| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| ·生物信息学发展背景 | 第9-10页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第10-12页 |
| ·论文的主要工作 | 第12-13页 |
| 第二章 生物学相关知识 | 第13-23页 |
| ·与本论文相关的生物学知识 | 第13-18页 |
| ·遗传信息载体及传递的中心法则 | 第13-15页 |
| ·基因和ORF 的关系 | 第15页 |
| ·密码子 | 第15-16页 |
| ·遗传密码的特征 | 第16-18页 |
| ·核糖体结合位点 | 第18页 |
| ·原核生物基因组的结构特点 | 第18-19页 |
| ·原核生物基因编码区识别发展状况 | 第19-21页 |
| ·原核生物基因翻译起始位点识别 | 第21-23页 |
| 第三章 识别算法 | 第23-29页 |
| ·Fisher 判别 | 第23-24页 |
| ·引言 | 第23页 |
| ·模型介绍 | 第23-24页 |
| ·马尔可夫模型 | 第24-28页 |
| ·引言 | 第24-25页 |
| ·模型介绍 | 第25-26页 |
| ·马尔可夫模型用于蛋白质编码区的识别 | 第26-28页 |
| ·Jack-Knife检验方法 | 第28-29页 |
| 第四章 原核生物基因翻译起始位点的识别 | 第29-42页 |
| ·引言 | 第29页 |
| ·材料与方法 | 第29-37页 |
| ·数据库 | 第29-30页 |
| ·分析六个识别变量 | 第30-36页 |
| ·起始密码子附近单核苷酸分布模式 | 第30-34页 |
| ·起始密码子附近DNA序列编码能力 | 第34页 |
| ·起始密码子附近密码子信息熵 | 第34-35页 |
| ·起始密码子到上游终止密码子的距离 | 第35-36页 |
| ·起始密码子的种类 | 第36页 |
| ·起始密码子到最左端起始密码子的距离 | 第36页 |
| ·正负样本的产生 | 第36-37页 |
| ·结果 | 第37-40页 |
| ·使用Jack-knife检验方法评价6个识别变量的有效性 | 第37-39页 |
| ·利用高可信度数据库对算法进行评价 | 第39-40页 |
| ·讨论 | 第40-42页 |
| 第五章 其他工作 | 第42-45页 |
| ·基因序列编码区的识别 | 第42-43页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·数据来源 | 第42-43页 |
| ·五阶马尔可夫模型对DNA 序列编码区的识别 | 第43-45页 |
| ·方法 | 第43页 |
| ·评价参数 | 第43-44页 |
| ·结果 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 附录 I | 第49-50页 |
| 附录 II | 第50-52页 |
| 致谢 | 第52页 |