| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-47页 |
| 1 假交替单胞菌概述 | 第18-23页 |
| ·假交替单胞菌的一般特征 | 第18-21页 |
| ·金丽假交替单胞菌的一般特征 | 第21页 |
| ·假交替单胞菌的生态学研究意义 | 第21-23页 |
| ·水产养殖病害的防治 | 第21-22页 |
| ·形成生物被膜防止污损的发生 | 第22页 |
| ·赤潮的防治 | 第22-23页 |
| 2 假交替单胞菌产生的生物活性物质 | 第23-29页 |
| ·小分子活性物质 | 第23-27页 |
| ·卤化的小分子活性物质 | 第23-25页 |
| ·非卤化的小分子活性物质 | 第25-27页 |
| ·大分子活性物质 | 第27-29页 |
| 3 假交替单胞菌的全基因组测序及分析 | 第29-45页 |
| ·被囊假交替单胞菌 D2 的全基因组分析 | 第30-34页 |
| ·生物活性物质的合成 | 第31页 |
| ·对表面的粘附及生物被膜的形成 | 第31-32页 |
| ·对环境压力的感知 | 第32页 |
| ·营养的获取 | 第32-33页 |
| ·对多种真核生物表面多聚物的降解 | 第33-34页 |
| ·游海假交替单胞菌 TAC125 的全基因组分析 | 第34-40页 |
| ·基因组结构 | 第35-37页 |
| ·蛋白质组的一般特征 | 第37页 |
| ·代谢特征 | 第37-38页 |
| ·对氧的反应 | 第38-40页 |
| ·假交替单胞菌 SM9913 的全基因组分析 | 第40-45页 |
| ·基因组的一般特征 | 第41-42页 |
| ·转座元件 | 第42-44页 |
| ·对活性氧的敏感性 | 第44页 |
| ·对药物及重金属的抵抗能力 | 第44页 |
| ·鞭毛和运动性 | 第44-45页 |
| 4 本论文的研究目的和意义 | 第45-47页 |
| 第二章 金丽假交替单胞菌 JG1 抑菌活性检测及抑菌组分分析 | 第47-57页 |
| 1 实验材料与仪器 | 第47-49页 |
| ·菌株 | 第47-48页 |
| ·培养基 | 第48-49页 |
| ·主要仪器 | 第49页 |
| 2 实验方法 | 第49-50页 |
| ·菌株 JG1 抑菌谱的测定 | 第49页 |
| ·有机溶剂萃取法对菌株 JG1 抑菌活性组分的分析 | 第49-50页 |
| ·不同培养时间对菌株 JG1 胞外抑菌蛋白的影响 | 第50页 |
| ·不同培养时间 JG1 胞外产物的制备 | 第50页 |
| ·不同培养时间 JG1 胞外产物的抑菌活性检测 | 第50页 |
| 3 实验结果 | 第50-56页 |
| ·菌株 JG1 对不同菌株的抑菌谱 | 第50-51页 |
| ·菌株 JG1 抑菌活性组分分析 | 第51-55页 |
| ·不同培养时间对菌株 JG1 胞外抑菌蛋白的影响 | 第55-56页 |
| 4 讨论 | 第56-57页 |
| 第三章 金丽假交替单胞菌 JG1 胞外抑菌蛋白的分离纯化、序列分析及重组表达研究 | 第57-81页 |
| 1 实验材料及仪器 | 第57-59页 |
| ·菌株及质粒 | 第57-59页 |
| ·培养基 | 第59页 |
| ·主要仪器 | 第59页 |
| 2 实验方法 | 第59-66页 |
| ·菌株 JG1 胞外产物的提取 | 第59页 |
| ·分步硫酸铵沉淀法对菌株 JG1 的胞外蛋白的初步纯化 | 第59-60页 |
| ·分步硫酸铵沉淀法 | 第59-60页 |
| ·Bradford 法测定蛋白含量 | 第60页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）检测 | 第60页 |
| ·各部分胞外产物抑菌活性检测 | 第60页 |
| ·菌株 JG1 胞外蛋白的 SDS-PAGE 及胶内活性检测 | 第60-61页 |
| ·胞外蛋白的 SDS-PAGE 检测 | 第60-61页 |
| ·胶内活性检测 | 第61页 |
| ·电洗脱法对菌株 JG1 抑菌蛋白的纯化及活性检测 | 第61-63页 |
| ·电洗脱仪 Model 422 Electro-Eluter (Bio-Rad)的组装 | 第61-62页 |
| ·电洗脱法对菌株 JG1 抑菌蛋白的纯化 | 第62-63页 |
| ·纯化后抑菌蛋白的 SDS-PAGE 检测及胶内活性检测 | 第63页 |
| ·对菌株 JG1 抑菌蛋白的 De novo 测序 | 第63页 |
| ·菌株 JG1 抑菌蛋白的序列分析 | 第63-64页 |
| ·菌株 JG1 抑菌蛋白在大肠杆菌 BL21 中的重组表达 | 第64-65页 |
| ·菌株 JG1 抑菌蛋白的克隆及 pET 系列表达质粒的构建 | 第64页 |
| ·表达质粒 pBAD/Myc-HisB 及 pRSFDuet-1 对抑菌蛋白 PfaP 的重组表达 | 第64-65页 |
| ·菌株 JG1 抑菌蛋白的诱导表达、活性检测及 SDS-PAGE | 第65页 |
| ·重组表达抑菌蛋白的纯化、活性检测及 SDS-PAGE | 第65页 |
| ·过氧化氢酶对菌株 JG1 抑菌蛋白活性的影响 | 第65-66页 |
| 3 实验结果 | 第66-77页 |
| ·分步硫酸铵沉淀法对菌株 JG1 的胞外蛋白的初步纯化 | 第66-67页 |
| ·菌株 JG1 胞外蛋白的 SDS-PAGE 及胶内活性检测 | 第67-68页 |
| ·纯化后抑菌蛋白的 SDS-PAGE 及胶内活性检测 | 第68-69页 |
| ·抑菌蛋白的 De novo 测序及序列分析 | 第69-72页 |
| ·菌株 JG1 抑菌蛋白在大肠杆菌 BL21 中的重组表达 | 第72-76页 |
| ·抑菌蛋白 PfaP 的重组表达及活性检测 | 第72-75页 |
| ·重组表达的抑菌蛋白的纯化、活性检测及 SDS-PAGE | 第75-76页 |
| ·过氧化氢酶对菌株 JG1 抑菌蛋白活性的影响 | 第76-77页 |
| 4 讨论 | 第77-81页 |
| ·抑菌蛋白 PfaP 的 L-氨基酸氧化酶活性预测 | 第77-79页 |
| ·抑菌蛋白 PfaP 的外源重组表达 | 第79-81页 |
| 第四章 金丽假交替单胞菌 JG1 抑菌小分子化合物的分离纯化及性质研究 | 第81-93页 |
| 1 实验材料及仪器 | 第81-82页 |
| ·菌株 | 第81页 |
| ·培养基 | 第81-82页 |
| ·主要仪器 | 第82页 |
| 2 实验方法 | 第82-85页 |
| ·菌株 JG1 发酵液的制备及乙酸乙酯萃取法对小分子化合物的粗提 | 第82页 |
| ·小分子化合物的分离纯化及结构测定 | 第82-83页 |
| ·小分子化合物抑菌活性的测定 | 第83-84页 |
| ·TLC 板生物自显影法 | 第83页 |
| ·微量液体法 | 第83-84页 |
| ·TLC 板生物自显影法对化合物 1-5 抑菌谱的测定 | 第84页 |
| ·小分子化合物最小抑菌浓度（MIC）的测定 | 第84-85页 |
| ·纸片法 | 第84页 |
| ·微量稀释法 | 第84-85页 |
| 3 实验结果 | 第85-90页 |
| ·抑菌小分子化合物的结构测定 | 第85-87页 |
| ·初步分离的 12 组分的抑菌活性检测 | 第85页 |
| ·十种小分子化合物的结构 | 第85-87页 |
| ·抑菌小分子化合物的活性检测 | 第87-90页 |
| ·小分子化合物抑菌活性检测 | 第87页 |
| ·微量液体法对化合物 1-5 抑菌活性的检测 | 第87-89页 |
| ·化合物 1-5 抑菌谱的测定 | 第89-90页 |
| ·小分子化合物最小抑菌浓度的测定 | 第90页 |
| ·纸片法对小分子化合物最小抑菌浓度的测定 | 第90页 |
| ·微量稀释法对小分子化合物最小抑菌浓度的测定 | 第90页 |
| 4 讨论 | 第90-93页 |
| 第五章 金丽假交替单胞菌 JG1 全基因组测序及分析 | 第93-116页 |
| 1 实验材料及仪器 | 第93-94页 |
| ·菌株 | 第93-94页 |
| ·培养基 | 第94页 |
| ·主要仪器 | 第94页 |
| 2 实验方法 | 第94-97页 |
| ·菌株 JG1 基因组 DNA 的提取 | 第94页 |
| ·菌株 JG1 基因组 DNA 的质量检测 | 第94页 |
| ·菌株 JG1 基因组测序、组装及基因功能预测 | 第94-95页 |
| ·菌株 JG1 基因组序列分析 | 第95页 |
| ·菌株 JG1 密度感应系统信号分子（AHL）的检测 | 第95-96页 |
| ·双层平板法 | 第95-96页 |
| ·琼脂扩散法 | 第96页 |
| ·菌株 JG1 密度感应淬灭活性的检测 | 第96-97页 |
| ·液体法 | 第96-97页 |
| ·平板法 | 第97页 |
| 3 实验结果与讨论 | 第97-114页 |
| ·菌株 JG1 基因组 DNA 的提取及检测 | 第97-98页 |
| ·菌株 JG1 基因组的一般特征及与其他假交替单胞菌基因组的比较 | 第98-104页 |
| ·参与抑菌物质生物合成的相关基因 | 第104-107页 |
| ·抑菌蛋白 | 第104页 |
| ·对羟基苯甲酸的生物合成 | 第104页 |
| ·反式桂皮酸的生物合成 | 第104-105页 |
| ·6-溴吲哚-3-乙酸的生物合成 | 第105-106页 |
| ·几丁质酶 | 第106-107页 |
| ·次级代谢产物相关基因 | 第107页 |
| ·菌株 JG1 密度感应系统及淬灭活性 | 第107-110页 |
| ·菌株 JG1 密度感应信号分子检测 | 第107-109页 |
| ·密度感应系统相关基因 | 第109页 |
| ·菌株 JG1 的密度感应淬灭活性及相关基因 | 第109-110页 |
| ·磷的获取及环境压力的适应 | 第110-111页 |
| ·磷的获取相关基因 | 第110页 |
| ·适应环境压力的相关基因 | 第110-111页 |
| ·运动性及分泌特征 | 第111-114页 |
| ·运动性相关基因 | 第111-113页 |
| ·分泌特性 | 第113-114页 |
| ·抗药性及转运系统 | 第114页 |
| 4 小结 | 第114-116页 |
| 第六章 结论 | 第116-119页 |
| 1 全文总结 | 第116-118页 |
| 2 主要创新点 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-131页 |
| 附录 溶液配方 | 第131-133页 |
| 致谢 | 第133-134页 |
| 个人简历 | 第134页 |
| 已发表的学术成果 | 第134-136页 |
