| 中文摘要 | 第4-5页 |
| 英文摘要 | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 鸮形目鸟类概述 | 第8-11页 |
| 1.1.1 鸮形目鸟类的分类及系统发育 | 第8-10页 |
| 1.1.2 鸮形目鸟类听觉的生物学概述 | 第10页 |
| 1.1.3 鸮形目鸟类听觉系统特化 | 第10-11页 |
| 1.2 耳蜗 | 第11页 |
| 1.3 听觉基因分子进化研究现状 | 第11页 |
| 1.4 转录组测序技术概述 | 第11-12页 |
| 1.5 研究问题 | 第12-13页 |
| 第二章 材料与方法 | 第13-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第13-16页 |
| 2.1.1 研究对象 | 第13-15页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第15页 |
| 2.1.3 实验耗材 | 第15-16页 |
| 2.1.4 实验试剂 | 第16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-18页 |
| 2.2.1 组织材料的获取 | 第16-17页 |
| 2.2.1.1 试剂配置 | 第16-17页 |
| 2.2.1.2 实验器具的处理与准备 | 第17页 |
| 2.2.1.3 耳蜗的获取过程 | 第17页 |
| 2.2.2 转录组测序实验操作流程 | 第17-18页 |
| 2.2.2.1 总RNA的提取 | 第17页 |
| 2.2.2.2 cDNA文库构建 | 第17-18页 |
| 2.2.3 转录组测序序列结果分析流程 | 第18页 |
| 2.2.3.1 初始数据的质量评估、数据统计和和拼接 | 第18页 |
| 2.2.3.2 基因注释 | 第18页 |
| 2.3 数据处理与分析 | 第18-22页 |
| 2.3.1 基因信息的确定 | 第18-19页 |
| 2.3.2 序列的处理 | 第19页 |
| 2.3.3 基因选择压力的分析 | 第19-21页 |
| 2.3.4 构建系统发育树 | 第21-22页 |
| 第三章 结果与分析 | 第22-33页 |
| 3.1 转录组测序结果 | 第22页 |
| 3.2 基因信息确定的结果 | 第22页 |
| 3.3 序列处理的结果 | 第22-23页 |
| 3.4 基因选择压力的分析结果 | 第23-28页 |
| 3.4.1 USH1G基因选择压力的分析结果 | 第23-26页 |
| 3.4.1.1 枝模型的分析结果 | 第23-24页 |
| 3.4.1.2 枝-位点模型的分析结果 | 第24-25页 |
| 3.4.1.3 Clade C模型的分析结果 | 第25-26页 |
| 3.4.2 LOXHD1基因选择压力的分析结果 | 第26-28页 |
| 3.4.2.1 枝模型的分析结果 | 第26-27页 |
| 3.4.2.2 枝-位点模型的分析结果 | 第27-28页 |
| 3.4.2.3 Clade C模型的分析结果 | 第28页 |
| 3.5 系统发育树 | 第28-33页 |
| 3.5.1 USH1G基因系统发育树 | 第28-29页 |
| 3.5.2 LOXHD1基因系统发育树构建结果 | 第29-33页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第33-35页 |
| 4.1 讨论 | 第33-34页 |
| 4.2 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-40页 |
| 致谢 | 第40页 |