| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第11-16页 |
| 1.1 植物在盐胁迫下的响应 | 第11-14页 |
| 1.1.1 植物在糖代谢方面的响应 | 第11页 |
| 1.1.2 植物在信号转导方面的响应 | 第11-12页 |
| 1.1.3 植物在离子平衡方面的响应 | 第12页 |
| 1.1.4 植物在氧化还原方面的响应 | 第12-14页 |
| 1.2 转录组测序在阐明盐胁迫机理中的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2.1 转录组测序的原理 | 第14页 |
| 1.2.2 转录组测序在阐明植物盐胁迫响应机制中的应用现状及前景 | 第14-15页 |
| 1.3 石竹科石竹属植物在盐胁迫下响应机理的研究现状 | 第15页 |
| 1.4 本研究目的意义 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-20页 |
| 2.1 试验材料 | 第16页 |
| 2.2 试验处理 | 第16页 |
| 2.3 石竹RNA提取 | 第16-17页 |
| 2.4 cDNA文库的构建和Illumina HiSeq/MiSeq测序 | 第17页 |
| 2.5 测序结果分析 | 第17-18页 |
| 2.5.1 生物信息分析流程 | 第17-18页 |
| 2.5.2 原始序列数据拼接、组装 | 第18页 |
| 2.5.3 基因功能注释 | 第18页 |
| 2.5.4 基因表达水平及差异基因分析 | 第18页 |
| 2.5.5 盐胁迫下诱导基因的筛选及分析 | 第18页 |
| 2.6 Real-Time PCR检测 | 第18-19页 |
| 2.7 延长盐胁迫时间对中国石竹幼苗的处理 | 第19-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-30页 |
| 3.1 盐胁迫及去除盐胁迫后中国石竹总RNA电泳检测 | 第20页 |
| 3.2 测序数据分析 | 第20-27页 |
| 3.2.1 基因组组装及分析 | 第20-21页 |
| 3.2.2 基因注释及富集分析 | 第21-24页 |
| 3.2.3 差异表达基因的筛选 | 第24-27页 |
| 3.3 筛选的差异表达基因的RT-PCR检测验证 | 第27-28页 |
| 3.4 延长盐胁迫时间对筛选的差异表达基因的影响 | 第28-30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| 4.1 盐胁迫下中国石竹转录组测序、组装及差异基因的聚类分析 | 第30页 |
| 4.2 中国石竹不同器官在短期盐胁迫下的差异基因筛选响应途径 | 第30-31页 |
| 4.3 中国石竹中参与氧化还原过程的基因在盐胁迫下的作用模式 | 第31-32页 |
| 5 结论 | 第32-33页 |
| 致谢 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-41页 |
| 附录 | 第41-45页 |
| 作者简介 | 第45页 |
