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拟南芥MTOPVIB与PRD1互作参与减数分裂重组DNA双链断裂的形成

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
ABBREVIATIONS第12-13页
第一章 文献综述第13-42页
    1.1 拟南芥雌雄配子体的发育过程第13-16页
        1.1.1 拟南芥雄配子体的发育过程第13-14页
        1.1.2 拟南芥雌配子体的发育过程第14-16页
    1.2 减数分裂过程第16-18页
        1.2.1 减数分裂Ⅰ第17页
        1.2.2 减数分裂Ⅱ第17-18页
    1.3 减数分裂过程的重要事件及相关调控机制第18-30页
        1.3.1 染色体浓缩和姐妹染色单体黏着第19-22页
        1.3.2 同源染色体的识别和配对第22-23页
        1.3.3 联会复合体的形成第23-25页
        1.3.4 同源染色体重组第25-30页
        1.3.5 同源染色体的分离第30页
    1.4 DSB形成的调控机制第30-37页
        1.4.1 酵母中的DSB形成机制第31-34页
        1.4.2 动物中DSB形成相关蛋白第34-35页
        1.4.3 植物中DSB形成相关蛋白第35-37页
    1.5 SPO11及其与古生菌中拓朴异构酶Ⅵ的关系第37-41页
        1.5.1 拓扑异构酶Ⅵ第37-39页
        1.5.2 SPO11第39-41页
    1.6 本论文的立项依据和研究意义第41-42页
第二章 实验材料和方法第42-71页
    2.1 实验材料第42-43页
        2.1.1 植物材料第42页
        2.1.2 菌株第42页
        2.1.3 质粒载体第42页
        2.1.4 工具酶、试剂盒和常用试剂第42-43页
    2.2 实验仪器第43页
    2.3 常用培养基和溶液的配制第43-48页
        2.3.1 常用培养基的配制第43-46页
        2.3.2 常用溶液的配制第46-48页
    2.4 突变体的筛选和鉴定第48-53页
        2.4.1 拟南芥的种植与管理第48-49页
        2.4.2 植物基因组DNA的提取(Edwards法)第49-50页
        2.4.3 热不对称交错聚合酶链反应(TAIL-PCR)分析第50-52页
        2.4.4 拟南芥突变体相关基因的图位克隆第52-53页
    2.5 植物RNA的提取以及相关实验第53-57页
        2.5.1 拟南芥总RNA的提取方法第53-55页
        2.5.2 cDNA的合成第55页
        2.5.3 半定量RT-PCR分析第55-56页
        2.5.4 实时定量荧光PCR (Real-time PCR)第56-57页
    2.6 载体的构建第57-62页
        2.6.1 目的基因的扩增第57-58页
        2.6.2 从琼脂糖凝胶中回收DNA第58页
        2.6.3 DNA片段的连接第58-59页
        2.6.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第59页
        2.6.5 大肠杆菌热激转化第59页
        2.6.6 重组质粒的筛选和鉴定第59-62页
    2.7 农杆菌介导的拟南芥转化第62-63页
        2.7.1 农杆菌感受态细胞的制备第62页
        2.7.2 农杆菌的电击转化和鉴定第62页
        2.7.3 农杆菌浸染拟南芥第62-63页
    2.8 拟南芥雌雄配子体及减数分裂相关表型分析第63-68页
        2.8.1 拟南芥雌配子体发育进程观察第63页
        2.8.2 Alexander染色第63-64页
        2.8.3 DAPI染色第64页
        2.8.4 扫描电子显微镜观察拟南芥花粉第64页
        2.8.5 拟南芥染色体展片实验第64-65页
        2.8.6 荧光原位杂交(FISH)分析第65-66页
        2.8.7 免疫荧光实验第66-67页
        2.8.8 拟南芥的正反交实验与双突变体的构建第67页
        2.8.9 突变体的等位分析和重组率分析第67-68页
    2.9 蛋白质互作相关的实验第68-71页
        2.9.1 酵母双杂交(Y2H)和酵母三杂交(Y3H)实验第68-69页
        2.9.2 基因枪转化、瞬时表达和荧光双分子互补(BiFC)实验第69-71页
第三章 实验结果第71-113页
    3.1 mt187突变体的筛选及突变位点的寻找第71-77页
        3.1.1 TAIL-PCR寻找突变位点第71-72页
        3.1.2 遗传分析表明mt187的表型与Ds的插入位点不连锁第72页
        3.1.3 图位克隆显示mt187育性降低的表型是由AT1G60460突变导致第72-73页
        3.1.4 mtopVIB突变体中MTOPVIB基因表达水平分析第73-76页
        3.1.5 mtopVIB突变体结实率降低第76-77页
        3.1.6 mtopVIB突变体的等位分析第77页
    3.2 MTOPVIB基因的克隆和mtop VIB突变体的互补实验第77-78页
    3.3 mtopVIB突变体的遗传分析第78-80页
    3.4 mtopVIB突变体雌雄配子体的表型观察第80-86页
        3.4.1 mtopVIB突变体雌配子体发育观察第80-81页
        3.4.2 mtopVIB突变体雄配子体的表型观察第81-86页
    3.5 mtopVIB突变体的减数分裂过程观察第86-89页
        3.5.1 mtopVIB突变体的雄性减数分裂观察第86-88页
        3.5.2 mtopVIB突变体的雌性减数分裂观察第88-89页
    3.6 mtopVIB突变体中染色体的配对、联会和重组分析第89-93页
        3.6.1 mtopVIB突变体的染色体配对分析第89-91页
        3.6.2 mtopVIB突变体的染色体联会分析第91-92页
        3.6.3 mtopVIB突变体的同源重组分析第92-93页
    3.7 MTOPVIB基因及蛋白特点第93-98页
        3.7.1 MTOPVIB基因表达模式分析及其蛋白定位分析第93-94页
        3.7.2 MTOPVIB蛋白在植物物种中保守性较高第94-98页
    3.8 MTOPVIB参与DSB形成过程第98-99页
    3.9 DSB形成相关基因的表达模式及mtopVIB中减数分裂相关基因表达水平的分析第99-101页
    3.10 MTOPVIB与DSB相关蛋白以及DSB蛋白之间的互作关系第101-113页
        3.10.1 MTOPVIB与SPO11-1、SPO11-2互作,形成Topo Ⅵ类似复合体第101-104页
        3.10.2 AtPRD1与Topo Ⅵ类似复合体各组分互作第104-108页
        3.10.3 AtPRD1与AtDFO和AtPRD3互作形成小复合体第108-110页
        3.10.4 AtPRD1具体功能分析第110-113页
第四章 结论、讨论和展望第113-122页
    4.1 总结与结论第113-114页
    4.2 讨论第114-118页
        4.2.1 MTOPVIB在减数分裂的DSB形成中起作用第114-115页
        4.2.2 MTOPVIB基因可能受到转录后调控第115页
        4.2.3 MTOPVIB蛋白在进化中构象保守第115-116页
        4.2.4 MTOPVIB与AtPRD1互作共同参与DSB形成第116-117页
        4.2.5 本文中的工作与science文章Vrielynck et al.(2016)的工作对比第117-118页
    4.3 还需要完善的问题与展望第118-122页
        4.3.1 MTOPVIB与AtSPO11-1和AtSPO11-2互作形成的Topo Ⅵ类似复合体是否具有断裂DNA的功能第118-119页
        4.3.2 AtPRD1与AtPRD3和AtDFO蛋白形成的小复合体是否可以促进形成TopoⅥ类似复合体的功能第119页
        4.3.3 在Atprd1突变体中Topo Ⅵ类似复合体、AtPRD3和AtDFO的定位是否正常第119-120页
        4.3.4 寻找更多参与DSB形成过程的蛋白第120-122页
参考文献第122-138页
附录第138-151页
    表1. mt系列相关突变体的TAIL-PCR及表型分析第138-139页
    表2. 引物列表1第139-140页
    表3. 引物列表2第140-141页
    表4. 引物列表3第141-143页
    表5. 引物列表4第143-146页
    表6. 引物列表5第146-148页
    表7. 引物列表6第148-149页
    表8. 引物列表7第149-150页
    表9. 引物列表8第150-151页
致谢第151-154页
个人简历第154页

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