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基于生物信息技术对部分禾本科植物系统分类研究

摘要第1-5页
前言第5-18页
 一、生物信息学的发展和现状第5-9页
 二、禾本科植物系统分类的现状第9-10页
 三、应用核酸分子进行植物系统分类第10-17页
 四、禾本科内用rDNA的ITS进行系统分类研究的目的和意义第17-18页
材料与方法第18-24页
 一、实验材料第18页
 二、序列分析的工具软件第18页
 三、研究方法第18-24页
结果与分析第24-32页
 一、使用ClustalX多重比对排列第24页
 二、序列的统计分析第24-31页
 三、进化树分析第31-32页
讨论与结论第32-40页
 一、序列比对中碱基序列可能出现的情况第32-33页
 二、计算方法与进化树之间的关系第33-34页
 三、利用ITS对禾本科植物进行系统分类与传统分类基本吻合第34-35页
 四、进化树聚类分析中基本上确定了禾本科植物的亲缘关系第35页
 五、从进化树枝长可以基本确定各种禾本科植物的进化顺序和时间第35-38页
 六、运用生物学数据时存在的问题第38-40页
参考文献第40-48页
英文摘要第48-49页
附录第49-89页
 附表1 NCBI获得的rDNA的ITS序列第49-52页
 附表2 ClustalX多重比对后90种禾本科草本植物ITS序列变异位点表第52-69页
 附表3 地质年代表第69-70页
 附表4 距离距阵和标准误第70-85页
 附图1 利用rDNA的ITS构建的NJ树第85-86页
 附图2 利用rDNA的ITS构建的ME树第86-87页
 附图3 利用rDNA的ITS构建的UPGMA树第87-88页
 附图4 利用rDNA的ITS构建的MP树第88-89页
致谢第89页

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