| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 本文所用缩略词中英文对照 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-40页 |
| 1 草酸产生菌相关研究进展 | 第15-26页 |
| ·草酸是草酸产生菌的普遍且关键的致病因子 | 第15-19页 |
| ·草酸产生菌与植物的互作及信号转导 | 第19-23页 |
| ·植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP) | 第19-21页 |
| ·草酸产生菌的信号转导 | 第21-23页 |
| ·草酸的两条主要降解途径及其研究进展 | 第23-24页 |
| ·草酸可以用来筛选作物抗病突变体，研究作物的抗病机制 | 第24-26页 |
| 2 T-DNA 标签技术在植物功能基因组研究中的作用 | 第26-32页 |
| ·农杆菌介导的T-DNA 插入 | 第27页 |
| ·T-DNA 插入突变的几种方法 | 第27-30页 |
| ·插入失活突变(LOSS OF FUNCTION) | 第27-28页 |
| ·激活标签(ACTIVATION TAGGING) | 第28-29页 |
| ·化学诱导表达标签（CHEMICAL INDUCIBLE GENE EXPRESSION TAG） | 第29页 |
| ·基因陷阱(GENE TRAP) | 第29-30页 |
| ·T-DNA 标签技术在植物功能基因组研究中的作用 | 第30-31页 |
| ·T-DNA 插入片段侧翼序列的分离 | 第30-31页 |
| ·T-DNA 标签技术在植物功能基因组研究中的作用 | 第31页 |
| ·转座子标签 | 第31-32页 |
| 3 基因芯片在植物抗病机制研究上的应用 | 第32-39页 |
| ·基因芯片概述 | 第32-33页 |
| ·基因芯片在植物－病原物互作中的作用 | 第33-35页 |
| ·MICRORNA 芯片在植物功能基因组学研究中的应用 | 第35-39页 |
| ·MICRORNA 的生物合成与功能 | 第35-37页 |
| ·MICRORNA 识别与鉴定 | 第37-38页 |
| ·MICRORNA 研究展望 | 第38-39页 |
| 4 本课题的研究目的、研究意义及主要研究内容 | 第39-40页 |
| 第二章 拟南芥草酸不敏感突变体的筛选与分析 | 第40-73页 |
| 1 材料与方法 | 第40-56页 |
| ·拟南芥突变体库及病原菌菌种 | 第40页 |
| ·培养基 | 第40-41页 |
| ·克隆载体,转化菌株及生化试剂 | 第41-42页 |
| ·拟南芥的种植 | 第42页 |
| ·突变体的筛选方法 | 第42页 |
| ·草酸抗性增强突变体的分子分析 | 第42-55页 |
| ·拟南芥基因组DNA 的提取 | 第42-43页 |
| ·突变体T-DNA 插入侧翼序列的获得 | 第43-46页 |
| ·RT-PCR 验证突变体T-DNA 插入位点上下游基因的表达情况 | 第46-49页 |
| ·上调基因的过表达载体的构建 | 第49-55页 |
| ·At5g10450 的SALK T-DNA 插入缺失突变体草酸抗性分析 | 第55页 |
| ·草酸抗性增强突变体的简单遗传分析 | 第55页 |
| ·突变体与野生型Col-4 的杂交及卡纳抗性分析 | 第55页 |
| ·Npt II 的扩增 | 第55页 |
| ·核盘菌的接种方法 | 第55-56页 |
| ·核盘菌离体叶片接种法 | 第55-56页 |
| ·核盘菌活体叶片接种法 | 第56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-69页 |
| ·草酸不敏感突变体筛选方法的建立 | 第56-57页 |
| ·草酸不敏感突变体的筛选 | 第57页 |
| ·草酸不敏感突变体的T-DNA 插入位点分析 | 第57-59页 |
| ·D33 突变体的T-DNA 插入位点上下游基因的表达情况 | 第59-60页 |
| ·过表达载体的构建 | 第60-67页 |
| ·AT2G39690 过表达载体的构建 | 第60-62页 |
| ·AT2G39700 过表达载体的构建 | 第62-64页 |
| ·AT2G39720 过表达载体的构建 | 第64-66页 |
| ·过表达载体BAR 基因的验证 | 第66页 |
| ·拟南芥转基因阳性植株的获得 | 第66-67页 |
| ·AT5G10450 基因的功能缺失突变体的草酸抗性分析 | 第67-68页 |
| ·草酸抗性突变体的遗传分析 | 第68页 |
| ·草酸抗性突变体的KM 抗性 | 第68页 |
| ·NPT II 的扩增 | 第68页 |
| ·草酸抗性突变体的菌核病抗性分析 | 第68-69页 |
| 3 讨论 | 第69-71页 |
| ·草酸作为选择压力用于筛选抗性增强突变体是切实可行的 | 第70页 |
| ·植物对草酸的抗性与对草酸产生菌的抗性相关 | 第70-71页 |
| 4 小结 | 第71-73页 |
| 第三章 草酸胁迫下拟南芥基因表达谱分析 | 第73-92页 |
| 1 材料与方法 | 第73-77页 |
| ·拟南芥芯片与探针 | 第73-74页 |
| ·拟南芥RNA 的提取、纯化与检测 | 第74页 |
| ·样品RNA 的荧光标记（晶芯(?) cRNA 扩增标记试剂盒） | 第74-75页 |
| ·杂交清洗与芯片扫描 | 第75页 |
| ·芯片图像的采集与数据分析 | 第75-76页 |
| ·差异基因的生物信息学分析 | 第76页 |
| ·差异基因的半定量RT－PCR 验证 | 第76-77页 |
| 2 结果与分析 | 第77-92页 |
| ·RNA 检测 | 第77页 |
| ·芯片杂交结果 | 第77-78页 |
| ·草酸胁迫下的拟南芥基因表达谱分析 | 第78-91页 |
| ·JA 信号相关基因表达分析 | 第79-81页 |
| ·乙烯信号相关基因表达分析 | 第81-82页 |
| ·SA 信号相关基因表达分析 | 第82-83页 |
| ·苯丙烷代谢途径相关基因表达分析 | 第83-85页 |
| ·WRKY 转录因子家族的表达谱 | 第85-86页 |
| ·细胞色素P450 家族的表达谱 | 第86-88页 |
| ·其它基因（家族）在表达谱芯片的表达情况 | 第88-90页 |
| ·半定量RT－PCR 验证 | 第90-91页 |
| 3 小结 | 第91-92页 |
| 第四章 草酸胁迫下拟南芥MICRORNA 表达谱分析 | 第92-97页 |
| 1 材料与方法 | 第92-93页 |
| ·拟南芥miRNA 芯片与探针 | 第92页 |
| ·拟南芥RNA 的提取、纯化与检测 | 第92页 |
| ·miRNA 的分离 | 第92页 |
| ·miRNA 样品的荧光标记 | 第92页 |
| ·杂交、清洗与扫描 | 第92-93页 |
| ·数据分析 | 第93页 |
| ·差异基因的生物信息学分析 | 第93页 |
| 2 结果与分析 | 第93-97页 |
| ·RNA 检测 | 第93-94页 |
| ·芯片杂交结果 | 第94-95页 |
| ·草酸胁迫下的拟南芥MIRNA 差异表达谱分析 | 第95-97页 |
| 第五章 草酸降解途径中两种关键酶的克隆与分析 | 第97-108页 |
| 1 材料与方法 | 第97-100页 |
| ·材料 | 第97页 |
| ·菌种和质粒载体 | 第97页 |
| ·植物实验材料 | 第97页 |
| ·酶和化学试剂 | 第97页 |
| ·实验方法 | 第97-100页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第97-98页 |
| ·枯草芽孢杆菌YVRK 的克隆及其植物表达载体的构建 | 第98-99页 |
| ·大麦草酸氧化OXO 的克隆及其植物表达载体的构建 | 第99页 |
| ·拟南芥的转化及转基因植株的筛选 | 第99页 |
| ·YVRK 转基因植株的验证 | 第99-100页 |
| ·抗性植株的核盘菌致病性分析 | 第100页 |
| ·统计分析 | 第100页 |
| 2 结果与分析 | 第100-108页 |
| ·枯草芽孢杆菌YVRK 的克隆及其植物表达载体的构建 | 第100-103页 |
| ·大麦OXO 的克隆及其植物表达载体的构建 | 第103-105页 |
| ·转基因植株的获得及检测 | 第105页 |
| ·转基因植株的菌核病抗性分析 | 第105-106页 |
| ·讨论 | 第106-108页 |
| 全文结论和创新点 | 第108-109页 |
| REFERENCES(参考文献) | 第109-123页 |
| 攻读博士期间参与的科研项目及发表文章 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
