| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 论文创新之处 | 第9-15页 |
| 第一章 计算机辅助蛋白激酶抑制剂的分子设计概述 | 第15-56页 |
| ·蛋白激酶及其抑制剂概述 | 第15-22页 |
| ·蛋白激酶的分类 | 第15-16页 |
| ·蛋白激酶的结构 | 第16-19页 |
| ·应用于临床的激酶抑制剂 | 第19-21页 |
| ·激酶抑制剂的分类 | 第21-22页 |
| ·计算机辅助药物设计方法 | 第22-43页 |
| ·计算机辅助药物设计方法概述 | 第22-23页 |
| ·定量构效关系简介 | 第23-24页 |
| ·二维定量构效关系研究过程 | 第24-28页 |
| ·三维定量构效关系方法 | 第28-32页 |
| ·分子对接 | 第32-37页 |
| ·分子动力学模拟 | 第37-40页 |
| ·结合自由能预测方法 | 第40-43页 |
| ·计算机辅助激酶抑制剂的分子设计和模拟研究进展 | 第43-47页 |
| ·蛋白激酶抑制剂的合理设计 | 第43-44页 |
| ·蛋白激酶抑制剂的选择性和耐药性机理 | 第44-45页 |
| ·蛋白激酶与其底物、其它蛋白之间的相互作用研究 | 第45-47页 |
| ·总结和展望 | 第47页 |
| 参考文献 | 第47-56页 |
| 第二章 细胞周期检验点激酶1抑制剂的分子模拟研究 | 第56-93页 |
| ·细胞周期检验点激酶抑制剂 | 第56-58页 |
| ·基于结构的Chk1抑制剂的QSAR研究 | 第58-73页 |
| ·引言 | 第58-59页 |
| ·实验方法和步骤 | 第59-63页 |
| ·结果与讨论 | 第63-73页 |
| ·结论 | 第73页 |
| ·结合多种对接方法和MM-GBSA预测Chk1抑制剂的结合自由能 | 第73-86页 |
| ·引言 | 第73-74页 |
| ·计算方法和步骤 | 第74-78页 |
| ·结果和讨论 | 第78-86页 |
| ·结论 | 第86页 |
| 参考文献 | 第86-93页 |
| 第三章 JNK抑制剂的分子设计及选择性机理研究 | 第93-120页 |
| ·c-Jun氨基末端激酶(JNK)家族简介 | 第93-94页 |
| ·c-Jun氨基末端激酶1抑制剂的二维和三维定量构效关系研究 | 第94-106页 |
| ·引言 | 第94页 |
| ·实验方法及步骤 | 第94-98页 |
| ·结果和讨论 | 第98-105页 |
| ·结论 | 第105-106页 |
| ·JNK3抑制剂选择性机理研究 | 第106-115页 |
| ·引言 | 第106-107页 |
| ·实验方法及步骤 | 第107-108页 |
| ·结果和讨论 | 第108-114页 |
| ·结论 | 第114-115页 |
| 参考文献 | 第115-120页 |
| 第四章 VEGFR抑制剂的分子对接和3D-QSAR研究 | 第120-139页 |
| ·研究背景 | 第120-121页 |
| ·实验方法及步骤 | 第121-126页 |
| ·数据集 | 第121-125页 |
| ·分子构建 | 第125页 |
| ·分子对接 | 第125-126页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型的建立 | 第126页 |
| ·结果与讨论 | 第126-135页 |
| ·对接结果分析 | 第126-128页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型统计结果分析 | 第128-131页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型等值线图分析 | 第131-135页 |
| ·设计新的化合物 | 第135页 |
| ·结论 | 第135-136页 |
| 参考文献 | 第136-139页 |
| 第五章 β型甲状腺激素受体激动剂的3D-QSAR和分子对接研究 | 第139-154页 |
| ·β型甲状腺激素受体激动剂 | 第139页 |
| ·实验方法及步骤 | 第139-144页 |
| ·数据集 | 第140-143页 |
| ·分子对接 | 第143页 |
| ·分子构建和叠合 | 第143页 |
| ·建立CoMFA和CoMSIA模型 | 第143-144页 |
| ·结果和讨论 | 第144-150页 |
| ·分子对接结果分析 | 第144-145页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型的统计结果分析 | 第145-148页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型三维等值线图分析 | 第148-150页 |
| ·结论 | 第150页 |
| 参考文献 | 第150-154页 |
| 附录Ⅰ 在读博士期间已发表和待发表的论文目录 | 第154-156页 |
| 附录Ⅱ 作者简介 | 第156-157页 |
| 致谢 | 第157页 |
