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阿维菌素和安丝菌素生物合成相关基因的功能研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-13页
符号说明(Abbreviations)第13-17页
第一篇 阿维菌素ABC转运蛋白AvtAB及细胞色素P450 单加氧酶AveE的功能研究第17-117页
 第一章 文献综述第17-30页
   ·阿维菌素生物合成的研究进展第17-22页
     ·阿维菌素的化学结构及应用第17-18页
     ·阿维菌素生物合成相关基因的功能分析第18-20页
     ·AveE的功能及呋喃环形成机制推测第20-21页
     ·本研究的目的和内容第21-22页
   ·放线菌中ABC转运蛋白的研究进展第22-30页
     ·ABC转运蛋白的分类及结构第23-24页
     ·ABC转运蛋白的作用机制第24-26页
     ·放线菌中ABC内运蛋白的研究进展第26-27页
     ·放线菌中ABC外排蛋白与次级代谢产物的跨膜转运第27-29页
     ·本研究的目的和内容第29-30页
 第二章 实验材料和方法第30-54页
   ·实验材料第30-41页
     ·菌株第30-31页
     ·质粒第31-34页
     ·引物第34-36页
     ·培养基和化学试剂第36-41页
   ·实验方法第41-54页
     ·大肠杆菌的培养和保存第41页
     ·链霉菌的培养和保存第41页
     ·大肠杆菌质粒DNA的提取第41-42页
     ·大肠杆菌质粒DNA的少量快速提取及检测(快检)第42页
     ·链霉菌总DNA的少量快速提取第42页
     ·链霉菌质粒的提取第42-43页
     ·大肠杆菌化学转化(氯化钙法)感受态的制备和转化第43页
     ·高压电穿孔法感受态的制备和转化第43-44页
     ·DNA片段的回收(Omega公司试剂盒)第44页
     ·载体的去磷酸化第44-45页
     ·两亲本介导的质粒DNA在大肠杆菌与链霉菌之间的跨属接合转移第45页
     ·基因中断菌株的筛选和验证第45-46页
     ·链霉菌总RNA的提取第46-47页
     ·阿维链霉菌的发酵培养第47页
     ·发酵产物的提取第47-48页
     ·高效液相色谱法检测发酵产物第48页
     ·HPLC法测定阿维菌素B1a标准曲线第48页
     ·YMG液体发酵分离并定量胞内胞外阿维菌素第48-49页
     ·化合物(AveE底物)的分离及结构鉴定第49-50页
     ·突变株发酵喂养实验第50页
     ·AveE在大肠杆菌中的表达及纯化第50-51页
     ·蛋白的SDS-PAGE分析第51-52页
     ·Bradford法测定蛋白浓度第52页
     ·AveE酶促反应体系及检测条件第52-53页
     ·CDA生物活性测定第53页
     ·生物信息学分析第53-54页
 第三章 阿维菌素生物合成基因簇上游ABC药物转运蛋白基因avtAB的功能研究第54-80页
   ·前言第54-56页
   ·结果与分析第56-76页
     ·avtAB基因置换突变株QJF8、QJF9 的构建第56-68页
     ·avtAB基因超量表达突变株 8165/pJTU3470 的构建第68-71页
     ·8165/pJTU3470 中阿维菌素结构基因、调控基因和avtAB转录水平检测第71-76页
   ·小结与讨论第76-80页
 第四章 阿维菌素工业高产菌株的构建第80-88页
   ·前言第80-81页
   ·结果与分析第81-86页
     ·阿维菌素B1a工业高产菌株 3-115/pJTU3470 的构建第81-84页
     ·工业菌株阿维菌素胞内胞外产量变化分析第84-86页
   ·小结与讨论第86-88页
 第五章 AvtAB的底物专一性第88-95页
   ·前言第88-91页
   ·结果与分析第91-94页
     ·AvtAB对寡霉素外排的影响第91页
     ·AvtAB对CDA外排的影响第91-94页
   ·小结与讨论第94-95页
 第六章 阿维菌素生物合成基因簇中细胞色素P450 单加氧酶基因aveE的功能研究第95-117页
   ·前言第95-97页
   ·结果与分析第97-114页
     ·aveE基因缺失突变株的构建第97-104页
     ·aveE回补突变株和meiE异源回补突变株的构建第104-111页
     ·AveE体外活性检测第111-114页
   ·小结与讨论第114-117页
第二篇 安丝菌素双键异构现象的研究第117-176页
 第七章 文献综述第117-123页
   ·安丝菌素的生物合成第117-118页
   ·I型聚酮合酶的催化机制第118-120页
   ·DH结构域与双键异构现象第120-122页
   ·本研究的目的和内容第122-123页
 第八章 实验材料与方法第123-135页
   ·实验材料第123-130页
     ·菌株第123-124页
     ·质粒第124-128页
     ·引物第128-129页
     ·培养基和化学试剂第129-130页
   ·实验方法第130-135页
     ·染色体定点突变的构建第130-131页
     ·珍贵束丝放线菌的发酵及其产物的LC-MS检测第131-132页
     ·安丝菌素模块二蛋白表达纯化第132页
     ·甲基氢肉桂酸半胱胺硫脂的合成及核磁鉴定第132-133页
     ·安丝菌素模块二与甲基氢肉桂酸半胱胺硫脂的体外反应第133-135页
 第九章 安丝菌素双键异构现象的研究第135-173页
   ·前言第135-136页
   ·结果与分析第136-170页
     ·安丝菌素模块 2 模块 3 DH结构域的定点突变第136-145页
     ·安丝菌素模块 2 后加载红霉素TE突变株的构建第145-151页
     ·安丝菌素模块 2 体外表达及与模拟底物的共反应第151-170页
   ·小结与讨论第170-173页
 第十章 总结与展望第173-176页
   ·阿维菌素ABC转运蛋白AvtAB及细胞色素P450 单加氧酶AveE功能研究的总结与展望第173-174页
   ·安丝菌素双键异构现象研究的总结与展望第174-176页
参考文献第176-183页
致谢第183-185页
学术论文和科研成果第185-187页

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