摘要 | 第3-4页 |
ABSTRACT | 第4页 |
前言 | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第8-19页 |
1.1 P-糖蛋白(p-glycoprotein,P-gp,ABCB1)简介 | 第8-9页 |
1.2 P-gp 的研究现状 | 第9-12页 |
1.2.1 P-gp 的结构 | 第9-11页 |
1.2.2 P-gp 的构象 | 第11页 |
1.2.3 P-gp 的作用机制 | 第11页 |
1.2.4 P-gp 的底物和抑制剂 | 第11-12页 |
1.3 本文所涉及到的模拟方法简介 | 第12-18页 |
1.3.1 同源模建 | 第12-15页 |
1.3.2 分子动力学 | 第15-16页 |
1.3.3 分子对接方法 | 第16-18页 |
1.4 本课题研究内容及选题意义 | 第18-19页 |
第二章 人的P-糖蛋白的同源模建 | 第19-45页 |
2.1 试验材料 | 第19-20页 |
2.2 计算平台 | 第20-22页 |
2.2.1 硬件平台 | 第20页 |
2.2.2 软件平台 | 第20-22页 |
2.3 试验过程 | 第22-34页 |
2.3.1 P-gp 模型的构建 | 第22-28页 |
2.3.2 模型的精修 | 第28-32页 |
2.3.3 模型的评价与分析 | 第32-34页 |
2.4 试验结果与讨论 | 第34-44页 |
2.4.1 模型优化及动力学模拟结果讨论 | 第34-35页 |
2.4.2 模型评价结果讨论 | 第35-42页 |
2.4.3 模型结构的讨论 | 第42-44页 |
2.5 本章小结 | 第44-45页 |
第三章 人的P-糖蛋白模型与配体的对接研究 | 第45-71页 |
3.1 试验材料 | 第45-47页 |
3.2 计算平台 | 第47-48页 |
3.2.1 硬件平台 | 第47页 |
3.2.2 软件平台 | 第47-48页 |
3.3 试验过程 | 第48-51页 |
3.3.1 受体蛋白的准备 | 第48页 |
3.3.2 配体分子的准备 | 第48-50页 |
3.3.3 分子对接 | 第50-51页 |
3.4 对接结果与讨论 | 第51-70页 |
3.4.1 P-gp 与配体的对接结果 | 第51-53页 |
3.4.2 P-gp 与Biricodar 对接后的动力学研究 | 第53-55页 |
3.4.3 分子对接结果分析与讨论 | 第55-70页 |
3.5 本章小结 | 第70-71页 |
第四章 结论 | 第71-72页 |
参考文献 | 第72-78页 |
附录 | 第78-81页 |
致谢 | 第81页 |