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组蛋白乙酰化酶与腺病毒E1A的复合体结构及其功能研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
目录第8-12页
Table of Contents第12-16页
第一章 前言第16-40页
    1.1 组蛋白修饰第16-17页
    1.2 组蛋白乙酰基转移酶第17-24页
        1.2.1 组蛋白乙酰转移酶的分类第17-19页
        1.2.2 p300/CBP第19-21页
        1.2.3 PCAF第21-23页
        1.2.4 Gcn5第23-24页
    1.3 核小体乙酰化酶复合物第24-26页
        1.3.1 SAGA复合物第24-26页
        1.3.2 PCAF复合物第26页
    1.4 组蛋白乙酰转移酶功能的研究进展第26-32页
        1.4.1 组蛋白乙酰转移酶与基因转录调控第26-27页
        1.4.2 组蛋白乙酰转移酶与细胞周期第27-29页
        1.4.3 组蛋白乙酰转移酶与疾病第29-32页
            1.4.3.1 组蛋白乙酰转移酶与癌症第29-31页
            1.4.3.2 组蛋白乙酚转移酶与神经系统疾病第31-32页
            1.4.3.3 组蛋白乙酰转移酶与病毒感染第32页
    1.5 腺病毒E1A的研究进展第32-39页
        1.5.1 E1A的结构及生物学特性第33-34页
        1.5.2 E1A与p300/CBP、PCAF的关系第34-36页
        1.5.3 E1A的生物学功能第36-39页
            1.5.3.1 E1A与细胞周期的关系第36-37页
            1.5.3.2 E1A与免疫系统的关系第37页
            1.5.3.3 E1A与细胞癌变的关系第37-39页
    1.6 本文的研究内容及意义第39-40页
第二章 材料与方法第40-74页
    2.1 材料与试剂第40-47页
        2.1.1 基因第40页
        2.1.2 质粒、菌株第40-43页
        2.1.3 工具酶和抗体第43-44页
        2.1.4 人工合成多肽第44页
        2.1.5 试剂第44-46页
        2.1.6 实验主要仪器第46-47页
    2.2 方法第47-74页
        2.2.1 大肠杆菌(E.coli)感受态细胞的制备和DNA转化第47-48页
            2.2.1.1 大肠杆菌感受态细胞的制备第47-48页
            2.2.1.2 质粒转化感受态细胞第48页
        2.2.2 质粒DNA的提取第48-49页
        2.2.3 质粒DNA的工具酶处理第49-50页
            2.2.3.1 DNA的限制性内切酶消化第49-50页
            2.2.3.2 线性DNA 5’端磷酸基团的去除第50页
            2.2.3.3 粘性末端连接第50页
        2.2.4 DNA的纯化第50-51页
            2.2.4.1 聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳第50-51页
            2.2.4.2 DNA片段回收第51页
        2.2.5 PCR相关实验第51-55页
            2.2.5.1 PCR反应第51-54页
            2.2.5.2 PCR产物的克隆第54页
            2.2.5.3 定点突变第54-55页
                2.2.5.3.1 定点突变引物第54-55页
                2.2.5.3.2 定点突变流程第55页
        2.2.6 重组融合蛋白的表达第55-57页
        2.2.7 蛋白的分离纯化第57-62页
            2.2.7.1 蛋白质的分离纯化方法及其原理第57-59页
            2.2.7.2 菌体细胞超声破碎第59-60页
            2.2.7.3 亲和层析第60-61页
            2.2.7.4 阳离子交换层析第61-62页
            2.2.7.5 凝胶过滤层析第62页
        2.2.8 hPCAF(493-658)蛋白突变体的表达质粒构建、表达和纯化第62-63页
        2.2.9 SDS-PAGE电泳第63-65页
            2.2.9.1 分离胶及浓缩胶的制备第63-64页
            2.2.9.2 SDS-PAGE电泳及考马斯亮蓝染色第64-65页
        2.2.10 Western blot检测体外乙酰化反应第65-66页
        2.2.11 组蛋白乙酰转移酶活性测定第66-67页
        2.2.12 化学交联反应第67-68页
        2.2.13 动态光散射实验第68-69页
        2.2.14 静态激光光散射实验第69-70页
        2.2.15 pull-down实验第70-71页
        2.2.16 蛋白质晶体生长第71-74页
第三章 结果与分析第74-117页
    3.1 人PCAF组蛋白乙酰转移酶活性区域(HAT)的同源二聚体结构研究第74-96页
        3.1.1 PCAF(493-658)融合蛋白表达质粒的构建第74-75页
        3.1.2 PCAF(493-658)蛋白的表达和纯化第75-78页
        3.1.3 PCAF(493-658)蛋白的晶体筛选、衍射数据收集及解析第78-82页
        3.1.4 PCAF(493-658)蛋白的整体结构第82-84页
        3.1.5 溶液中PCAF(493-658)蛋白的二聚化第84-90页
        3.1.6 PCAF(493-658)蛋白二聚化对其乙酰转移酶活性的影响第90-91页
        3.1.7 PCAF乙酰转移酶活性的自我抑制第91-95页
        3.1.8 小结第95-96页
    3.2 hPCAF HAT和E1A复合体第96-107页
        3.2.1 腺病毒的E1A片段的表达质粒构建第96-97页
        3.2.2 PCAF HAT和E1A的相互作用第97-100页
        3.2.3 E1A对PCAF乙酰转移酶活性的影响第100-101页
        3.2.4 PCAF HAT和E1A复合体的晶体筛选第101-107页
        3.2.5 小结第107页
    3.3 p300和E1A复合体第107-114页
        3.3.1 p300蛋白的表达质粒构建、表达和纯化第107-108页
        3.3.2 p300与E1A的相互作用第108-110页
        3.3.3 p300与E1A复合体的纯化第110-112页
        3.3.4 p300与E1A复合体的晶体初筛第112-113页
        3.3.5 小结第113-114页
    3.4 讨论第114-117页
附录1 图表索引第117-119页
附录2 缩略语及中英文对照第119-121页
参考文献第121-135页
致谢第135页

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