页
第四章 利用四种雄性不育甘蓝表达谱鉴定绒毡层特异表达基因第81-105页
    第一节 前言第81-82页
    第二节 材料与方法第82-83页
        1 实验材料第82页
        2 方法第82-83页
            2.1 实验数据的获得与处理第82-83页
            2.2 拟南芥转录组数据的获得第83页
    第三节 结果与分析第83-103页
        1 四种甘蓝雄性不育类型细胞学缺陷第83-86页
            1.1 四种甘蓝雄性不育类型的光学镜观察第83-84页
            1.2 四种甘蓝雄性不育类型的电镜观察第84-86页
            1.3 花药发育顺序打断模型第86页
        2 芯片分析第86-87页
        3 RT-PCR验证第87-89页
        4 四种甘蓝雄性不育材料绒毡层特异表达基因的鉴定第89-90页
        5 绒毡层特异基因表达顺序第90-98页
        6 四种雄性不育关键基因的功能分析第98-101页
        7 四种雄性不育花药发育调控网络的探索第101-103页
    第四节 讨论第103-105页
参考文献第105-122页
攻博期间参与发表及投稿论文第122-123页
致谢第123页

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