| 论文摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 第一节 基因表达与转录调控理论 | 第10-11页 |
| 第二节 转录因子及其协同作用 | 第11-12页 |
| 第三节 转录调控协同机制的研究意义 | 第12-13页 |
| 第四节 国内外研究现状 | 第13-15页 |
| 第五节 研究内容及文章概述 | 第15-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-22页 |
| 第一节 数据资源描述 | 第17页 |
| 第二节 位置权重矩阵的全基因组扫描 | 第17-18页 |
| 第三节 黄金标准数据集的构建 | 第18-19页 |
| 第四节 Logistic回归模型 | 第19-20页 |
| 第五节 贝叶斯理论 | 第20页 |
| 第六节 期望最大化算法 | 第20-22页 |
| 第三章 基于多种数据资源的特征得分体系构建 | 第22-27页 |
| 第一节 蛋白质相互作用得分 | 第22-23页 |
| 第二节 共同结合得分 | 第23页 |
| 第三节 距离约束得分 | 第23-24页 |
| 第四节 共表达得分 | 第24-25页 |
| 第五节 特征得分的能力评估 | 第25-27页 |
| 第四章 整合多种数据资源的贝叶斯混合模型 | 第27-33页 |
| 第一节 贝叶斯混合模型的工作原理 | 第27-28页 |
| 第二节 参数估计与模型运算 | 第28-29页 |
| 第三节 模型的评估与比较 | 第29-33页 |
| 第五章 肝细胞癌发生过程的转录协同作用研究 | 第33-40页 |
| 第一节 肝细胞癌简介 | 第33-34页 |
| 第二节 预测肝细胞癌发生过程中转录因子的协同作用 | 第34-36页 |
| 第三节 癌症相关的转录协同作用变化 | 第36-37页 |
| 第四节 转录协同网络的功能分析 | 第37-40页 |
| 第六章 讨论与总结 | 第40-43页 |
| 第一节 探讨癌变过程潜在的分子机制 | 第40-41页 |
| 第二节 总结与展望 | 第41-43页 |
| 附录 | 第43-51页 |
| 附录一 肝硬化状态下E2F1与TFAP2C调控靶基因的功能分析 | 第43-44页 |
| 附录二 肝细胞癌状态下E2F1与TP53调控靶基因的功能分析 | 第44-46页 |
| 附录三 HepG2中转录因子协同作用的黄金标准数据集 | 第46-50页 |
| 附录四 科研成果 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 后记 | 第54页 |
