| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 前言 | 第8-15页 |
| 1 植物抗病机制概述 | 第8-9页 |
| 2 NB-LRR基因家族研究概述 | 第9-12页 |
| ·NB-LRR抗病基因的结构与功能 | 第9-10页 |
| ·NB-LRR蛋白与病原物效应分子间的识别机制 | 第10-12页 |
| 3 拟南芥NB-LRR基因家族概述 | 第12页 |
| 4 植物DNA甲基化研究概述 | 第12-14页 |
| ·DNA甲基化在植物生长发育及逆境胁迫中的作用 | 第13页 |
| ·影响植物DNA甲基化的关键基因 | 第13-14页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| 材料和方法 | 第15-18页 |
| 1 拟南芥NB-LRR家族编码基因序列及染色体分布 | 第15页 |
| 2 拟南芥NB-LRR家族系统进化树的构建 | 第15页 |
| 3 拟南芥不同基因型全基因组单碱基甲基化测序序列分析 | 第15-16页 |
| ·重亚硫酸盐测序原始数据的处理 | 第15页 |
| ·重亚硫酸盐测序数据与参考基因组的比对 | 第15-16页 |
| 4 拟南芥NB-LRR家族编码基因的甲基化信息分析 | 第16页 |
| ·拟南芥NB-LRR基因家族成员不同结构区域相关信息的获取 | 第16页 |
| ·甲基化水平的计算 | 第16页 |
| ·甲基化位点数目及甲基化密度的计算 | 第16页 |
| 5 拟南芥不同基因型转录组测序数据分析 | 第16-17页 |
| ·转录组测序数据的组装 | 第17页 |
| ·基因表达量的标准化 | 第17页 |
| ·基因表达差异的显著性分析 | 第17页 |
| 6 拟南芥NB-LRR家族编码基因典型成员甲基化特性分析 | 第17-18页 |
| 结果与分析 | 第18-70页 |
| 1 拟南芥NB-LRR家族编码基因及启动子区的位置 | 第18-22页 |
| 2 拟南芥NB-LRR家族系统进化分析 | 第22-26页 |
| 3 拟南芥NB-LRR编码基因启动子区及基因转录区的甲基化类型组成 | 第26-36页 |
| 4 拟南芥NB-LRR编码基因启动子区及基因转录区甲基化分布特征 | 第36-62页 |
| 5 拟南芥NB-LRR编码基因不同结构区的甲基化分布特征 | 第62-63页 |
| 6 拟南芥NB-LRR家族编码基因的甲基化水平与基因表达的关系 | 第63-67页 |
| 7 拟南芥NB-LRR家族基因个别成员在不同基因型中的甲基化水平及与转录水平关系 | 第67-70页 |
| 结论与讨论 | 第70-72页 |
| 1 拟南芥NB-LRR家族编码基因绝大部分成员的启动子区和转录区存在DNA甲基化现象 | 第70页 |
| 2 拟南芥NB-LRR家族基因启动子区5’端较3’端甲基化程度高 | 第70页 |
| 3 拟南芥NB-LRR家族基因转录区较启动子区甲基化程度高 | 第70页 |
| 4 拟南芥NB-LRR家族基因不同结构区的平均甲基化水平不同 | 第70-71页 |
| 5 拟南芥NB-LRR家族部分成员很可能受DNA甲基化表观遗传调控 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
