| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-44页 |
| 1.1 长非编码RNA研究现状 | 第12-36页 |
| 1.1.1 lnc RNA与X染色体失活 | 第12-15页 |
| 1.1.2 lnc RNA与基因印记 | 第15-17页 |
| 1.1.3 lnc RNA与Hox基因簇调控 | 第17-20页 |
| 1.1.4 lnc RNA与卵裂期染色中心形成 | 第20-23页 |
| 1.1.5 lnc RNA与神经命运特化 | 第23-25页 |
| 1.1.6 lnc RNA与ES多能性维持及分化 | 第25-27页 |
| 1.1.7 lnc RNA与疾病 | 第27-31页 |
| 1.1.8 lnc RNA与凋亡及细胞周期调控 | 第31-35页 |
| 1.1.9 lnc RNA与免疫 | 第35-36页 |
| 1.1.10 lnc RNA与线粒体调节 | 第36页 |
| 1.2 lnc RNA调控的机制 | 第36-39页 |
| 1.2.1 lnc RNA参与转录前调控 | 第36页 |
| 1.2.2 lnc RNA参与转录调控 | 第36-39页 |
| 1.2.3 lnc RNA参与转录后调控 | 第39页 |
| 1.3 内源逆转录病毒 | 第39-43页 |
| 1.3.1 内源逆转录病毒元件作为启动子或增强子或poly A | 第40-41页 |
| 1.3.2 内源逆转录病毒元件表达病毒蛋白参与细胞功能 | 第41-42页 |
| 1.3.3 内源逆转录病毒相关转录本 | 第42-43页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第43-44页 |
| 2 材料与方法 | 第44-72页 |
| 2.1 实验材料 | 第44-49页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第44页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第44-45页 |
| 2.1.3 主要试剂及试剂盒 | 第45-46页 |
| 2.1.4 主要抗体 | 第46-47页 |
| 2.1.5 常用试剂及配制 | 第47-48页 |
| 2.1.6 主要的生物分析软件及网站 | 第48-49页 |
| 2.2 实验方法 | 第49-72页 |
| 2.2.1 半随机扩增筛选ERV相关lnc RNA | 第49-50页 |
| 2.2.2 链特异性PCR | 第50-51页 |
| 2.2.3 亚细胞定位分析 | 第51页 |
| 2.2.4 表达模式分析 | 第51-52页 |
| 2.2.5 5'RACE | 第52-56页 |
| 2.2.6 3'RACE | 第56页 |
| 2.2.7 RNA-FISH | 第56-57页 |
| 2.2.8 DNA-FISH | 第57-58页 |
| 2.2.9 胚胎Brd U免疫荧光检测 | 第58页 |
| 2.2.10 胚胎EU检测 | 第58-59页 |
| 2.2.11 mi RNA reverse Northern Blot | 第59-61页 |
| 2.2.12 RNA pulldown | 第61-65页 |
| 2.2.14 RNA干扰 | 第65页 |
| 2.2.15 低起始量RNA-seq | 第65-68页 |
| 2.2.16 选择性剪切验证 | 第68-72页 |
| 3 结果与分析 | 第72-106页 |
| 3.1 筛选出36个未知转录本 | 第72-82页 |
| 3.1.1 半随机扩增 | 第72页 |
| 3.1.2 UCSC比对筛选位置转录本 | 第72-75页 |
| 3.1.3 部分新转录本在着床前胚胎表达模式分析 | 第75-82页 |
| 3.2 lnc-GET及Dyei是lnc RNA | 第82-87页 |
| 3.2.1 lnc-GET及Dyei的全长分析 | 第82-83页 |
| 3.2.2 lnc-GET及Dyei的蛋白编码能力分析 | 第83-85页 |
| 3.2.3 lnc-GET及Dyei不是pri-mi RNA | 第85-87页 |
| 3.3 lnc-GET及Dyei的表达模式分析 | 第87-89页 |
| 3.4 干扰Dyei不影响小鼠着床前胚胎发育 | 第89-90页 |
| 3.5 干扰lnc-GET导致小鼠胚胎发育阻滞于 2-细胞晚期G2期 | 第90-92页 |
| 3.6 lnc-GET干扰阻滞 2-细胞的特征 | 第92-95页 |
| 3.7 lnc-GET与ILF2、hn RNP U、DAZAP1、FUBP1互作 | 第95-98页 |
| 3.8 lnc-GET可能通过调控转录及RNA剪切实现其功能 | 第98-106页 |
| 4 讨论 | 第106-110页 |
| 4.1 lnc RNA的半随机扩增筛选 | 第106页 |
| 4.2 ERV在着床前胚胎内的功能 | 第106-108页 |
| 4.3 lnc-GET的转录调控机制类似增强字样lnc RNA | 第108页 |
| 4.4 lnc-GET与CARM1的互作 | 第108页 |
| 4.5 lnc-GET与选择性剪切 | 第108-109页 |
| 4.6 lnc-GET的过表达 | 第109-110页 |
| 5 结论 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-130页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第130页 |
