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似然法在物种鉴定中的可行性研究--以锦蛇属(Elaphe)Cytb基因序列为例

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 绪论第8-15页
    1.1 物种鉴定的意义第8-9页
    1.2 物种鉴定的原理第9页
    1.3 基于DNA的物种鉴定技术第9-13页
        1.3.1 DNA条形码技术第11-13页
        1.3.2 “双重比较”法的优点第13页
    1.4 基于似然法的物种鉴定思路第13-15页
2 材料与方法第15-23页
    2.1 基于似然法进行物种鉴定的技术路线概述第15-17页
        2.1.1 参照序列库的构建第15页
        2.1.2 碱基频率的计算第15页
        2.1.3 物种所属似然值的计算第15页
        2.1.4 物种认定与排除的判别标准建立第15-17页
    2.2 似然法物种鉴定思路的实验验证第17-23页
        2.2.1 王锦蛇序列的测定与用途第18-19页
        2.2.2 其余物种标准参考序列的获得第19-20页
        2.2.3 阳性和阴性测试所用序列的来源第20-21页
        2.2.4 用于建立物种认定与排除判别标准的序列来源第21-23页
3 结果第23-46页
    3.1 同源性与系统发育关系分析对近缘物种鉴别的能力第23-25页
    3.2 基于似然法的物种鉴定第25-46页
        3.2.1 SNP位点的获得与选择第25-26页
        3.2.2 6 种库内锦蛇SNP位点碱基频率的统计第26-37页
        3.2.3 Cyt b序列鉴别力的预评估第37-42页
        3.2.4 物种认定与排除的判别标准建立第42-43页
        3.2.5 赤峰锦蛇的特例情况第43-46页
4 讨论第46-52页
    4.1 基于似然法进行物种鉴定的有效性第46-48页
        4.1.1 用碱基频率描述物种特征的可行性第46-47页
        4.1.2 物种认定与排除判别标准的可靠性第47-48页
    4.2 近缘物种鉴定问题的突破第48页
    4.3 似然法应用于物种鉴定的影响因素第48-50页
        4.3.1 片段长度第48-49页
        4.3.2 遗传标记的选择第49-50页
        4.3.3 SNP位点的选择第50页
    4.4 似然法应用于物种鉴定的前景第50-52页
        4.4.1 方法的标准化第50页
        4.4.2 参照序列库的扩容第50-52页
结论第52-53页
参考文献第53-58页
致谢第58-60页

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