| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-32页 |
| 1 浙江红山茶及其相关研究进展 | 第14-16页 |
| ·浙江红山茶的生物学特性及利用 | 第14页 |
| ·浙江红山茶的研究现状 | 第14-15页 |
| ·油茶的分子生物学研究 | 第15-16页 |
| 2.测序技术的发展及在植物育种上的应用 | 第16-21页 |
| ·测序技术的发展 | 第16-18页 |
| ·第一代测序技术 | 第16页 |
| ·第二代测序技术 | 第16-18页 |
| ·第三代测序技术 | 第18页 |
| ·测序技术在植物育种中的应用 | 第18-21页 |
| ·基因组变异和分子标记辅助选择 | 第18-19页 |
| ·天然群体关联作图 | 第19页 |
| ·远缘杂交和基因渐渗 | 第19-20页 |
| ·基因表达谱分析 | 第20页 |
| ·群体遗传学和进化生物学 | 第20页 |
| ·全基因组和细胞器基因组测序 | 第20-21页 |
| ·表观遗传修饰 | 第21页 |
| 3. 植物类黄酮的生物合成及调控 | 第21-27页 |
| ·类黄酮的生物合成 | 第21-25页 |
| ·类黄酮合成的调控 | 第25-27页 |
| 4. 植物脂肪酸合成及其累积模式 | 第27-31页 |
| ·植物脂肪酸的合成 | 第27-29页 |
| ·脂肪酸碳链的去饱和 | 第29-30页 |
| ·脂肪酸累积模式研究 | 第30-31页 |
| 5. 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二章 浙江红山茶的转录组测序分析 | 第32-45页 |
| 1 引言 | 第32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-36页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·实验试剂 | 第32-33页 |
| ·实验仪器 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-36页 |
| ·浙江红山茶总 RNA 提取 | 第33-34页 |
| ·RNA 的纯化 | 第34页 |
| ·RNA 质量检测 | 第34页 |
| ·cDNA 的合成 | 第34-35页 |
| ·cDNA 的纯化 | 第35页 |
| ·转录组测序 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-43页 |
| ·浙江红山茶 RNA 的提取 | 第36页 |
| ·cDNA 的合成与检测 | 第36页 |
| ·序列的处理与拼接 | 第36-37页 |
| ·功能注释和 GO 分类 | 第37-39页 |
| ·代谢通路分析 | 第39-41页 |
| ·转录因子预测 | 第41-43页 |
| 4 讨论 | 第43-45页 |
| 第三章 浙江红山茶花青素合成相关基因的克隆及表达分析 | 第45-76页 |
| 1 引言 | 第45页 |
| 2 材料和方法 | 第45-56页 |
| ·实验材料 | 第45-46页 |
| ·实验试剂 | 第46页 |
| ·实验仪器 | 第46页 |
| ·实验方法 | 第46-56页 |
| ·RNA 提取和纯化 | 第46页 |
| ·cDNA 的合成 | 第46-47页 |
| ·引物的设计 | 第47-48页 |
| ·3'RACE 巢式 PCR | 第48-49页 |
| ·反转录反应 | 第48页 |
| ·3'RACE Outer PCR | 第48-49页 |
| ·3'RACE Inner PCR | 第49页 |
| ·5'RACE 巢式 PCR | 第49-52页 |
| ·去磷酸化反应 | 第49-50页 |
| ·去帽子反应 | 第50页 |
| ·5'Adaptor 的连接 | 第50-51页 |
| ·反转录反应 | 第51页 |
| ·5'RACE Outer PCR | 第51-52页 |
| ·5'RACE Inner PCR | 第52页 |
| ·目的片段的回收和纯化 | 第52-53页 |
| ·片段与载体的连接 | 第53页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第53页 |
| ·连接产物的转化 | 第53-54页 |
| ·阳性克隆的鉴定 | 第54页 |
| ·序列分析 | 第54页 |
| ·基因的表达分析 | 第54-56页 |
| ·RNA 反转成 cDNA | 第54-55页 |
| ·实时定量 RT-PCR | 第55-56页 |
| 3 结果与分析 | 第56-74页 |
| ·浙江红山茶 PAL，CHI，F3H，DFR，ANS 和 UFGT 等基因的克隆 | 第56-57页 |
| ·浙江红山茶 PAL，CHI，F3H，DFR，ANS，UFGT 等基因的生物信息学分析 | 第57-72页 |
| ·苯丙氨酸解氨酶 PAL 基因的克隆与分析 | 第57-59页 |
| ·查尔酮异构酶 CHI 基因的克隆与分析 | 第59-60页 |
| ·黄烷酮羟化酶 F3H 基因的克隆与分析 | 第60-63页 |
| ·二氢黄酮醇 4-还原酶 DFR 的克隆与分析 | 第63-65页 |
| ·花青素合成酶 ANS 的克隆与分析 | 第65-68页 |
| ·类黄酮糖基转移酶 UFGT 的克隆与分析 | 第68-69页 |
| ·肉桂酸脱羧酶 C4H 的克隆与分析 | 第69-72页 |
| ·查尔酮合酶 CHS 的克隆与分析 | 第72页 |
| ·浙江红山茶花青素合成相关基因的表达分析 | 第72-74页 |
| ·花青素合成相关基因在花发育阶段的表达分析 | 第72-74页 |
| ·花青素合成相关基因的组织表达特性分析 | 第74页 |
| 4 讨论 | 第74-76页 |
| 第四章 浙江红山茶脂肪酸合成相关基因的克隆及表达分析 | 第76-96页 |
| 1 引言 | 第76-77页 |
| 2 材料和方法 | 第77-79页 |
| ·实验材料 | 第77页 |
| ·实验试剂 | 第77页 |
| ·仪器设备 | 第77页 |
| ·实验方法 | 第77-79页 |
| ·RNA 的提取 | 第77-78页 |
| ·RNA 的纯化和检测 | 第78页 |
| ·RACE 技术进行全长 cDNA 的克隆 | 第78页 |
| ·cDNA 的合成 | 第78页 |
| ·实时定量 PCR | 第78页 |
| ·生物信息学分析 | 第78-79页 |
| 3 结果与分析 | 第79-94页 |
| ·浙江红山茶脂肪酸合成途径相关基因的克隆和序列分析 | 第79-90页 |
| ·乙酰-CoA 羧化酶 ACC 的克隆与分析 | 第79-82页 |
| ·酰基载体蛋白 ACP 基因的克隆与分析 | 第82页 |
| ·乙酰-CoA：ACP 转酰酶 ACAT 的克隆与分析 | 第82-83页 |
| ·β-酮脂酰 ACP 合酶 KAS 的克隆与分析 | 第83-84页 |
| ·β-酮脂酰 ACP 还原酶 KR 的克隆与分析 | 第84-85页 |
| ·β-羟脂酰-ACP 脱水酶 HD 的克隆与分析 | 第85-86页 |
| ·烯脂酰-ACP 还原酶 ER 的克隆与分析 | 第86-87页 |
| ·脂酰-脂去饱和酶的克隆与分析 | 第87-88页 |
| ·脂酰-ACP 去饱和酶的克隆与分析 | 第88-89页 |
| ·β-酮脂酰-CoA 合酶 KCS 的克隆与分析 | 第89-90页 |
| ·浙江红山茶脂肪酸合成途径相关基因的表达分析 | 第90-94页 |
| ·BC 和 BCCP 在种子发育过程中的表达分析 | 第90页 |
| ·ACP 在种子发育过程中的表达分析 | 第90-91页 |
| ·ACAT 在种子发育过程中的表达分析 | 第91页 |
| ·KAS 在种子发育过程中的表达分析 | 第91-92页 |
| ·KR 在种子发育过程中的表达分析 | 第92页 |
| ·HD 在种子发育过程中的表达分析 | 第92-93页 |
| ·ER 在种子发育过程中的表达分析 | 第93页 |
| ·KCS 在种子发育过程中的表达分析 | 第93-94页 |
| ·SAD 和 FAD2 在种子发育过程中的表达分析 | 第94页 |
| 4 讨论 | 第94-96页 |
| 第五章 浙江红山茶种子发育过程中的脂肪酸累积模式研究 | 第96-101页 |
| 1 引言 | 第96页 |
| 2 材料与方法 | 第96-97页 |
| ·实验材料 | 第96页 |
| ·实验试剂 | 第96页 |
| ·实验仪器 | 第96页 |
| ·实验方法 | 第96-97页 |
| ·数据分析 | 第97页 |
| 3 结果与分析 | 第97-100页 |
| ·种子发育过程中脂肪酸总量的变化 | 第97页 |
| ·种子发育过程中脂肪酸相对含量的变化 | 第97-98页 |
| ·种子发育过程中脂肪酸绝对量的变化 | 第98-99页 |
| ·种子发育全程中脂肪酸的相关分析和主成份分析 | 第99-100页 |
| 4 讨论 | 第100-101页 |
| 第六章 主要结论和展望 | 第101-104页 |
| 一、本研究的主要结论 | 第101-102页 |
| 二 主要创新点 | 第102-103页 |
| 三 存在的问题及展望 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-113页 |
