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蛋白质组学解析正常肝细胞与肝癌细胞DNA损伤修复相关复合物的研究

摘要第1-9页
Abstract第9-13页
第一章 前言第13-47页
 1 DNA损伤修复第13-22页
   ·细胞内主要的DNA损伤修复途径第13-15页
   ·DNA双链断裂的损伤修复第15-20页
     ·引起DNA双链断裂的原因第15-16页
     ·DNA双链断裂的修复方式第16-20页
       ·同源重组(homologous recombination)第17-18页
       ·非同源重组第18-19页
       ·同源重组与非同源末端连接的比较第19-20页
   ·修复通路间的相互作用第20-21页
   ·DNA损伤修复与肿瘤的关系第21-22页
 2 大规模蛋白质相互作用研究方法第22-28页
   ·酵母双杂交第22-23页
   ·噬菌体展示第23-25页
   ·蛋白质芯片第25页
   ·串联亲和纯化技术第25-26页
   ·基于质谱的稳定同位素标记技术第26-27页
   ·基于生物信息学的分析方法第27-28页
 3 本论文的选题目的及意义第28-31页
 参考文献第31-47页
第二章 蛋白质组学解析H2AX相关的蛋白相互作用复合物的研究第47-106页
 1 引言第47-48页
 2 实验部分第48-55页
   ·化学试剂、细胞及抗体第48-49页
   ·稳定细胞株的构建第49页
   ·稳定细胞株的鉴定第49-50页
   ·细胞培养、体内标记及实验分组第50页
   ·蛋白提取和蛋白复合物的纯化第50-51页
   ·SDS-PAGE考染及胶内酶解、提肽第51页
   ·酶解肽段的液相色谱分离第51-52页
   ·数据库搜索和蛋白鉴定第52页
   ·免疫印迹第52-53页
   ·激光共聚焦显微镜扫描第53页
   ·博来霉素刺激实验第53-54页
   ·肝癌动物模型的建立第54页
   ·免疫组织化学染色第54-55页
 3 结果与讨论第55-94页
   ·稳定细胞株的构建第55-58页
   ·稳定同位素标记的双标签鉴定策略第58-60页
   ·7701细胞中H2AX相互作用复合物的蛋白质组分析第60-70页
     ·H2AX相互作用复合物的差异表达蛋白组分鉴定和定量分析第60页
     ·7701细胞中定量鉴定到的H2AX蛋白复合物的验证第60-63页
       ·7701细胞中H2AX相互作用复合物的蛋白表达分析第61-62页
       ·7701细胞中H2AX相互作用复合物的细胞定位研究第62-63页
     ·7701细胞鉴定到的H2AX蛋白复合物的功能分类第63-69页
     ·7701细胞H2AX蛋白复合物的功能研究第69-70页
   ·7703细胞中H2AX相互作用复合物的蛋白质组分析第70-84页
     ·H2AX相互作用复合物的差异表达蛋白组分鉴定和定量分析第70页
     ·7703细胞中定量鉴定到的H2AX蛋白复合物的验证第70-74页
       ·7703细胞中H2AX相互作用复合物的蛋白表达分析第70-72页
       ·7703细胞中H2AX相互作用复合物的细胞定位研究第72-74页
     ·7703细胞内H2AX蛋白复合物的功能分类第74-83页
     ·7703细胞H2AX蛋白复合物的功能研究第83-84页
   ·比较H2AX相百作用复合物在7701细胞和7703细胞中的表达变化第84-90页
     ·H2AX相互作用复合物在tag—7701/tag—7703混合组的表达和定量分析第84-85页
     ·验证H2AX相互作用复合物在正常细胞与肝癌细胞的结合情况第85-86页
     ·比较H2AX相瓦作用复合物在正常细胞与肝癌细胞的功能分类情况第86-87页
     ·动物模型病理免疫组化揭示部分相互作用蛋白与肝癌发生发展的关系第87-90页
   ·H2AX相互作用的蛋白功能解析第90-94页
     ·PARP-1第90-91页
     ·KU70第91页
     ·HSP60第91-92页
     ·PCNA第92页
     ·14-3-3 zeta第92-93页
     ·CFL第93-94页
     ·VCP第94页
 4 结论第94-95页
 参考文献第95-106页
第三章 蛋白质组学解析RAD52相关的蛋白相瓦作用复合物的研究第106-136页
 1 引言第106-107页
 2 实验部分第107-111页
   ·化学试剂、抗体和仪器第107-108页
   ·稳定细胞系的构建第108页
   ·稳定细胞系的鉴定第108页
   ·细胞培养、体内标记及实验分组第108-109页
   ·蛋白提取和RAD52蛋白复合物的纯化第109页
   ·SDS-PAGE考染的胶内酶解第109-110页
   ·酶解肽段的液相色谱分离第110页
   ·数据库搜索和蛋白鉴定第110-111页
 3 结果与讨论第111-130页
   ·稳定细胞株的构建第111-112页
   ·稳定同位素标记的双标签鉴定策略第112-114页
   ·RAD52相互作用复合物的差异表达蛋白组分鉴定和定量分析第114-115页
   ·RAD52蛋白复合物的功能分类第115-130页
     ·RAD52相互作用复合物在正常细胞7701的功能分类第116-121页
     ·RAD52相互作用复合物在肝癌细胞7703的功能分类第121-129页
     ·比较RAD52相互作用复合物在正常细胞与肝癌细胞的功能分类情况第129-130页
 4 结论与展望第130-131页
 参考文献第131-136页
致谢第136-137页

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