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HIV-1蛋白酶与抑制剂相互作用的理论计算研究

中文摘要第1-9页
Abstract第9-12页
第一章 前言第12-23页
   ·获得性免疫缺陷综合症病毒第12-13页
   ·HIV-1 的生命周期第13-17页
   ·HIV-1 蛋白酶的结构和催化机制第17-19页
   ·HIV-1 蛋白酶的抑制剂第19-23页
第二章 抑制剂与受体的相互作用第23-32页
   ·分子识别与相互作用第23-25页
   ·抑制剂与受体的键合类型第25-27页
   ·抑制剂与受体的立体作用第27-29页
   ·抑制剂-受体相互作用的锁-钥关系第29-32页
第三章 研究理论和方法第32-55页
   ·量子化学计算第32-36页
   ·分子动力学模拟第36-42页
   ·分子力学方法第42-46页
   ·自由能计算第46-53页
   ·抑制剂和残基的相互作用第53-55页
第四章 HIV-1 蛋白酶质子化的功能作用之分子动力学模拟和自由能计算第55-69页
   ·系统的初始化第55-59页
   ·结果和讨论第59-68页
   ·小结第68-69页
第五章 HIV-1 蛋白酶氟取代抑制剂的动力学模拟和自由能计算研究第69-84页
   ·模拟系统准备第69-72页
   ·结果和讨论第72-83页
   ·小结第83-84页
第六章 变异D30N 和150V 对HIV 蛋白酶抑制剂TMC-114 的抗药性的研究-分子动力学模拟和自由能计算第84-99页
   ·前言第84-86页
   ·系统的设置第86-87页
   ·结果和讨论第87-97页
   ·小结第97-99页
第七章 总结与展望第99-101页
   ·本论文的结论和研究意义第99-100页
   ·未来展望第100-101页
参考文献第101-116页
攻读博士期间发表的论文第116-118页
致谢第118-119页

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