基于频繁功能模式的蛋白质功能预测
| 提要 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-21页 |
| ·课题背景及意义 | 第11-16页 |
| ·课题背景 | 第11-14页 |
| ·研究内容 | 第14-15页 |
| ·研究现状及意义 | 第15-16页 |
| ·蛋白质互作的研究现状 | 第16-18页 |
| ·本文主要工作及结构安排 | 第18-21页 |
| ·本文主要工作 | 第18-19页 |
| ·本文组织结构 | 第19-21页 |
| 第2章 蛋白质互作网络的检测及功能预测方法 | 第21-30页 |
| ·蛋白质互作评估 | 第21-23页 |
| ·蛋白质互作数据库 | 第23-26页 |
| ·蛋白质互作检测的计算方法 | 第26-29页 |
| ·基于基因组信息的方法 | 第26-27页 |
| ·基于序列信息的方法 | 第27页 |
| ·基于蛋白质结构域的方法 | 第27-28页 |
| ·基于机器学习的方法 | 第28页 |
| ·基于网络拓扑的方法 | 第28-29页 |
| ·蛋白质功能预测方法 | 第29-30页 |
| ·直接注释法 | 第29页 |
| ·基于模块的方法 | 第29页 |
| ·结合其他数据的功能预测 | 第29-30页 |
| 第3章 基于频繁功能模式的蛋白质功能预测 | 第30-44页 |
| ·相关定义 | 第31-37页 |
| ·图的基本概念 | 第31-33页 |
| ·频繁功能的模式挖掘 | 第33-37页 |
| ·原始数据的处理方式 | 第37-38页 |
| ·蛋白质互做网络的可信度计算 | 第37-38页 |
| ·蛋白质互做网络的整合 | 第38页 |
| ·功能预测算法 | 第38-44页 |
| ·算法思想和过程 | 第38-41页 |
| ·基于可信度的互作数据的预测 | 第41-42页 |
| ·基于数据融合的互作数据的预测 | 第42-44页 |
| 第4章 实验结果分析 | 第44-50页 |
| ·未经特殊处理的数据源的实验结果 | 第44-45页 |
| ·使用具有可信度的蛋白质互做网络的实验结果 | 第45-47页 |
| ·蛋白质互做网络整合的实验结果 | 第47页 |
| ·结果比较 | 第47-50页 |
| 第5章 总结与展望 | 第50-52页 |
| ·总结 | 第50页 |
| ·展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
