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豆梨响应黑斑病菌侵染的转录组分析及PcNAC1基因功能鉴定

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
缩略词表第12-14页
第一章 文献综述第14-26页
    第一节 梨黑斑病的发生与防治第14-19页
        1. 梨黑斑病病原菌形态特征第14页
        2. 梨黑斑病病原菌的生物学特性第14-15页
            2.1 温度对梨黑斑病病原菌的影响第15页
            2.2 湿度对梨黑斑病病原菌的影响:第15页
            2.3 pH对梨黑斑病病原菌的影响:第15页
            2.4 不同碳氮源对对梨黑斑病病原菌的影响:第15页
        3. 发病症状第15-16页
            3.1 叶片发病症状第15-16页
            3.2 果实发病症状第16页
            3.2 在枝条上的发病症状第16页
        4. 黑斑病的发病规律第16-17页
        5. 防治方法第17-18页
            5.1 常规黑斑病病菌的防治方法第17-18页
                5.1.1 化学药剂防治第17页
                5.1.2 生物防治第17页
                5.1.3 田间管理第17页
                5.1.4 选用黑斑病的抗病品种第17-18页
            5.2 分子层面防治第18页
                5.2.1 分子育种第18页
                5.2.2 测序技术筛选抗病基因第18页
                5.2.3 早期分子检测诊断第18页
        6 研究目的和意义第18-19页
    第二节 NAC转录因子的结构与功能的研究第19-26页
        1. NAC转录因子的结构特征和分类第19-20页
        2. NAC转录因子的定位第20页
        3. NAC转录因子的生物学功能第20-23页
            3.1 NAC转录因子在植物生长发育方面的功能第20-21页
                3.1.1 促进植物次生壁的形成第20页
                3.1.2 促进植物顶端分生组织的形成第20-21页
                3.1.3 促进植物侧根的发育第21页
                3.1.4 对植物细胞分裂与衰老的影响第21页
            3.2 NAC转录因子在生物胁迫方面的功能第21-22页
                3.2.1 NAC转录因子对植物抵抗真菌的影响第21页
                3.2.2 NAC转录因子对植物抵抗细菌的影响第21-22页
                3.2.3 NAC转录因子对植物抵抗病毒的影响第22页
            3.3 NAC转录因子在非生物胁迫方面的功能第22-23页
                3.3.1 NAC转录因子对盐胁迫的响应第22页
                3.3.2 NAC转录因子对干旱胁迫的响应第22页
                3.3.3 NAC转录因子对低温胁迫的响应第22页
                3.3.4 NAC转录因子对高温胁迫的响应第22-23页
            3.4 NAC转录因子基因参与植物激素信号的传导第23页
        4. NAC转录因子的调控第23-24页
            4.1 mRNA水平上的调控第23页
            4.2 蛋白质水平上的调控第23-24页
        5. 目的与意义第24-26页
第二章 豆梨黑斑病病菌侵染豆梨后的转录组分析第26-42页
    1 材料与方法第26-32页
        1.1 试验材料第26-27页
        1.2 试验方法第27-29页
            1.2.1 豆梨黑斑病病菌的接种第27页
            1.2.2 DNA的提取与病菌检测第27页
            1.2.3 RNA的提取与纯化第27-29页
            1.2.4 文库的建立与测序第29页
        1.3 数据分析第29-32页
            1.3.1 数据分析流程第29页
            1.3.2 转录本数据的处理及统计第29-30页
            1.3.3 参考序列对比分析与功能注释第30页
            1.3.4 基因表达水平分析第30页
            1.3.5 差异表达基因的筛选第30页
            1.3.6 差异基因GO富集分析第30页
            1.3.7 差异基因KEGG富集分析第30-31页
            1.3.8 长链非编码RNA (Novel lncRNA)的鉴定与差异表达分析第31页
            1.3.9 差异基因表达的定量分析第31-32页
    2 结果与分析第32-39页
        2.1 接种黑斑病后的病菌检测第32-33页
        2.2 RNA质量的检测第33页
        2.3 测序原始数据的处理与统计第33-34页
        2.4 参考序列对比分析与基因功能注释第34-35页
        2.5 差异表达基因的鉴定第35页
        2.6 差异基因GO富集第35-36页
        2.7 差异基因KEGG富集第36-37页
        2.8 Novel lncRNA差异表达分析第37-38页
        2.9 差异基因的定量检测第38-39页
    3 讨论第39-42页
第三章 豆梨NAC转录因子基因PcNAC1的克隆、亚细胞定位及功能初探第42-58页
    1 材料与方法第43-48页
        1.1 材料第43-44页
            1.1.1 植物材料第43-44页
            1.1.2 菌种及载体第44页
            1.1.3 试剂及其他第44页
        1.2 豆梨PcNAC1全长cDNA的克隆第44-45页
        1.3 生物信息学分析第45页
        1.4 PcNAC1在豆梨不同组织中的表达情况第45-46页
        1.5 豆梨黑斑病的接种与PcNAC1基因的表达分析第46-47页
            1.5.1 豆梨黑斑病的接种第46页
            1.5.2 接种豆梨黑斑病后PcNAC1的表达量变化第46-47页
        1.6 PcNAC1亚细胞定位载体的构建与烟草瞬时表达第47-48页
        1.7 PcNAC1瞬时侵染本氏烟后的抗病鉴定第48页
    2. 结果与分析第48-55页
        2.1 豆梨PcNAC1基因的克隆和序列分析第48-50页
        2.2 豆梨PcNAC1的氨基酸序列比对与系统进化树的构建第50-51页
        2.3 豆梨PcNAC1基因在不同组织中的表达情况第51-52页
        2.4 豆梨黑斑病菌侵染后PcNAC1基因表达分析第52-53页
        2.5 豆梨PcNAC1基因的亚细胞定位第53页
        2.6 烟草上瞬时表达PcNAC1后的抗病鉴定第53-54页
        2.7 疫霉侵染本氏烟后防卫相关基因的表达变化第54-55页
    3. 讨论第55-58页
全文结论第58-60页
创新点第60-62页
参考文献第62-72页
攻读硕士学位期间所发表论文第72-74页
致谢第74页

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