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野桑蚕α-淀粉酶基因的分段克隆、序列分析及其分子系统学研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-12页
主要缩略词表第12-13页
第一部分 文献综述第13-29页
 1. 野桑蚕的研究与家蚕的起源第13-16页
  1.1 野桑蚕的研究第13-15页
   1.1.1 生物学上的研究第13页
   1.1.2 遗传物质的研究第13-14页
    1.1.2.1 染色体数目及结构变异研究第13-14页
    1.1.2.2 DNA多态性研究第14页
    1.1.2.3 Giemsa淡染性染色体研究第14页
   1.1.3 同工酶手段研究野桑蚕第14页
   1.1.4 育种学上的研究第14-15页
   1.1.5 作为桑园害虫的研究第15页
  1.2 家蚕的起源研究第15-16页
 2. 家蚕及野桑蚕分子系统学研究进展第16-20页
  2.1 分子系统学概述及研究方法第16-17页
   2.1.1 分子系统学概述第16页
   2.1.2 方法及意义第16-17页
   2.1.3 系统发生树的重建方法第17页
  2.2 家蚕、野桑蚕分子系统学研究进展第17-20页
   2.2.1 家蚕、野桑蚕核酸之外的分子系统学研究第17页
   2.2.2 RFLP在家蚕、野桑蚕分子系统学上的应用第17-18页
   2.2.3 RAPD在家蚕、野桑蚕分子系统学中的应用第18页
   2.2.4 AFLP在家蚕、野桑蚕分子系统学上的应用第18页
   2.2.5 SSR在家蚕、野桑蚕分子系统学上的应用第18-19页
   2.2.6 核酸序列分析在家蚕、野桑蚕分子系统学上的应用第19-20页
 3. α-淀粉酶及基因第20-29页
  3.1 α-淀粉酶及基因概述第20页
  3.2 家蚕α-淀粉酶及基因的研究进展第20-26页
   3.2.1 血淋巴和消化液淀粉酶第21-22页
    3.2.1.1 家蚕消化液淀粉酶第21-22页
    3.2.1.2 家蚕血淋巴淀粉酶第22页
   3.2.2 消化液淀粉酶活性与产量性状的相关性及其活性的遗传模式第22-24页
    3.2.2.1 品种间的活性差异第22-23页
    3.2.2.2 外界条件对活性的影响第23页
    3.2.2.3 活性与产量性状的相关性第23-24页
    3.2.2.4 活性的遗传模式第24页
   3.2.3 消化液淀粉酶的同工酶及其遗传模式第24-25页
    3.2.3.1 品种间同工酶谱的差异第24-25页
    3.2.3.2 同工酶的遗传模式第25页
   3.2.4 消化液淀粉酶作为家蚕育种的标记第25页
   3.2.5 家蚕消化液淀粉酶基因第25-26页
  3.3 其他鳞翅目昆虫α-淀粉酶及基因的研究概况第26-27页
  3.4 基于α-淀粉酶及基因的分子系统学研究第27-29页
第二部分 引言第29-32页
 1. 论文研究的目的和意义第29-30页
 2. 主要实验内容第30-31页
 3. 技术路线第31-32页
第三部分 野桑蚕α-淀粉酶全基因的分段克隆与序列测定第32-54页
 1. 材料与方法第32-40页
  1.1 材料第32-34页
   1.1.1 实验材料第32-33页
   1.1.2 主要生化试剂第33页
   1.1.3 常用溶液的配制第33-34页
   1.1.4 主要仪器第34页
  1.2 方法第34-40页
   1.2.1 野桑蚕模板DNA的制备第34-35页
   1.2.2 PCR体系及扩增程序第35-36页
    1.2.2.1 PCR反应体系第35页
    1.2.2.2 PCR扩增程序第35-36页
   1.2.3 目的片段的回收第36页
   1.2.4 目的片段的克隆第36-39页
    1.2.4.1 质粒载体的准备第36-37页
    1.2.4.2 目的片段的准备第37页
    1.2.4.3 目的片段与载体的连接第37页
    1.2.4.4 感受态细胞的制备第37-38页
    1.2.4.5 转化第38页
    1.2.4.6 转化子的蓝白菌落筛选与鉴定第38-39页
   1.2.5 测序与序列分析第39-40页
    1.2.5.1 序列测定第39页
    1.2.5.2 片段5、6的序列测定第39-40页
    1.2.5.3 序列分析所用软件第40页
 2. 结果与分析第40-54页
  2.1 基因组DNA的提取第40-41页
  2.2 引物的设计第41-42页
  2.3 野桑蚕α-淀粉酶基因的分段扩增第42页
  2.4 野桑蚕α-淀粉酶基因的分段克隆第42-45页
   2.4.1 片段1、5、7的克隆第42-44页
    2.4.1.1 片段1、5、7的滞后质粒检测第42-43页
    2.4.1.2 片段1、5、7滞后质粒的PCR扩增检测第43页
    2.4.1.3 片段1、5、7滞后质粒的酶切鉴定第43-44页
   2.4.2 片段3、4、6的克隆第44-45页
    2.4.2.1 片段3、4、6的滞后质粒检测第44页
    2.4.2.2 片段3、4、6滞后质粒的PCR检测第44-45页
    2.4.2.3 片段3、4、6滞后质粒的酶切鉴定第45页
   2.4.3 对经过检测的阳性克隆作永久性保存第45页
  2.5 野桑蚕α-淀粉酶基因的分段序列测定及拼接第45-47页
   2.5.1 片段1的序列测定与分析第45-46页
   2.5.2 片段2、3、4、5的序列测定第46-47页
    2.5.2.1 片段2的序列测定与分析第46页
    2.5.2.2 片段3、4、5的序列测定与分析第46-47页
   2.5.3 片段6、7的序列测定第47页
   2.5.4 全基因序列拼接第47页
  2.6 野桑蚕α-淀粉酶全基因的整体结构分析第47-49页
  2.7 野桑蚕、家蚕α-淀粉酶基因的分析比较第49-54页
   2.7.1 全基因序列的统计比较第49-50页
   2.7.2 密码子碱基组成的统计比较第50页
   2.7.3 推定氨基酸序列的分析比较第50-51页
   2.7.4 野桑蚕与家蚕IntronⅡ中non-LTR retrotransposon的序列比较第51-52页
   2.7.5 五种昆虫α-淀粉酶基因序列同源性比较第52-54页
第四部分 IntronⅠ的分子系统学分析第54-58页
 1. 材料与方法第54-55页
  1.1 家蚕品种第54页
  1.2 主要实验仪器、生化试剂及常用溶液的配制第54页
  1.3 DNA的提取第54-55页
  1.4 PCR的扩增体系和扩增程序第55页
  1.5 实验数据的收集及整理第55页
 2. 结果与分析第55-58页
  2.1 基因组DNA的提取第55页
  2.2 IntronⅠ的扩增结果与序列测定第55-56页
   2.2.1 引物的设计第55-56页
   2.2.2 IntronⅠ的扩增第56页
   2.2.3 IntronⅠ的序列测定与拼接第56页
  2.3 基于IntronⅠ的分子系统学研究第56-58页
第五部分 讨论第58-63页
 1. PCR扩增和片段的克隆第58-59页
  1.1 特异引物的设计第58页
  1.2 退火温度的确定第58页
  1.3 片段的克隆第58-59页
 2. 家蚕和野桑蚕之间的亲缘关系第59页
  2.1 基因结构与基因序列的统计比较第59页
  2.2 氨基酸序列及密码子碱基组成的分析比较第59页
 3. 家蚕和野桑蚕α-淀粉酶基因的分子进化研究第59-62页
  3.1 内含子和外显子的分子进化研究第59-60页
  3.2 基因密码子的碱基组成分析第60页
  3.3 推定氨基酸序列的分析比较第60-61页
  3.4 IntronⅡ的分子进化研究第61页
  3.5 基于IntronⅠ的分子系统学研究第61-62页
 4. 进一步研究的思路第62-63页
第六部分 结论第63-64页
参考文献第64-72页
附录1. 野桑蚕α-淀粉酶基因序列第72-74页
附录2 部分家蚕品种和野桑蚕α-淀粉酶基因intronⅠ的Clustal W序列对准图第74-77页
致谢第77页

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