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几种鼢鼠mtDNAD-loop区序列多态性与系统发育关系的研究

摘要第1-4页
Summary第4-8页
1 前言第8-10页
2 文献综述第10-25页
   ·线粒体DNA 的基本特征第10-14页
     ·啮齿动物线粒体DNA 结构第11页
     ·线粒体DNA 的遗传特点第11-13页
     ·啮齿动物mtDNA D-loop 的多态性第13-14页
   ·啮齿目动物分子系统学的研究方法第14-22页
     ·mtDNA 多态性的研究方法第16-19页
     ·数据处理第19页
     ·线粒体DNA(mtDNA)序列分析的数学模型第19-22页
   ·动物MTDNA 多态分析在啮齿动物遗传结构研究中的应用第22-25页
     ·啮齿动物mtDNA 与限制内切酶图谱的研究第22-23页
     ·物种的起源和分化第23页
     ·种内和种间的系统关系第23-25页
3 材料与方法第25-32页
   ·实验材料第25-26页
     ·材料来源第25页
     ·主要仪器、试剂和溶液的配制第25-26页
   ·实验方法第26-27页
     ·全基因组DNA 提取和检测第26-27页
   ·目标DNA 片段的扩增和测序第27-31页
     ·目标DNA 片段的扩增第27-31页
     ·线粒体DNA D-loop 的测序第31页
   ·数据统计分析第31-32页
     ·测序序列的拼接第31页
     ·系统发育关系的建立第31-32页
4 结果分析第32-44页
   ·MTDNA D-LOOP 区全序列的PCR 扩增和测序第32页
   ·鼢鼠线粒体DNA D-LOOP 区序列多态性第32-37页
     ·碱基组成第32-33页
     ·鼢鼠序列核苷酸多态位点变异类型第33-34页
     ·鼢鼠序列的核苷酸位点变异第34-37页
     ·鼢鼠线粒体DNA D-Loop 区单倍型分析第37页
   ·群体的系统发生关系第37-40页
     ·群间的Fst 值与基因流第37-38页
     ·群间的净遗传距离与分歧时间第38-40页
   ·鼢鼠系统发育树的构建第40-44页
     ·Kimura 双参数法构建的NJ、UPGMA 系统发生树第40-41页
     ·系统发育树可靠性评估第41-44页
5 讨论第44-49页
   ·关于鼢鼠亚科动物MTDNA D-LOOP 区的引物第44页
   ·鼢鼠MTDNA D-LOOP 区序列多态性第44-45页
   ·4 种鼢鼠的遗传分化第45-47页
   ·鼢鼠的起源与分类第47-49页
6 结论第49-50页
致谢第50-51页
参考文献第51-57页
个人简介第57-58页
导师简介第58-59页

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