基于质谱数据分析的蛋白质鉴定—断裂模型、磷酸化肽段以及谱库搜索方法的研究
摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-13页 |
第1章 引言 | 第13-31页 |
·蛋白质和多肽 | 第13-15页 |
·质谱技术 | 第15-22页 |
·质谱仪类型 | 第15-16页 |
·质谱分析原理 | 第16-18页 |
·质谱仪重要性能指标 | 第18-19页 |
·串联质谱及质谱数据特点 | 第19-22页 |
·基于质谱分析的多肽和蛋白质鉴定 | 第22-25页 |
·运用单级质谱仪的肽质量指纹谱鉴定方法 | 第23页 |
·运用串联质谱仪的蛋白质鉴定方法 | 第23-25页 |
·基于质谱分析的磷酸化肽段鉴定 | 第25-27页 |
·基于质谱数据分析的蛋白质和多肽鉴定软件和算法 | 第27-29页 |
·研究内容 | 第29-31页 |
第2章 基于质谱数据分析的蛋白质鉴定算法和软件 | 第31-43页 |
·数据库搜索方法 | 第31-36页 |
·非统计的方法 | 第32-34页 |
·基于统计的方法 | 第34-36页 |
·De Novo方法 | 第36-39页 |
·图形理论方法 | 第36-38页 |
·组合方法 | 第38-39页 |
·肽段序列标签力法 | 第39-40页 |
·质谱数据库搜索方法 | 第40-41页 |
·小结 | 第41-43页 |
第3章 肽段断裂模型 | 第43-55页 |
·断裂模型研究的相关工作 | 第43-44页 |
·材料与方法 | 第44-48页 |
·材料 | 第44页 |
·方法 | 第44-48页 |
·结果与讨论 | 第48-54页 |
·肽键位置对肽段断裂的影响 | 第48-49页 |
·肽键种类对肽段断裂的影响 | 第49-53页 |
·理论图谱预测 | 第53-54页 |
·小结 | 第54-55页 |
第4章 磷酸化肽段的鉴定 | 第55-60页 |
·磷酸化肽段研究的相关工作 | 第55-56页 |
·材料与方法 | 第56-57页 |
·材料 | 第56页 |
·方法 | 第56-57页 |
·结果与讨论 | 第57-58页 |
·磷酸化肽段的鉴定 | 第57页 |
·磷酸化肽段的断裂规律 | 第57-58页 |
·小结 | 第58-60页 |
第5章 基于谱库搜索的蛋白质鉴定方法研究 | 第60-68页 |
·谱库搜索方法研究的相关工作 | 第60页 |
·材料与方法 | 第60-63页 |
·材料 | 第60页 |
·方法 | 第60-63页 |
·结果与讨论 | 第63-66页 |
·谱库特征 | 第63-64页 |
·搜索速度 | 第64-66页 |
·小结 | 第66-68页 |
第6章 结束语 | 第68-70页 |
·本研究工作总结 | 第68页 |
·本研究创新点 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-77页 |
附录一 部分已搜集图谱的相关信息 | 第77-87页 |
附录二 目前蛋白质鉴定的网络资源和软件 | 第87-90页 |
附录三 研究生期间所发表的论文 | 第90-91页 |
致谢 | 第91-92页 |