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拟南芥MEP途径关键酶及代谢中间产物对萜类化合物生物合成的调控

中文摘要第5-8页
Abstract第8-11页
英文缩写词表第12-17页
第1章 绪论第17-33页
    1.1 萜类化合物的分类和分布第17-19页
    1.2 植物萜类化合物的生物合成第19-26页
        1.2.1 甲羟戊酸(MVA)途径:基因、酶和亚细胞定位第20-23页
        1.2.2 2-甲基-D-赤藻糖醇-4-磷酸(MEP)途径:基因、酶和亚细胞定位第23-24页
        1.2.3 MVA和MEP途径的异同第24-26页
    1.3 MEcDP是拟南芥MEP途径的关键中间产物第26-28页
        1.3.1 生物体对MEcDP的生物合成及代谢的调控第26-27页
        1.3.2 MEcDP是植物一种潜在信号转导分子第27页
        1.3.3 MEcDP流向MEP途径以外的生物合成途径第27-28页
    1.4 无水密度梯度分离技术第28-29页
    1.5 同位素动态标记法第29-30页
    1.6 立题依据、研究意义及主要研究内容第30-33页
        1.6.1 立题依据和研究意义第30-31页
        1.6.2 主要研究内容第31-33页
第2章 拟南芥ceh1突变体转录组生物信息学分析第33-41页
    2.1 数据来源第33页
    2.2 方法第33-34页
        2.2.1 数据处理与差异表达基因的筛选第33页
        2.2.2 差异基因功能富集分析第33-34页
        2.2.3 蛋白质互作网络的构建第34页
    2.3 结果第34-38页
        2.3.1 数据处理与差异表达基因的筛选第34-35页
        2.3.2 差异基因功能富集分析第35-36页
        2.3.3 差异基因互作网络第36-38页
    2.4 分析与讨论第38-40页
    2.5 小结第40-41页
第3章 利用NAF分离技术分析拟南芥MEP途径代谢中间产物的细胞区室分布第41-67页
    3.1 材料第41-42页
        3.1.1 植物材料第41页
        3.1.2 试剂第41页
        3.1.3 主要仪器第41-42页
    3.2 方法第42-56页
        3.2.1 利用无水密度梯度离心技术富集不同细胞区室的MEP途径中间产物第42-45页
        3.2.2 野生型拟南芥不同细胞区室中MEP途径代谢产物的测定第45-46页
        3.2.3 野生型拟南芥不同细胞区室标签化合物的测定第46-48页
        3.2.4 不同细胞区室标签酶的提取与检测第48-55页
        3.2.5 数据拟合第55-56页
    3.3 结果第56-64页
        3.3.1 利用无水密度梯度离心技术富集不同细胞区室的MEP途径中间产物第56页
        3.3.2 野生型拟南芥NAF样品的标签化合物及酶的提取及检测第56-59页
        3.3.3 野生型拟南芥NAF样品中MEP途径相关代谢产物的提取及检测第59-61页
        3.3.4 数据BestFit拟合第61-64页
    3.4 分析与讨论第64-65页
    3.5 小结第65-67页
第4章 植物表达载体的构建及转基因拟南芥的筛选第67-89页
    4.1 材料第67-69页
        4.1.1 植物材料第67页
        4.1.2 宿主菌株以及载体第67页
        4.1.3 酶及试剂第67-68页
        4.1.4 常用培养基及溶液配方第68页
        4.1.5 引物第68-69页
        4.1.6 主要仪器设备第69页
    4.2 方法第69-81页
        4.2.1 拟南芥RNA的提取和cDNA的合成第69-71页
        4.2.2 拟南芥HDS基因的扩增第71页
        4.2.3 PCR产物的回收第71-72页
        4.2.4 BP和LR反应构建表达载体pK7FWG2.0::HDS第72-75页
        4.2.5 农杆菌转化第75-76页
        4.2.6 拟南芥的遗传转化第76-77页
        4.2.7 转基因拟南芥的筛选与鉴定第77-78页
        4.2.8 过量表达HDS基因的拟南芥株系MEP代谢产物化学分析第78-79页
        4.2.9 Real Time PCR检测不同拟南芥品系HDS基因的转录水平第79-81页
    4.3 结果第81-86页
        4.3.1 拟南芥HDS基因cDNA全长序列的获得及其序列分析第81页
        4.3.2 拟南芥真核表达载体pK7FWG2.0::HDS的构建第81-82页
        4.3.3 过量表达HDS基因拟南芥的鉴定第82-84页
        4.3.4 过量表达HDS基因拟南芥MEP途径代谢产物的分析第84-85页
        4.3.5 Real Time PCR检测拟南芥的转录水平第85-86页
    4.4 分析与讨论第86-87页
    4.5 小结第87-89页
第5章 拟南芥HDS基因对MEP途径的调控第89-109页
    5.1 材料第89-90页
        5.1.1 植物材料第89页
        5.1.2 主要试剂第89页
        5.1.3 仪器第89-90页
    5.2 方法第90-94页
        5.2.1 植物培养条件第90页
        5.2.2 气体交换和动态标记系统第90-91页
        5.2.3 MEP途径代谢产物~(13)C掺入的测定第91-92页
        5.2.4 利用~(13)C标记的方法检测计算拟南芥MEP途径的代谢通量第92-94页
        5.2.5 拟南芥色素的化学分析第94页
    5.3 结果与分析第94-106页
        5.3.1 拟南芥DXP的代谢库的研究第94-100页
        5.3.2 不同拟南芥品系MEcDP代谢库的研究第100-103页
        5.3.3 不同品系拟南芥色素分析第103-106页
    5.4 分析与讨论第106-107页
    5.5 小结第107-109页
第6章 结论与创新点第109-111页
    6.1 结论第109-110页
    6.2 创新点第110页
    6.3 展望第110-111页
参考文献第111-121页
附录第121-125页
作者简介及在学期间科研成果第125-127页
致谢第127-128页

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