| 项目资助 | 第2-3页 |
| 中文摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 分子标记及其在家禽育种中的应用 | 第11-14页 |
| 1.1 分子标记 | 第11页 |
| 1.2 单核酸标记(SNP)及其在家禽育种的应用 | 第11-12页 |
| 1.3 SNPs的检测和基因分型技术 | 第12-14页 |
| 2 实时荧光定量PCR技术 | 第14-16页 |
| 2.1 实时荧光定量PCR的技术原理 | 第14-15页 |
| 2.2 实时荧光定量PCR技术在畜牧研究领域的应用 | 第15-16页 |
| 3 生肌调节因子(MYOGENIC REGULATORY FACTORS,MRFs)家族简介 | 第16-18页 |
| 3.1 MyoG基因的研究进展 | 第16-17页 |
| 3.2 Myf5基因的研究进展 | 第17-18页 |
| 4 京海黄鸡品种简介 | 第18页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 MYOG与MYF5基因多态性及其与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析 | 第20-55页 |
| 第一节 MYOG基因的多态性与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析 | 第20-33页 |
| 1 材料与方法 | 第21-24页 |
| 1.1 试验材料 | 第21-22页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第21页 |
| 1.1.2 主要仪器和设备 | 第21页 |
| 1.1.3 主要实验试剂 | 第21-22页 |
| 1.1.4 主要试剂的配制 | 第22页 |
| 1.2 试验方法 | 第22-24页 |
| 1.2.1 鸡血液DNA的提取 | 第22页 |
| 1.2.2 引物设计及其PCR退火温度的确定 | 第22-23页 |
| 1.2.3 PCR-SSCP分析 | 第23-24页 |
| 2 数据分析及统计 | 第24-26页 |
| 2.1 相关分析软件 | 第24页 |
| 2.2 数据分析统计方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 哈代温伯格平衡检验 | 第24-25页 |
| 2.2.2 遗传多样性检测 | 第25-26页 |
| 2.2.3 关联性分析 | 第26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-33页 |
| 3.1 鸡基因组DNA和PCR产物结果 | 第26-27页 |
| 3.1.1 基因组DNA提取结果 | 第26-27页 |
| 3.1.2 引物PCR扩增效果检测 | 第27页 |
| 3.2 MyoG基因PCR-SSCP检测及测序结果分析 | 第27-28页 |
| 3.3 MyoG基因在京海黄鸡群体中的遗传变异分析 | 第28页 |
| 3.4 MyoG基因各基因型对京海黄鸡生长繁殖性状的关联分析 | 第28-30页 |
| 3.4.1 MyoG基因各基因型对京海黄鸡生长性状的关联分析 | 第28-29页 |
| 3.4.2 MyoG基因各基因型对京海黄鸡繁殖性状的关联分析 | 第29-30页 |
| 3.5 讨论 | 第30-33页 |
| 3.5.1 MyoG基因与生长性状间的关联性讨论 | 第30-31页 |
| 3.5.2 MyoG基因与繁殖性状间的关联性讨论 | 第31-33页 |
| 第二节 MYF5基因的多态性与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析 | 第33-46页 |
| 1 材料与方法 | 第33-35页 |
| 1.1 试验材料 | 第33页 |
| 1.2 主要仪器和设备 | 第33页 |
| 1.3 主要实验试剂 | 第33-34页 |
| 1.4 引物设计 | 第34页 |
| 1.5 PCR-SSCP分析及测序分析 | 第34-35页 |
| 2 数据分析及统计 | 第35页 |
| 2.1 关联分析 | 第35页 |
| 3 单倍型分析 | 第35页 |
| 4 结果与分析 | 第35-44页 |
| 4.1 引物PCR扩增效果检测 | 第35-36页 |
| 4.2 PCR-SSCP检测及测序结果 | 第36-39页 |
| 4.3 Myf5基因变异位点的连锁不平衡分析及单倍型分析 | 第39-41页 |
| 4.3.1 Myf5基因变异位点的连锁不平衡分析 | 第39-40页 |
| 4.3.2 Myf5基因单倍型分析 | 第40-41页 |
| 4.4 Myf5基因单倍型组合与京海黄鸡生长和繁殖性状的相关分析 | 第41-44页 |
| 5 讨论 | 第44-46页 |
| 第三节 MYOG基因和MYF5部分基因型组合与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析 | 第46-55页 |
| 1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 1.1 试验材料 | 第46-47页 |
| 1.2 主要仪器和设备 | 第47页 |
| 1.3 主要实验试剂 | 第47页 |
| 1.4 引物设计 | 第47页 |
| 1.5 PCR-SSCP分析及测序分析 | 第47-48页 |
| 2 数据分析及统计 | 第48页 |
| 2.1 关联分析 | 第48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-51页 |
| 3.1 MyoG基因多态性对生长性状的遗传效应分析 | 第48-49页 |
| 3.1.1 MyoG基因外显子3变异位点的等位基因和基因型频率 | 第48-49页 |
| 3.1.2 MyoG基因多态性与生长性状的相关分析 | 第49页 |
| 3.2 Myf5基因多态性对生长性状的遗传效应分析 | 第49-51页 |
| 3.2.1 Myf5基因外显子1变异位点的等位基因和基因型频率 | 第50页 |
| 3.2.2 Myf5基因多态性与生长性状的相关分析 | 第50-51页 |
| 4. MYOG基因和MYF5基因多态位点的互作效应分析 | 第51-52页 |
| 5 讨论 | 第52-55页 |
| 5.1 MyoG和Myf5基因对京海黄鸡生长性状的相关分析 | 第52-53页 |
| 5.2 MyoG基因与Myf5基因的协同作用 | 第53-55页 |
| 第三章 MYOG基因和MYF5基因在京海黄鸡不同生长阶段表达规律的研究 | 第55-67页 |
| 1 材料与方法 | 第55-58页 |
| 1.1 试验个体 | 第55页 |
| 1.2 主要实验试剂 | 第55页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第55-56页 |
| 1.4 实验方法 | 第56-57页 |
| 1.4.1 主要试剂配制 | 第56页 |
| 1.4.2 鸡组织总RNA的提取和检测(Trizol法) | 第56-57页 |
| 1.4.3 引物设计 | 第57页 |
| 1.4.4 反转录 | 第57页 |
| 1.4.5 内参基因与目的基因的标准曲线及溶解曲线的绘制 | 第57页 |
| 1.4.6 实时荧光定量PCR | 第57页 |
| 1.5 统计分析 | 第57-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-65页 |
| 2.1 RNA提取结果 | 第58页 |
| 2.2 PCR扩增目的基因和内参基因结果 | 第58-59页 |
| 2.3 目的基因的标准曲线和溶解曲线结果 | 第59-60页 |
| 2.4 京海黄鸡MyoG基因的表达规律 | 第60-63页 |
| 2.4.1 MyoG基因在不同组织中的表达差异 | 第60-61页 |
| 2.4.2 MyoG基因在同一组织不同生长阶段的表达差异 | 第61-63页 |
| 2.5 京海黄鸡Myf5基因的表达规律 | 第63-65页 |
| 2.5.1 Myf5基因在不同组织中的表达差异 | 第63页 |
| 2.5.2 Myf5基因在同一组织不同生长阶段的表达差异 | 第63-65页 |
| 3 讨论 | 第65-67页 |
| 3.1 MyoG基因的表达 | 第65-66页 |
| 3.2 Myf5基因的表达 | 第66-67页 |
| 全文结论 | 第67-68页 |
| 创新点 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第79-80页 |
