| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 论文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 基因组Indel概述 | 第13-15页 |
| 1.1.1 Indel概述 | 第13页 |
| 1.1.2 DNA测序技术 | 第13-14页 |
| 1.1.3 Indel分析技术 | 第14-15页 |
| 1.2 Indel分型方法 | 第15-18页 |
| 1.2.1 Indel的分型方法概述 | 第15-16页 |
| 1.2.2 KASP分型方法简介 | 第16-18页 |
| 1.3 畜禽Indel研究进展 | 第18-26页 |
| 1.3.1 畜禽基因组中Indel检测 | 第18-21页 |
| 1.3.2 畜禽Indel标记的开发利用 | 第21-26页 |
| 第二章 引言 | 第26-28页 |
| 2.1 研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 2.2 技术路线 | 第27-28页 |
| 第三章 实验材料和方法 | 第28-34页 |
| 3.1 实验动物 | 第28页 |
| 3.2 主要试剂和仪器 | 第28-29页 |
| 3.2.1 主要实验仪器 | 第28-29页 |
| 3.2.2 主要溶液配制 | 第29页 |
| 3.3 实验方法 | 第29-34页 |
| 3.3.1 基因组Indels检测 | 第29页 |
| 3.3.2 变异比较分析 | 第29页 |
| 3.3.3 随机挑选Indel位点PCR-PAGE验证 | 第29-31页 |
| 3.3.4 候选Indels分型 | 第31-32页 |
| 3.3.5 数据统计处理 | 第32-34页 |
| 第四章 实验结果 | 第34-46页 |
| 4.1 Indels筛选结果 | 第34-41页 |
| 4.1.1 Indels检测和分析 | 第34-36页 |
| 4.1.2 差异Indels筛选和分析 | 第36-40页 |
| 4.1.3 随机挑选Indel位点PCR-PAGE验证 | 第40-41页 |
| 4.2 候选Indels基因分型和群体遗传学分析 | 第41-43页 |
| 4.2.1 样本DNA提取 | 第41-42页 |
| 4.2.2 KASP分型结果 | 第42-43页 |
| 4.2.3 候选Indels位点的遗传多态性分析 | 第43页 |
| 4.3 候选Indels与生产性状关联分析 | 第43-46页 |
| 第五章 讨论 | 第46-52页 |
| 5.1 山羊全基因组Indels分布规律 | 第46-48页 |
| 5.1.1 全基因组测序 | 第46-47页 |
| 5.1.2 基因组Indel变异识别 | 第47-48页 |
| 5.1.3 随机位点PCR-PAGE验证 | 第48页 |
| 5.2 山羊候选Indels基因分型和群体遗传学分析 | 第48-50页 |
| 5.3 山羊候选Indels位点与生产性状关联分析 | 第50-52页 |
| 第六章 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| 附录 | 第64-76页 |
| 致谢 | 第76-78页 |
| 在读期间参与的课题和发表的文章 | 第78页 |
