摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第一章 前言 | 第10-21页 |
1.1 转录组及转录组测序技术 | 第10-14页 |
1.1.1 转录组 | 第10-12页 |
1.1.2 转录组测序技术 | 第12-13页 |
1.1.3 绞股蓝转录组研究进展 | 第13-14页 |
1.2 绞股蓝皂苷合成途径 | 第14-19页 |
1.2.1 绞股蓝的主要活性成分 | 第14-16页 |
1.2.2 三萜皂苷的生物合成 | 第16-17页 |
1.2.3 氧化鲨烯环化酶 | 第17-19页 |
1.3 绞股蓝转录组及途径解析研究目的及意义 | 第19-21页 |
第二章 研究材料及方法 | 第21-36页 |
2.1 材料、试剂与设备 | 第21-24页 |
2.1.1 实验材料 | 第21页 |
2.1.2 试剂 | 第21-23页 |
2.1.3 主要设备 | 第23-24页 |
2.2 实验方法 | 第24-36页 |
2.2.1 cDNA的获取 | 第24-26页 |
2.2.1.1 样品处理 | 第24页 |
2.2.1.2 RNA提取及高通量测序 | 第24-25页 |
2.2.1.3 反转录 | 第25-26页 |
2.2.2 实时荧光定量PCR | 第26-27页 |
2.2.3 目的基因获取 | 第27-31页 |
2.2.3.1 引物设计 | 第27-29页 |
2.2.3.2 候选OSCs基因扩增 | 第29页 |
2.2.3.3 PCR产物琼脂糖凝胶回收 | 第29-30页 |
2.2.3.4 胶回收产物连接到T载体 | 第30页 |
2.2.3.5 大肠杆菌转化及阳性克隆筛选 | 第30-31页 |
2.2.4 目的基因连接到表达载体 | 第31-33页 |
2.2.4.1 质粒提取 | 第31-32页 |
2.2.4.2 对目的基因添加酶切位点 | 第32-33页 |
2.2.4.3 目的基因双酶切连接到表达载体 | 第33页 |
2.2.5 目的基因转化酿酒酵母 | 第33-34页 |
2.2.6 诱导目的基因表达 | 第34页 |
2.2.7 产物提取及检测 | 第34-36页 |
第三章 结果 | 第36-58页 |
3.1 基于Illumina二代测序平台的绞股蓝转录组分析 | 第36-42页 |
3.1.1 预处理及测序数据质量评估 | 第36-37页 |
3.1.2 转录本组装 | 第37-38页 |
3.1.3 基因功能注释 | 第38-41页 |
3.1.4 差异表达分析 | 第41-42页 |
3.2 候选OSCs的获取及生物信息学分析 | 第42-47页 |
3.2.1 OSCs候选基因的筛选 | 第42-43页 |
3.2.2 OSCs生物信息学分析 | 第43-47页 |
3.3 OSCs的实时荧光定量PCR分析 | 第47-49页 |
3.3.1 OSCs在绞股蓝不同部位的表达分析 | 第47-48页 |
3.3.2 MeJA诱导不同时间的OSCs表达分析 | 第48-49页 |
3.4 候选OSCs基因在酵母中表达及酶活性检测 | 第49-58页 |
3.4.1 表达载体的构建 | 第49-52页 |
3.4.2 候选OSCs在酵母中的诱导表达 | 第52页 |
3.4.3 候选OSCs表达产物的检测 | 第52-58页 |
第四章 讨论 | 第58-60页 |
第五章 结论 | 第60-61页 |
参考文献 | 第61-71页 |
缩略词 | 第71-73页 |
附录 | 第73-94页 |
致谢 | 第94-95页 |
作者简介 | 第95-96页 |