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拟南芥盐敏感突变体的筛选鉴定及蛋白酶体β5亚基与植物抗氧化性的相关性研究

中文摘要第1-14页
 第一章 拟南芥盐敏感突变体的筛选鉴定第10-11页
 第二章 蛋白酶体 5 亚基与植物抗氧化性的相关性研究第11-14页
Abstract第14-18页
 Chapter 1: Isolation and Genetic Analysis of Arabidopsis Salt-Sensitive-Mutants第14-15页
 Chapter 2: The Proteasome 5 Subunit Relate to Plant Oxidative Stress Tolerance第15-18页
缩略词第18-20页
第一部分 文献综述第20-44页
 1 盐胁迫对植物的伤害及耐盐机制第20-25页
   ·盐胁迫对植物的伤害第20-22页
     ·渗透胁迫第20-21页
     ·离子毒害及营养失衡第21页
     ·氧化胁迫及代谢紊乱第21-22页
   ·盐胁迫下植物的耐盐机制第22-25页
     ·盐胁迫的应答反应第22-23页
     ·渗透调节机制第23页
     ·植物细胞的离子均衡第23-24页
     ·对活性氧及氧化代谢产物的清除第24-25页
 2 植物对氧化胁迫的应答及对氧化胁迫产物的清除第25-27页
   ·植物对氧化胁迫的应答第25页
   ·盐胁迫下植物活性氧的清除第25-26页
     ·非酶促抗氧化系统第25页
     ·酶促抗氧化系统第25-26页
     ·抗氧化酶类与植物胁迫耐受性第26页
   ·植物对蛋白氧化胁迫产物的清除第26-27页
     ·自体吞噬空泡对氧化蛋白的清除第27页
     ·蛋白酶体对氧化蛋白的清除第27页
 3 拟南芥盐敏感突变体的研究进展第27-33页
   ·突变体库技术以及对研究基因功能的作用第28-30页
     ·突变体库的筛选对研究基因功能的作用第28页
     ·突变体库的种类和特点第28-30页
   ·SOS 途径相关突变体的研究进展第30-32页
     ·SOS 途径突变体的研究进展第30-31页
     ·SOS 途径突变体对揭示盐胁迫调节机制的作用第31-32页
     ·SOS 途径突变体揭示了氧化胁迫途径与盐胁迫途径的交叉关系第32页
   ·其他盐敏感突变体的研究进展第32-33页
 4 蛋白酶体研究进展第33-42页
   ·26S 蛋白酶体的结构及亚基的功能第34-37页
     ·核心颗粒的结构第34-35页
     ·核心蛋白酶体的酶活性第35页
     ·调节亚基的组成第35页
     ·调节亚基的功能第35-36页
     ·蛋白酶体的多样性第36-37页
     ·蛋白酶体抑制剂第37页
   ·泛素化蛋白的降解途径第37-39页
     ·泛素及启动酶系统第37-38页
     ·依赖泛素化的蛋白降解过程第38-39页
   ·不依赖泛素的降解途径第39-40页
     ·20S蛋白酶体对氧化蛋白质的降解第39页
     ·重度氧化蛋白对蛋白酶体活性的抑制第39-40页
   ·20S 蛋白酶体的组装第40-42页
     ·20S 蛋白酶体的组装过程第40页
     ·亚基间的相互调节机制第40-41页
     ·5 亚基对蛋白酶体组装的促进作用第41页
     ·对潜在的促组装作用因子的分离第41-42页
   ·蛋白酶体的细胞定位第42页
 5 本实验的意义第42-44页
   ·筛选拟南芥盐敏感突变体的意义第42-43页
   ·研究蛋白酶体 5 亚基与抗氧化胁迫相关性实验的意义第43-44页
第二部分 实验研究第44-107页
 第一章 拟南芥盐敏感突变体的筛选与鉴定第44-83页
  一 实验材料和仪器第44-47页
   1 植物材料与培养条件第44-45页
   2 菌种及质粒第45页
   3 酶及化学试剂第45页
   4 主要仪器设备第45-46页
   5 培养基、常用生化及分子生物学试剂第46页
   ·拟南芥生长培养基第46页
   ·常用生化及分子生物学试剂第46页
   6 引物序列第46-47页
   7 分析软件第47页
  二 实验方法第47-57页
   1 基本分子生物学实验技术第47-51页
   ·大肠杆菌感受态的制备第47页
   ·大肠杆菌感受态的转化第47-48页
   ·质粒的提取第48页
   ·质粒的酶切和连接第48-49页
     ·质粒的酶切第48页
     ·酶切片段的回收第48-49页
     ·酶切片段的连接第49页
   ·菌种的保藏第49页
   ·PCR第49页
   ·植物基因组 DNA 提取第49-51页
     ·植物基因组 DNA 的小量提取第49-50页
     ·CTAB 法大量提取植物基因组 DNA第50-51页
   2 筛选盐敏感突变体的实验方法第51-53页
   ·拟南芥盐敏感突变体的筛选第51-52页
     ·拟南芥盐敏感突变体筛选压力及筛选指标的确立第51页
     ·拟南芥盐敏感突变体的筛选方法第51-52页
   ·拟南芥盐敏感突变体的回交试验及遗传分析第52-53页
     ·回交试验的目的及技术路线第52-53页
     ·杂交方法第53页
     ·回交检测方法及遗传分析第53页
   3 突变体基因定位及遗传分析第53-55页
   ·突变体 T-DNA 插入位点的鉴定第53-54页
     ·质粒拯救法第53-54页
     ·检测突变表型与 T-DNA 插入的相关性第54页
     ·PCR 鉴定回交后代的 T-DNA 插入情况第54页
   ·图位克隆第54-55页
     ·作图群体的构建第54-55页
     ·突变基因的染色体初步定位第55页
     ·重测序技术和 SSLP 标记的开发第55页
   4 植物生理学与生物化学类实验方法第55-57页
   ·胁迫条件种子萌发率测定第55-56页
   ·培养基模拟胁迫处理方法第56页
   ·培养介质中胁迫处理第56页
   ·Na+、K+离子含量的测定方法第56页
   ·根扫描电镜样品的制备和观察第56页
   ·叶片大小及表皮细胞大小的测量第56-57页
     ·指甲油印迹法的改进第56页
     ·叶片面积测量第56-57页
     ·叶片下表皮细胞面积的测定第57页
  三 实验结果与分析第57-79页
   1 激活标签突变体库耐盐突变体及其他突变体的筛选第57页
   ·耐盐突变体的筛选结果第57页
   ·植株矮小突变体的筛选结果第57页
   2 拟南芥盐敏感突变体的筛选结果第57-59页
   ·拟南芥盐敏感突变体筛选压力及筛选指标的确立第57-58页
   ·拟南芥盐敏感突变体的筛选结果第58页
   ·突变体的显/隐性鉴定及遗传分析第58-59页
   3 dds1 突变位点的鉴定第59-66页
   ·质粒拯救法获得 T-DNA 插入的基因组旁邻序列及相关性分析第59-63页
     ·通过质粒拯救法获得 T-DNA 插入的基因组旁邻序列第59-61页
     ·PCR 检测突变表型与 T-DNA 插入的相关性第61-62页
     ·PCR 验证突变表型与 T-DNA 插入的相关性第62-63页
   ·突变位点的图位克隆第63-65页
     ·作图群体的构建及突变基因连锁分子标记的确定第63-64页
     ·突变基因的初步定位第64-65页
   ·dds1 全基因组重测序及分子标记开发第65-66页
     ·dds1 全基因组重测序第65页
     ·dds1 全基因组重测序结果分析第65-66页
     ·突变基因的进一步染色体初步定位第66页
   4 dds1 在正常生长条件下的生长表型分析第66-70页
   ·dds1 在正常生长条件下叶片的生长表型分析第66-68页
   ·dds1 叶下表皮细胞大小与野生型的差异第68-69页
   ·dds1 在正常生长条件下根的生长表型分析第69页
   ·IAA、KT 对 dds1 突变体根伸长的影响第69页
   ·dds1 中 PIN3::GFP 报告基因表达情况第69-70页
   5 dds1 的盐敏感表型分析第70-74页
   ·dds1 在盐胁迫条件下的种子萌发和生长情况第70-71页
     ·dds1 在盐胁迫条件下的种子萌发情况第70页
     ·盐胁迫对 dds1 根伸长的影响第70-71页
   ·150 mM NaCl 胁迫对 dds1 突变体根尖发育的影响第71-72页
   ·盐处理下 pCycB1;1::GUS 在 dds1 中的表达变化第72页
   ·盐胁迫对 dds1 叶片及叶表皮细胞大小的影响第72-74页
     ·盐胁迫对 dds1 叶片大小的影响第72-73页
     ·盐胁迫对 dds1 叶表皮细胞大小的影响第73-74页
   6 dds1 与 sos1 的对比第74-76页
   ·dds1 与 sos1 对不同阳离子胁迫表型差异第74-75页
   ·盐胁迫对 dds1 植株中 Na+、K+离子含量变化的影响第75页
   ·dds1 与 sos1 的双杂交突变体的表型分析第75-76页
   7 其他胁迫因素对 dds1 生长的影响第76-79页
   ·甘露醇处理下 dds1 的种子萌发情况和根生长情况第76-77页
     ·甘露醇处理下 dds1 的种子萌发情况第76页
     ·dds1 在含甘露醇培养基上根的生长情况第76-77页
   ·dds1 在氧化胁迫培养基上的生长情况第77-78页
     ·dds1 在含甲基紫精培养基上的萌发情况第77页
     ·dds1 在含 H2O2培养基上根的生长情况第77-78页
   ·dds1 在含 ABA 培养基上的生长情况第78-79页
  四 讨论第79-83页
 第二章 蛋白酶体 5 亚基与植物抗氧化性的相关性研究第83-107页
  一 实验材料和仪器第83-85页
   1 植物材料与培养条件第83页
   2 菌种及质粒第83页
   3 酶及化学试剂第83页
   4 主要仪器设备第83页
   5 培养基、常用生化及分子生物学试剂第83页
   ·拟南芥生长培养基第83页
   ·常用生化及分子生物学试剂第83页
   6 引物序列第83-85页
   7 分析软件第85页
  二 实验方法第85-89页
   1 基本分子生物学实验技术第85-87页
   ·大肠杆菌感受态的制备第85页
   ·大肠杆菌感受态的转化第85页
   ·质粒的提取第85页
   ·质粒的酶切和连接第85页
     ·质粒的酶切第85页
     ·酶切片段的回收第85页
     ·酶切片段的连接第85页
   ·菌种的保藏第85页
   ·PCR第85页
   ·植物基因组 DNA 的小量提取第85页
   ·Trizol 法提取植物总 RNA第85-86页
   ·RNA 反转录反应第86-87页
   ·实时定量 PCR第87页
   2 植物表达载体的农杆菌转化、农杆菌质粒的提取与鉴定第87-88页
   3 渗透法转化拟南芥第88页
   ·拟南芥的生长第88页
   ·菌液的准备第88页
   ·渗透转化第88页
   4 转基因植株的筛选及遗传分析第88-89页
   ·拟南芥转基因植株的筛选及遗传分析第88页
   ·转基因植株的遗传分析第88-89页
   5 胁迫处理实验方法第89页
   ·胁迫条件下种子萌发率测定第89页
   ·培养基模拟胁迫处理方法第89页
   ·培养介质中胁迫处理第89页
  三 实验结果与分析第89-104页
   1 蛋白酶体 5 亚基蛋白序列分析及基因的克隆第89-93页
   ·AtPBE 蛋白 Clustalx 分析第89-91页
   ·AtPBE 蛋白系统谱系分析第91-92页
   ·AtPBE2 基因的克隆第92-93页
   2 植物表达载体的构建以及酶切验证第93-94页
   ·AtPBE2 基因过量表达载体的构建及酶切验证第93-94页
   ·AtPBE2 基因 GFP 定位载体的构建及酶切验证第94页
   3 植物表达载体的农杆菌转化及 PCR 验证第94-95页
   4 拟南芥的遗传转化与筛选第95页
   5 转基因拟南芥植株的分子鉴定第95-100页
   ·转基因拟南芥植株的 PCR 鉴定第95-97页
     ·过量表达 AtPBE2 拟南芥植株的 PCR 鉴定第95-96页
     ·AtPBE2-GFP 融合表达拟南芥植株的 PCR 鉴定第96-97页
   ·过量表达株系的基因表达水平鉴定第97-100页
     ·拟南芥总 RNA 的提取第97页
     ·AtPBE2 过量表达株系的 RT-PCR 鉴定第97-98页
     ·AtPBE2 过量表达株系的 Real-Time PCR 鉴定第98-100页
   6 SALK T-DNA 插入突变体的获得第100-102页
   ·AtPBE 突变体的分子鉴定第100页
   ·AtPBE 突变体基因表达量鉴定第100-101页
   ·双突变体的构建第101-102页
   7 Real-Time PCR鉴定过量表达和突变体株系中蛋白酶体其他亚基表达量的变化第102-103页
   8 AtPBE2-GFP 融合蛋白的定位分析第103页
   9 AtPBE 过量表达和突变体拟南芥的表型分析第103-104页
   ·AtPBE 过量表达和突变体拟南芥在正常生长条件下的生长情况第103页
   ·MG132 处理对 AtPBE 过量表达株系种子萌发的影响第103-104页
   ·AtPBE 过量表达和突变体拟南芥在不同胁迫条件下的生长情况第104页
   ·AtPBE 过量表达和突变体拟南芥成苗期的胁迫处理情况第104页
  四 讨论第104-107页
图版第107-116页
附录第116-118页
参考文献第118-128页
攻读博士期间发表的论文第128-129页
致谢第129-130页

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