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基于转录组分析的绞股蓝氧化鲨烯环化酶的挖掘与鉴定

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 前言第10-21页
    1.1 转录组及转录组测序技术第10-14页
        1.1.1 转录组第10-12页
        1.1.2 转录组测序技术第12-13页
        1.1.3 绞股蓝转录组研究进展第13-14页
    1.2 绞股蓝皂苷合成途径第14-19页
        1.2.1 绞股蓝的主要活性成分第14-16页
        1.2.2 三萜皂苷的生物合成第16-17页
        1.2.3 氧化鲨烯环化酶第17-19页
    1.3 绞股蓝转录组及途径解析研究目的及意义第19-21页
第二章 研究材料及方法第21-36页
    2.1 材料、试剂与设备第21-24页
        2.1.1 实验材料第21页
        2.1.2 试剂第21-23页
        2.1.3 主要设备第23-24页
    2.2 实验方法第24-36页
        2.2.1 cDNA的获取第24-26页
            2.2.1.1 样品处理第24页
            2.2.1.2 RNA提取及高通量测序第24-25页
            2.2.1.3 反转录第25-26页
        2.2.2 实时荧光定量PCR第26-27页
        2.2.3 目的基因获取第27-31页
            2.2.3.1 引物设计第27-29页
            2.2.3.2 候选OSCs基因扩增第29页
            2.2.3.3 PCR产物琼脂糖凝胶回收第29-30页
            2.2.3.4 胶回收产物连接到T载体第30页
            2.2.3.5 大肠杆菌转化及阳性克隆筛选第30-31页
        2.2.4 目的基因连接到表达载体第31-33页
            2.2.4.1 质粒提取第31-32页
            2.2.4.2 对目的基因添加酶切位点第32-33页
            2.2.4.3 目的基因双酶切连接到表达载体第33页
        2.2.5 目的基因转化酿酒酵母第33-34页
        2.2.6 诱导目的基因表达第34页
        2.2.7 产物提取及检测第34-36页
第三章 结果第36-58页
    3.1 基于Illumina二代测序平台的绞股蓝转录组分析第36-42页
        3.1.1 预处理及测序数据质量评估第36-37页
        3.1.2 转录本组装第37-38页
        3.1.3 基因功能注释第38-41页
        3.1.4 差异表达分析第41-42页
    3.2 候选OSCs的获取及生物信息学分析第42-47页
        3.2.1 OSCs候选基因的筛选第42-43页
        3.2.2 OSCs生物信息学分析第43-47页
    3.3 OSCs的实时荧光定量PCR分析第47-49页
        3.3.1 OSCs在绞股蓝不同部位的表达分析第47-48页
        3.3.2 MeJA诱导不同时间的OSCs表达分析第48-49页
    3.4 候选OSCs基因在酵母中表达及酶活性检测第49-58页
        3.4.1 表达载体的构建第49-52页
        3.4.2 候选OSCs在酵母中的诱导表达第52页
        3.4.3 候选OSCs表达产物的检测第52-58页
第四章 讨论第58-60页
第五章 结论第60-61页
参考文献第61-71页
缩略词第71-73页
附录第73-94页
致谢第94-95页
作者简介第95-96页

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