摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
1 绪论 | 第8-15页 |
1.1 物种鉴定的意义 | 第8-9页 |
1.2 物种鉴定的原理 | 第9页 |
1.3 基于DNA的物种鉴定技术 | 第9-13页 |
1.3.1 DNA条形码技术 | 第11-13页 |
1.3.2 “双重比较”法的优点 | 第13页 |
1.4 基于似然法的物种鉴定思路 | 第13-15页 |
2 材料与方法 | 第15-23页 |
2.1 基于似然法进行物种鉴定的技术路线概述 | 第15-17页 |
2.1.1 参照序列库的构建 | 第15页 |
2.1.2 碱基频率的计算 | 第15页 |
2.1.3 物种所属似然值的计算 | 第15页 |
2.1.4 物种认定与排除的判别标准建立 | 第15-17页 |
2.2 似然法物种鉴定思路的实验验证 | 第17-23页 |
2.2.1 王锦蛇序列的测定与用途 | 第18-19页 |
2.2.2 其余物种标准参考序列的获得 | 第19-20页 |
2.2.3 阳性和阴性测试所用序列的来源 | 第20-21页 |
2.2.4 用于建立物种认定与排除判别标准的序列来源 | 第21-23页 |
3 结果 | 第23-46页 |
3.1 同源性与系统发育关系分析对近缘物种鉴别的能力 | 第23-25页 |
3.2 基于似然法的物种鉴定 | 第25-46页 |
3.2.1 SNP位点的获得与选择 | 第25-26页 |
3.2.2 6 种库内锦蛇SNP位点碱基频率的统计 | 第26-37页 |
3.2.3 Cyt b序列鉴别力的预评估 | 第37-42页 |
3.2.4 物种认定与排除的判别标准建立 | 第42-43页 |
3.2.5 赤峰锦蛇的特例情况 | 第43-46页 |
4 讨论 | 第46-52页 |
4.1 基于似然法进行物种鉴定的有效性 | 第46-48页 |
4.1.1 用碱基频率描述物种特征的可行性 | 第46-47页 |
4.1.2 物种认定与排除判别标准的可靠性 | 第47-48页 |
4.2 近缘物种鉴定问题的突破 | 第48页 |
4.3 似然法应用于物种鉴定的影响因素 | 第48-50页 |
4.3.1 片段长度 | 第48-49页 |
4.3.2 遗传标记的选择 | 第49-50页 |
4.3.3 SNP位点的选择 | 第50页 |
4.4 似然法应用于物种鉴定的前景 | 第50-52页 |
4.4.1 方法的标准化 | 第50页 |
4.4.2 参照序列库的扩容 | 第50-52页 |
结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-58页 |
致谢 | 第58-60页 |