摘要 | 第1-5页 |
前言 | 第5-18页 |
一、生物信息学的发展和现状 | 第5-9页 |
二、禾本科植物系统分类的现状 | 第9-10页 |
三、应用核酸分子进行植物系统分类 | 第10-17页 |
四、禾本科内用rDNA的ITS进行系统分类研究的目的和意义 | 第17-18页 |
材料与方法 | 第18-24页 |
一、实验材料 | 第18页 |
二、序列分析的工具软件 | 第18页 |
三、研究方法 | 第18-24页 |
结果与分析 | 第24-32页 |
一、使用ClustalX多重比对排列 | 第24页 |
二、序列的统计分析 | 第24-31页 |
三、进化树分析 | 第31-32页 |
讨论与结论 | 第32-40页 |
一、序列比对中碱基序列可能出现的情况 | 第32-33页 |
二、计算方法与进化树之间的关系 | 第33-34页 |
三、利用ITS对禾本科植物进行系统分类与传统分类基本吻合 | 第34-35页 |
四、进化树聚类分析中基本上确定了禾本科植物的亲缘关系 | 第35页 |
五、从进化树枝长可以基本确定各种禾本科植物的进化顺序和时间 | 第35-38页 |
六、运用生物学数据时存在的问题 | 第38-40页 |
参考文献 | 第40-48页 |
英文摘要 | 第48-49页 |
附录 | 第49-89页 |
附表1 NCBI获得的rDNA的ITS序列 | 第49-52页 |
附表2 ClustalX多重比对后90种禾本科草本植物ITS序列变异位点表 | 第52-69页 |
附表3 地质年代表 | 第69-70页 |
附表4 距离距阵和标准误 | 第70-85页 |
附图1 利用rDNA的ITS构建的NJ树 | 第85-86页 |
附图2 利用rDNA的ITS构建的ME树 | 第86-87页 |
附图3 利用rDNA的ITS构建的UPGMA树 | 第87-88页 |
附图4 利用rDNA的ITS构建的MP树 | 第88-89页 |
致谢 | 第89页 |