| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 0 文献综述 | 第10-24页 |
| 1 | 第10-24页 |
| ·系统学的概念,研究领域 | 第10页 |
| ·常用的分子标记 | 第10-12页 |
| ·系统树构建 | 第12-14页 |
| ·序列比对 | 第12页 |
| ·模型的方法和常用软件 | 第12-13页 |
| ·系统树构建方法 | 第13-14页 |
| ·系统树的评估 | 第14页 |
| ·发展趋势 | 第14页 |
| 2 | 第14-20页 |
| ·鱼类线粒体基因组和控制区结构和特性 | 第14-18页 |
| ·鱼类mtDNA结构 | 第15-16页 |
| ·特性(与核基因比较) | 第16-17页 |
| ·鱼类控制区的结构和特点 | 第17-18页 |
| ·线粒体DNA在鱼类分子系统学中的应用 | 第18-20页 |
| ·mtDNA在鱼类系统与群体关系学中的应用 | 第18-19页 |
| ·mtDNA在鱼类系统地理学中的应用 | 第19页 |
| ·mtDNA在作为分子钟来推测物种分歧时间 | 第19-20页 |
| 3 鲽形目鱼类 | 第20-21页 |
| ·形态特征 | 第20页 |
| ·种类组成 | 第20页 |
| ·分布特征 | 第20-21页 |
| ·大口鳒分类地位、形态特征和分布 | 第21页 |
| ·鲽形目鱼类系统分类的研究 | 第21-24页 |
| ·鲽形目鱼类的起源 | 第21-22页 |
| ·鲽形目鱼类单系讨论 | 第22页 |
| ·鲽形目鱼类演化 | 第22页 |
| ·分子生物学在鲽形目中广泛开展 | 第22-24页 |
| 第一章 大口鳒线粒体基因组的研究 | 第24-59页 |
| 1 材料与方法 | 第24-28页 |
| ·样品采集与保存 | 第24页 |
| ·DNA的提取 | 第24-25页 |
| ·PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·PCR产物检测与纯化 | 第26页 |
| ·数据分析 | 第26页 |
| ·系统树构建 | 第26-28页 |
| 2 大口鳒线粒体基因在全序列 | 第28-56页 |
| ·大口鳒基因组总述 | 第28-34页 |
| ·基因组结构 | 第28-32页 |
| ·碱基组成 | 第32-33页 |
| ·基因组碱基组成偏倚 | 第33页 |
| ·十种鲽形目鱼类碱基组成比较 | 第33-34页 |
| ·rRNA基因 | 第34-37页 |
| ·大口鳒rRNA基因长度和二级结构 | 第34-36页 |
| ·十种鲽形目鱼类rRNA基因长度,碱基组成和变异位点分析 | 第36-37页 |
| ·蛋白编码基因 | 第37-46页 |
| ·蛋白质的起始与终止密码子 | 第38页 |
| ·蛋白质的密码子 | 第38-39页 |
| ·ATP6和ATP8基因 | 第39-40页 |
| ·ND1-ND6,ND4L | 第40-42页 |
| ·Cytb基因 | 第42-43页 |
| ·COⅠ、COⅡ、COⅢ基因 | 第43-44页 |
| ·十种鲽形目鱼类的碱基组成比较 | 第44-46页 |
| ·tRNA基因 | 第46-50页 |
| ·tRNA基因二级结构 | 第46-50页 |
| ·10种鲽形目鱼类tRNA碱基组成比较 | 第50页 |
| ·轻链起始复制区 | 第50-52页 |
| ·轻链起始复制区结构 | 第50-52页 |
| ·十种鲽形目鱼类O_L碱基组成 | 第52页 |
| ·鲽形目分子系统树的构建 | 第52-56页 |
| 3 讨论 | 第56-59页 |
| ·基因组序列组成特征 | 第56-58页 |
| ·鲽形目的系统进化 | 第58-59页 |
| 第二章 大口鳒线粒体控制区的研究 | 第59-77页 |
| 1 材料与方法 | 第59-62页 |
| ·样品采集与保存 | 第59页 |
| ·DNA提取 | 第59页 |
| ·PCR扩增 | 第59页 |
| ·PCR产物检测与纯化 | 第59-60页 |
| ·目的基因片段的克隆 | 第60-61页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第60页 |
| ·目的片段的体外连接 | 第60页 |
| ·连接产物的转化与克隆的筛选 | 第60-61页 |
| ·数据分析 | 第61页 |
| ·系统树构建 | 第61-62页 |
| 2 大口鳒线粒体控制区 | 第62-75页 |
| ·大口鳒mtDNA控制区的结构特性 | 第62-71页 |
| ·大口鳒mtDNA控制区的重复序列类型 | 第62-63页 |
| ·大口鳒mtDNA控制区的结构 | 第63-67页 |
| ·大口鳒mtDNA控制区的序列差异 | 第67-71页 |
| ·8 种鲽形目mtDNA控制区碱基含量 | 第71-73页 |
| ·系统发育分析 | 第73-75页 |
| 3 讨论 | 第75-77页 |
| ·控制区结构 | 第75页 |
| ·8种鲽形目鱼类碱基组成 | 第75-76页 |
| ·系统进化分析 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-86页 |
| 致谢 | 第86页 |