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纺锤体相关蛋白spindlin1与甲基化组蛋白复合物的结构研究

摘要第1-4页
Abstract第4-11页
1 引言第11-20页
   ·结构生物学概述第11-12页
   ·表观遗传学概述第12-13页
   ·植物表观遗传学概述第13-14页
     ·DNA 甲基化第13页
     ·组蛋白共价修饰第13页
     ·RNA 介导的基因沉默第13页
     ·副突变第13-14页
     ·染色质重塑第14页
     ·研究植物表观遗传学的意义第14页
   ·TUDOR 结构域的研究背景和意义第14-16页
   ·研究现状第16页
   ·本课题研究的内容和目标第16-20页
     ·SPIN 基因的亚克隆:原核表达载体的构建、筛选、鉴定第17页
     ·构建成功的SPIN基因原核表达载体的转化和表达第17页
     ·SPINDLIN1 的纯化第17-18页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶条件筛选与优化第18页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射数据收集与结构解析第18页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结构信息第18页
     ·生物大分子相互作用实验BIA-CORE第18-19页
     ·课题小结第19-20页
2 实验材料与方法第20-32页
   ·实验材料第20-21页
     ·SPIN 基因的表达载体第20页
     ·分别用于载体扩增和基因表达的宿主菌第20页
     ·用于纯化与结晶实验的蛋白质材料第20-21页
     ·用于衍射实验的晶体第21页
   ·实验试剂与药品第21-22页
     ·SPIN 基因的亚克隆构建第21页
     ·SPINDLIN1 的表达第21页
     ·SPINDLIN1 的纯化第21-22页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验第22页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验第22页
     ·BIA-CORE实验第22页
   ·实验设备与器材第22-24页
     ·SPIN 基因的亚克隆第22页
     ·SPINDLIN1 的表达第22-23页
     ·SPINDLIN1 的纯化第23页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验第23页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验第23-24页
     ·BIA-CORE实验第24页
   ·实验方法第24-32页
     ·SPIN 基因从 PET30A载体构建到PET28A/SUMO 载体的亚克隆第24-26页
     ·SPINDLIN1 在大肠杆菌 BL21(DE3)菌株中的试表达第26-27页
     ·SPINDLIN1 的大规模表达第27页
     ·SPINDLIN1 的纯化第27-29页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物的结晶实验第29-31页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射实验第31页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体的衍射数据收集第31-32页
     ·结构解析第32页
     ·BIA-CORE实验第32页
3 实验结果与分析第32-43页
   ·SPINDLIN1 的纯化第32-36页
     ·PET28A第32-33页
     ·PGEX-2T-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的配体 GST 亲和层析第33页
     ·PET28A/SUMO-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的阴离子交换层析第33-34页
     ·PGEX-2T-SPIN载体表达的SPINDLIN1 的阴离子交换层析第34-35页
     ·分离掉纯化标签的SPINDLIN1 的凝胶过滤层析第35页
     ·纯化后得到用于的结晶SPINDLIN1(稀释5 倍)第35-36页
   ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体初筛的结晶现象第36-38页
     ·SPINDLIN1 分别与两种底物形成的复合物的结晶现象第36-37页
     ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物优化后的结晶现象第37-38页
   ·以H3K4ME3 为底物的复合物晶体的衍射图样第38-39页
   ·SPINDLIN1-组蛋白多肽复合物晶体结构的解析结果第39-42页
     ·全貌第39页
     ·SPINDLIN1 与组蛋白多肽 H3K4ME3 相互作用的微环境第39-42页
   ·BIA-CORE 实验结果证明二者作用力非常稳定,特异性非常高第42-43页
4 讨论第43-45页
   ·SPINDLIN1 的性质与功能第43-44页
   ·复合物晶体的性质第44页
   ·复合物晶体的衍射第44页
   ·复合物晶体结构的不完整性第44页
   ·本课题与植物表观遗传学研究的关系第44-45页
5 结论第45-47页
   ·重组目的蛋白的获得第45页
   ·目的蛋白的纯化策略第45页
   ·适于衍射的晶体的获得第45页
   ·晶体结构的解析第45页
   ·SPINDLIN1 与组蛋白多肽 H3K4ME3 相互作用的方式第45-46页
   ·生物大分子的相互作用第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-51页
作者简介第51页

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