功能性消化不良患者与健康人群胃内细菌基因组的分析研究
| 缩略词表 | 第6-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 前言 | 第11-13页 |
| 实验材料 | 第13-14页 |
| 实验方法 | 第14-19页 |
| 1、实验对象 | 第14页 |
| 2、标本获取及预处理 | 第14-15页 |
| 3、细菌总的 DNA 提取 | 第15-16页 |
| 4、样品稀释 | 第16页 |
| 6、PCR 产物混样并电泳纯化目的片段 | 第16页 |
| 7、建库 | 第16-17页 |
| 8、上机测序 | 第17页 |
| 9、生物信息学处理 | 第17-19页 |
| 实验结果 | 第19-39页 |
| 1、临床资料 | 第19页 |
| 2、测序质量评价 | 第19-23页 |
| 3、菌群分类学和群落结构分析 | 第23-28页 |
| 4、物种丰度聚类 | 第28-29页 |
| 5、特定物种分类树 | 第29-31页 |
| 5.1 、单个样品特定物种聚类树 | 第29-30页 |
| 5.2 、多个样品特定物种聚类树 | 第30-31页 |
| 6、 Beta 多样性分析 | 第31-39页 |
| 6.1 、Beta 多样性指数分析 | 第31-33页 |
| 6.2 、PCoA 图分析 | 第33-35页 |
| 6.3 样品聚类分析 | 第35-39页 |
| 讨论 | 第39-43页 |
| 总结 | 第43-44页 |
| 综述 | 第44-70页 |
| 概述 | 第44-45页 |
| 胃内微生态涉及的检测方法 | 第45-47页 |
| 生物信息学分析方法 | 第47-50页 |
| 胃腔菌群特征 | 第50-52页 |
| 饮食与胃内菌群 | 第52-53页 |
| H. Pylori 感染与胃内菌群关联 | 第53页 |
| 肠内营养与胃内菌群 | 第53-54页 |
| PPI 与菌内菌群 | 第54页 |
| 抗生素与胃内菌群 | 第54-55页 |
| 胃内菌群与胃部疾病 | 第55页 |
| 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-70页 |
| 附录 | 第70-74页 |
| 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
