| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-21页 |
| 1.1.1 传统中药材鉴定方法 | 第13-15页 |
| 1.1.2 中药材DNA条形码的研究现状 | 第15-17页 |
| 1.1.3 ITS2二级结构的优势及其重要性 | 第17-21页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第21-22页 |
| 技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.2 实验试剂及仪器 | 第25-26页 |
| 2.2.1 实验试剂 | 第25-26页 |
| 2.2.2 实验仪器及设备 | 第26页 |
| 2.3 实验方法 | 第26-29页 |
| 2.3.1 ITS序列的获取 | 第26-27页 |
| 2.3.2 ITS2序列界定及序列比对 | 第27页 |
| 2.3.3 ITS2二级结构预测 | 第27页 |
| 2.3.4 二级结构信息编码 | 第27-28页 |
| 2.3.5 系统发育分析 | 第28页 |
| 2.3.6 统计学分析 | 第28-29页 |
| 第三章 结果与分析 | 第29-54页 |
| 3.1 ITS2二级结构在低分类阶元的研究结果 | 第29-45页 |
| 3.1.1 LocARNA预测的二级结构模型 | 第29-30页 |
| 3.1.2 常规序列比对与LocARNA产生的序列比对间的差异 | 第30-34页 |
| 3.1.3 二级结构矩阵中新增系统发育信息 | 第34-36页 |
| 3.1.4 系统学分析 | 第36-41页 |
| 3.1.5 遗传距离分析 | 第41-42页 |
| 3.1.6 各大目中二级结构系统发育分析数据比较 | 第42-45页 |
| 3.2 ITS2二级结构在高分类阶元的研究结果 | 第45-48页 |
| 3.2.1 LocARNA预测的二级结构模型 | 第45页 |
| 3.2.2 LocARNA与Clustal X软件序列比对结果比较 | 第45-46页 |
| 3.2.3 系统学分析 | 第46-48页 |
| 3.3 ITS2二级结构在茄属和"木通"DNA条形码鉴定中应用的具体实例 | 第48-52页 |
| 3.3.1 ITS2二级结构在茄属药用植物DNA条形码鉴定中的应用 | 第48-50页 |
| 3.3.2 ITS2二级结构在中药材木通DNA条形码鉴定中的应用 | 第50-52页 |
| 本章小结 | 第52-54页 |
| 第四章 讨论 | 第54-64页 |
| 4.1 ITS2二级结构信息在提高ITS2物种分辨率中的价值 | 第54-57页 |
| 4.2 基于二级结构信息对比的ITS2在高分类阶元系统发育分析中的价值 | 第57-59页 |
| 4.3 ITS2二级结构信息能够显著提高系统树的可靠性与准确性 | 第59-60页 |
| 4.4 ITS2二级结构信息应该被加入到药用植物DNA条形码鉴定中 | 第60-62页 |
| 4.5 ITS2序列-结构双信息联合分析法 | 第62-64页 |
| 第五章 总结与展望 | 第64-67页 |
| 5.1 总结 | 第64-65页 |
| 5.2 本研究创新点 | 第65页 |
| 5.3 展望 | 第65-67页 |
| 附录 | 第67-147页 |
| 参考文献 | 第147-154页 |
| 致谢 | 第154-156页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第156-157页 |
| 附件 | 第157页 |
