Acknowledgment | 第10-11页 |
Table of Contents | 第11-15页 |
List of Tables | 第15-16页 |
List of Figures | 第16-19页 |
Abstract | 第19-20页 |
摘要 | 第21-23页 |
Chapter 1 Introduction | 第23-28页 |
Chapter 2 Literature review | 第28-54页 |
2.1. Tomato bacterial wilt | 第28-38页 |
2.1.1. Economic impact & geographical distribution | 第28-30页 |
2.1.2. The Pathogen-Ralstonia solanacearum | 第30页 |
2.1.3. Pathogen classification | 第30-31页 |
2.1.4. Disease symptoms on Tomato plants | 第31-32页 |
2.1.5. Disease cycle and Epidemiology | 第32-34页 |
2.1.6. Pathogen survival forms in the environment | 第34-35页 |
2.1.7. Bacterial wilt management | 第35-38页 |
2.2. Sustainable use of Bacilli for Biocontrol | 第38-43页 |
2.2.1. Taxonomy and classification of Bacillus spp | 第40-41页 |
2.2.2. Bacillus methylotrophicus as a bioagent | 第41页 |
2.2.3. Bacillus amyloliquefaciens as a bioagent | 第41-43页 |
2.3. Mechanisms involved in PGPR bioactivity | 第43-54页 |
2.3.1. Antagonism toward phytopathogen | 第43-51页 |
2.3.1.1. Competition for root colonization | 第43-45页 |
2.3.1.2. Biofilm formation | 第45-46页 |
2.3.1.3. Siderophores production | 第46页 |
2.3.1.4. Antibiosis | 第46-48页 |
2.3.1.5. Lytic enzyme production | 第48-49页 |
2.3.1.6. Induced systemic resistance | 第49-51页 |
2.3.2. Plant growth intensification | 第51-54页 |
2.3.2.1. Biological N_2 Fixation | 第51-52页 |
2.3.2.2. Phosphor solubilization | 第52-53页 |
2.3.2.3. Phytohormones production | 第53-54页 |
Chapter 3 Characterization and evaluation of Bacillus isolates for their potential plant growth promotion andbiocontrol activities against tomato bacterial wilt | 第54-72页 |
3.1. Abstract | 第54页 |
3.2. Introduction | 第54-56页 |
3.3. Materials and Methods | 第56-61页 |
3.3.1. Isolation of potential antagonistic isolates | 第56-57页 |
3.3.2. Plant pathogen and culture conditions | 第57页 |
3.3.3. Preliminary screening for antagonistic activity in vitro | 第57页 |
3.3.4. Laboratory in vitro assay for studying antagonism | 第57-58页 |
3.3.5. Evaluation of antagonistic isolates in greenhouse | 第58-60页 |
3.3.5.1. Application by antagonistic strains | 第58-59页 |
3.3.5.2. Inoculation of R. solanacearum | 第59页 |
3.3.5.3. Disease assessment | 第59页 |
3.3.5.4. Plant growth parameters assessments | 第59-60页 |
3.3.6. Identification of selected bacterial strains | 第60-61页 |
3.3.6.1. Sequence analysis for 16S rRNA gene | 第60页 |
3.3.6.2. Fatty acid methyl esters (FAMEs) analysis | 第60-61页 |
3.3.6.3. Biochemical and physiological characterizations | 第61页 |
3.3.7. Statistical analysis | 第61页 |
3.4. Results | 第61-68页 |
3.4.1. In vitro screening of bacterial antagonistic activity | 第61页 |
3.4.2. Greenhouse study | 第61-65页 |
3.4.3. Antifungal activity of selected strains | 第65-68页 |
3.4.4. Bacterial strains identification | 第68页 |
3.5. Discussion | 第68-72页 |
Chapter 4 Synergistic effect of Acetyl salicylic acid and DL-Beta-aminobutyric acid on biocontrol efficacy ofBacillus strains against tomato bacterial wilt | 第72-92页 |
4.1. Abstract | 第72页 |
4.2. Introduction | 第72-74页 |
4.3. Materials and methods | 第74-80页 |
4.3.1. Origins of bacterial strains, plant materials and chemical inducers | 第74页 |
4.3.2. Compatibility trials | 第74页 |
4.3.3. In vitro evaluation of antagonists and plant defense inducers against R. solanacearum | 第74-75页 |
4.3.4. Pot experiments | 第75-80页 |
4.3.4.1. Biochemical analysis | 第77-79页 |
4.3.4.2. Specific detection and quantification of R. solanacearum by real-time PCR | 第79-80页 |
4.3.5. Statistical analysis | 第80页 |
4.4. Results | 第80-88页 |
4.4.1. Compatibility tests | 第80页 |
4.4.2. In vitro tests | 第80-81页 |
4.4.3. Greenhouse trials | 第81-88页 |
4.4.3.1. Effect of treatments on AUDPC and disease incidence | 第81页 |
4.4.3.2. Effect of treatments on plant growth parameters | 第81-83页 |
4.4.3.3. Biochemical analysis | 第83页 |
4.4.3.4. Native gel electrophoresis of POD and PPO | 第83-85页 |
4.4.3.5. Quantification of R. solanacearum in infected tissues by real-time PCR | 第85-88页 |
4.5. Discussion | 第88-92页 |
Chapter 5 Exploration of some bioactivity related-mechanisms of Bacillus strains in their interaction withTomato plants or with Ralstonia solanacearum | 第92-112页 |
5.1. Abstract | 第92页 |
5.2. Introduction | 第92-95页 |
5.3. Material and Methods | 第95-102页 |
5.3.1. Bacterial strains & Chitosan preparation | 第95页 |
5.3.2. In vitro detection of plant growth stimulation traits | 第95-96页 |
5.3.2.1. Indole acetic acid production | 第95页 |
5.3.2.2. Phosphate solubilization | 第95-96页 |
5.3.2.3. Siderophores production | 第96页 |
5.3.2.4. Hydrogen cyanide (HCN) production | 第96页 |
5.3.3. Biofilm assays | 第96-97页 |
5.3.4. Detection of antibacterial activity of bacillus culture filtrate | 第97-98页 |
5.3.5. Transmission electron microscopy (TEM) | 第98页 |
5.3.6. Inhibition of biofilm formation | 第98-99页 |
5.3.7. Detection of antimicrobial peptide biosynthetic genes | 第99页 |
5.3.8. Estimation of antibacterial related genes expression | 第99-100页 |
5.3.9. Greenhouse trials | 第100-102页 |
5.3.10. Statistical analysis | 第102页 |
5.4. Results | 第102-108页 |
5.4.1. PGP traits of Bacillus strains | 第102-103页 |
5.4.2. Biofilm formation | 第103-104页 |
5.4.3. Antibacterial activity of culture filtrate | 第104页 |
5.4.4. Transmission electronic microscopy (TEM) | 第104-105页 |
5.4.5. Inhibitory effect on Biofilm formation | 第105-106页 |
5.4.6. Detection of lipopeptides biosynthetic genes | 第106页 |
5.4.7. Quantification of expression levels of lipopeptides biosynthetic genes | 第106-107页 |
5.4.8. Greenhouse experiments | 第107-108页 |
5.5. Discussion | 第108-112页 |
General conclusions | 第112-113页 |
References | 第113-142页 |
List of Publications | 第142页 |