| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 缩略语表(Abbreviation) | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 石刁柏的研究概况 | 第12-13页 |
| 1.2 SSR的研究概况 | 第13-21页 |
| 1.2.1 SSR的特点 | 第13-14页 |
| 1.2.2 真核生物中SSR的功能与应用 | 第14-17页 |
| 1.2.3 SSR标记开发的主要方法 | 第17-21页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-30页 |
| 2.1 材料 | 第22-25页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第22页 |
| 2.1.2 菌株和载体 | 第22页 |
| 2.1.3 引物 | 第22-23页 |
| 2.1.4 主要试剂及药品 | 第23页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第23-24页 |
| 2.1.6 主要试剂配制 | 第24-25页 |
| 2.2 方法 | 第25-28页 |
| 2.2.1 石刁柏基因组DNA的提取（2×CTAB法）及检测 | 第25页 |
| 2.2.2 石刁柏雌雄的鉴定 | 第25页 |
| 2.2.3 石刁柏基因组SSR序列挖掘 | 第25-26页 |
| 2.2.4 石刁柏的SSR扩增 | 第26页 |
| 2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第26-27页 |
| 2.2.6 差异片段回收 | 第27页 |
| 2.2.7 目的片段克隆 | 第27-28页 |
| 2.2.8 目的片段测序 | 第28页 |
| 2.3 数据统计分析 | 第28-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-53页 |
| 3.1 石刁柏基因组序列SSR生物信息学分析 | 第30-37页 |
| 3.1.1 石刁柏基因组序列中SSR基元类型和比例 | 第31-35页 |
| 3.1.2 石刁柏基因组中SSR重复次数的分布 | 第35-37页 |
| 3.2 基于石刁柏基因组SSR分子标记的遗传多样性分析 | 第37-51页 |
| 3.2.1 石刁柏基因组SSR引物筛选 | 第37-40页 |
| 3.2.2 石刁柏遗传多样性分析 | 第40-51页 |
| 3.3 石刁柏性别连锁SSR标记的初步鉴定 | 第51-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| 4.1 采用高通量测序数据进行SSR标记开发 | 第53页 |
| 4.2 石刁柏基因组SSR分布特点 | 第53-54页 |
| 4.3 基于SSR分子标记的石刁柏品种遗传多样性分析 | 第54-55页 |
| 4.4 性别特异的石刁柏SSR分子标记的开发 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第66-67页 |
