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基于RNA-Seq技术分析小麦矮缩病毒侵染后小麦的基因表达差异

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
英文缩略表第10-11页
第一章 引言第11-23页
    1.1 小麦矮缩病毒概述第11-13页
        1.1.1 WDV的分类地位及危害第11-12页
        1.1.2 WDV的复制及转录调控第12-13页
    1.2 植物病毒诱导症状形成的分子机制第13-17页
        1.2.1 病毒与寄主植物互作诱发症状形成第13-15页
        1.2.2 miRNA等与症状形成的关系第15-17页
    1.3 高通量测序技术及侵染性克隆在植物与病毒研究中的应用第17-22页
        1.3.1 高通量测序技术在研究植物与病毒及其互作关系中的应用第17-20页
        1.3.2 侵染性克隆在病毒研究中的应用第20-22页
    1.4 本研究的目的及意义第22-23页
第二章 小麦矮缩病毒侵染小麦的转录组测序及差异表达基因分析第23-43页
    2.1 材料与方法第23-25页
        2.1.1 材料第23页
        2.1.2 方法第23-25页
    2.2 结果与分析第25-39页
        2.2.1 小麦转录组数据的处理与生物信息学分析第25-34页
        2.2.2 目标基因的选择第34-36页
        2.2.3 荧光定量PCR方法对差异表达基因的验证第36-39页
    2.3 总结与讨论第39-43页
        2.3.1 WDV诱导寄主矮化症状的原因分析第40页
        2.3.2 WDV诱导感病寄主分蘖异常的原因分析第40-41页
        2.3.3 WDV侵染对寄主光合作用的影响第41页
        2.3.4 WDV侵染以后寄主防御机制的启动第41-43页
第三章 小麦矮缩病毒侵染诱导寄主miRNA差异表达的初步分析第43-49页
    3.1 材料与方法第43页
        3.1.1 材料第43页
        3.1.2 方法第43页
    3.2 结果与分析第43-47页
        3.2.1 miRNA表达量的计算及差异表达miRNA的筛选第43-44页
        3.2.2 差异表达miRNA的靶基因预测第44-46页
        3.2.3 差异基因与差异miRNA的负相关联合分析第46-47页
        3.2.4 miRNA调控靶基因的网络构建第47页
    3.3 总结与讨论第47-49页
第四章 小麦矮缩病毒中国分离物侵染性克隆的构建第49-62页
    4.1 材料与方法第49-54页
        4.1.1 材料第49页
        4.1.2 方法第49-54页
    4.2 结果与分析第54-61页
        4.2.1 侵染性克隆表达载体的构建第54-58页
        4.2.2 农杆菌针刺法侵染小麦及病毒检测第58-61页
    4.3 总结与讨论第61-62页
第五章 全文结论与展望第62-64页
    5.1 结论第62-63页
    5.2 展望第63-64页
参考文献第64-71页
附录第71-74页
致谢第74-75页
作者简历第75页

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