基于集成网络的胶质母细胞瘤失调模块检测
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-20页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 国内外研究现状及动态分析 | 第15-17页 |
| 1.3 本文主要工作及组织结构 | 第17-20页 |
| 第二章 失调模块检测相关基础 | 第20-30页 |
| 2.1 相关生物数据 | 第20-26页 |
| 2.1.1 基因表达数据 | 第20-21页 |
| 2.1.2 转录因子数据 | 第21-22页 |
| 2.1.3 蛋白质磷酸化数据 | 第22-24页 |
| 2.1.4 蛋白质相互作用网络 | 第24-25页 |
| 2.1.5 基因本体数据 | 第25-26页 |
| 2.2 SAM软件 | 第26-28页 |
| 2.3 eQTL介绍 | 第28-30页 |
| 第三章 失调模块检测方法 | 第30-40页 |
| 3.1 算法概要 | 第30-31页 |
| 3.2 集成生物网络的构建 | 第31-32页 |
| 3.3 SAM筛选目标基因 | 第32-35页 |
| 3.3.1SAM方法的基本步骤 | 第32-33页 |
| 3.3.2r _i和s_i的计算方法 | 第33-34页 |
| 3.3.3 可变参数0s的估计 | 第34-35页 |
| 3.4 eQTL识别候选因果基因 | 第35-36页 |
| 3.5 随机游走检测算法 | 第36-40页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第40-56页 |
| 4.1 实验数据 | 第40-41页 |
| 4.2 结果分析验证 | 第41-56页 |
| 4.2.1 实验结果 | 第41-43页 |
| 4.2.2 统计理论分析 | 第43-46页 |
| 4.2.3 生物意义分析 | 第46-56页 |
| 第五章 总结与展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 作者简介 | 第66-67页 |
| 1.基本情况 | 第66页 |
| 2.教育背景 | 第66-67页 |
