| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 1 前言 | 第10-18页 |
| ·稀有变异关联性研究的发展及现状 | 第10-12页 |
| ·稀有变异影响疾病表型的作用模式假设 | 第12-13页 |
| ·稀有变异关联研究统计方法研究现状 | 第13-17页 |
| ·本研究主要内容和研究意义 | 第17-18页 |
| 2 模型原理与方法 | 第18-36页 |
| ·本研究数据结构 | 第18页 |
| ·置换检验（permutation test） | 第18-19页 |
| ·稀有变异关联性研究方法 | 第19-36页 |
| ·多元与折叠合并法（Combined Multivariate and Collapsing , CMC） | 第19-20页 |
| ·权重加和检验（weight Sum test，w-Sum） | 第20-22页 |
| ·加和检验(SUM test) | 第22-23页 |
| ·基于边际得分统计量的改良方法：SSU 和 SSUw | 第23-24页 |
| ·数据自适应加和检验(data-adaptive Sum test,aSum) | 第24-26页 |
| ·C-α检验方法 | 第26-28页 |
| ·序列核关联性检验（Sequence Kernel Association Test,SKAT） | 第28-31页 |
| ·岭回归（Ridge Regression，RR） | 第31-36页 |
| 3 模拟研究 | 第36-44页 |
| ·参数设置 | 第36-39页 |
| ·模拟数据集的产生 | 第39-42页 |
| ·评价指标 | 第42页 |
| ·统计软件 | 第42-44页 |
| 4 结果 | 第44-64页 |
| ·样本量为 250 时各类方法的一类错误和效能 | 第44-50页 |
| ·各类方法的一类错误 | 第44页 |
| ·各类方法的效能 | 第44-50页 |
| ·样本量为 500 时各类方法的一类错误和效能 | 第50-55页 |
| ·各类方法的一类错误 | 第50页 |
| ·各类方法的效能 | 第50-55页 |
| ·样本量为 1000 时各类方法的一类错误和效能 | 第55-60页 |
| ·各类方法的一类错误 | 第55页 |
| ·各类方法的效能 | 第55-60页 |
| ·样本量对各种方法的影响 | 第60-64页 |
| ·对各种方法一类错误的影响 | 第60页 |
| ·对各种方法效能的影响 | 第60-64页 |
| 5 讨论 | 第64-72页 |
| ·关联变异效应大小和作用方向的影响 | 第65页 |
| ·连锁不平衡状态的影响 | 第65-66页 |
| ·非关联变异数量的影响 | 第66-67页 |
| ·关联变异权重的影响 | 第67页 |
| ·样本量的影响 | 第67-72页 |
| 6 主要结论和应用建议 | 第72-74页 |
| 7 本研究的创新点与局限性 | 第74-76页 |
| ·本研究创新之处 | 第74页 |
| ·本研究不足之处及进一步研究方向 | 第74-76页 |
| 附录 1 aSum、SKAT-linear、SKAT-wlinear、SSU、SSUw、Sum 以及 C-α方法的 AssotesteR 包调用和运算 R 程序 | 第76-78页 |
| 附录 2 RR 方法的 RVtests 包调用和运算 R 程序 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-96页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文 | 第96-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
