摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-11页 |
1 引言 | 第11-20页 |
·结构生物学概述 | 第11-12页 |
·表观遗传学概述 | 第12-13页 |
·植物表观遗传学概述 | 第13-14页 |
·DNA 甲基化 | 第13页 |
·组蛋白共价修饰 | 第13页 |
·RNA 介导的基因沉默 | 第13页 |
·副突变 | 第13-14页 |
·染色质重塑 | 第14页 |
·研究植物表观遗传学的意义 | 第14页 |
·TUDOR 结构域的研究背景和意义 | 第14-16页 |
·研究现状 | 第16页 |
·本课题研究的内容和目标 | 第16-20页 |
·SPIN 基因的亚克隆:原核表达载体的构建、筛选、鉴定 | 第17页 |
·构建成功的SPIN基因原核表达载体的转化和表达 | 第17页 |
·SPINDLIN1 的纯化 | 第17-18页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶条件筛选与优化 | 第18页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射数据收集与结构解析 | 第18页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结构信息 | 第18页 |
·生物大分子相互作用实验BIA-CORE | 第18-19页 |
·课题小结 | 第19-20页 |
2 实验材料与方法 | 第20-32页 |
·实验材料 | 第20-21页 |
·SPIN 基因的表达载体 | 第20页 |
·分别用于载体扩增和基因表达的宿主菌 | 第20页 |
·用于纯化与结晶实验的蛋白质材料 | 第20-21页 |
·用于衍射实验的晶体 | 第21页 |
·实验试剂与药品 | 第21-22页 |
·SPIN 基因的亚克隆构建 | 第21页 |
·SPINDLIN1 的表达 | 第21页 |
·SPINDLIN1 的纯化 | 第21-22页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验 | 第22页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验 | 第22页 |
·BIA-CORE实验 | 第22页 |
·实验设备与器材 | 第22-24页 |
·SPIN 基因的亚克隆 | 第22页 |
·SPINDLIN1 的表达 | 第22-23页 |
·SPINDLIN1 的纯化 | 第23页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验 | 第23页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验 | 第23-24页 |
·BIA-CORE实验 | 第24页 |
·实验方法 | 第24-32页 |
·SPIN 基因从 PET30A载体构建到PET28A/SUMO 载体的亚克隆 | 第24-26页 |
·SPINDLIN1 在大肠杆菌 BL21(DE3)菌株中的试表达 | 第26-27页 |
·SPINDLIN1 的大规模表达 | 第27页 |
·SPINDLIN1 的纯化 | 第27-29页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验 | 第29-31页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验 | 第31页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射数据收集 | 第31-32页 |
·结构解析 | 第32页 |
·BIA-CORE实验 | 第32页 |
3 实验结果与分析 | 第32-43页 |
·SPINDLIN1 的纯化 | 第32-36页 |
·PET28A | 第32-33页 |
·PGEX-2T-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的配体 GST 亲和层析 | 第33页 |
·PET28A/SUMO-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的阴离子交换层析 | 第33-34页 |
·PGEX-2T-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的阴离子交换层析 | 第34-35页 |
·分离掉纯化标签的SPINDLIN1 的凝胶过滤层析 | 第35页 |
·纯化后得到用于的结晶SPINDLIN1(稀释5 倍) | 第35-36页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体初筛的结晶现象 | 第36-38页 |
·SPINDLIN1 分别与两种底物形成的复合物的结晶现象 | 第36-37页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物优化后的结晶现象 | 第37-38页 |
·以H3K4ME3 为底物的复合物晶体的衍射图样 | 第38-39页 |
·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体结构的解析结果 | 第39-42页 |
·全貌 | 第39页 |
·SPINDLIN1 与组蛋白多肽 H3K4ME3 相互作用的微环境 | 第39-42页 |
·BIA-CORE 实验结果证明二者作用力非常稳定,特异性非常高 | 第42-43页 |
4 讨论 | 第43-45页 |
·SPINDLIN1 的性质与功能 | 第43-44页 |
·复合物晶体的性质 | 第44页 |
·复合物晶体的衍射 | 第44页 |
·复合物晶体结构的不完整性 | 第44页 |
·本课题与植物表观遗传学研究的关系 | 第44-45页 |
5 结论 | 第45-47页 |
·重组目的蛋白的获得 | 第45页 |
·目的蛋白的纯化策略 | 第45页 |
·适于衍射的晶体的获得 | 第45页 |
·晶体结构的解析 | 第45页 |
·SPINDLIN1 与组蛋白多肽 H3K4ME3 相互作用的方式 | 第45-46页 |
·生物大分子的相互作用 | 第46-47页 |
致谢 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-51页 |
作者简介 | 第51页 |