CD4结合对HIV-1 gp120结构动力学的影响
摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 研究背景 | 第10-16页 |
1.1 艾滋病毒概述 | 第10-12页 |
1.2 艾滋病毒基因组结构及致病机制 | 第12-14页 |
1.2.1 艾滋病毒基因结构 | 第12-13页 |
1.2.2 致病机制研究 | 第13-14页 |
1.3 艾滋病毒的免疫逃避机制 | 第14-15页 |
1.4 研究的目的与意义 | 第15-16页 |
第二章 材料与方法 | 第16-22页 |
2.1 结构的准备 | 第16-17页 |
2.2 分子动力学模拟 | 第17-20页 |
2.2.1 分子动力学概述 | 第17-18页 |
2.2.2 能量最小化 | 第18页 |
2.2.3 分子动力学模拟参数设定 | 第18-20页 |
2.3 本质动力学理论 | 第20-22页 |
2.3.1 本质动力学概述 | 第20-21页 |
2.3.2 组合本质动力学 | 第21页 |
2.3.3 本质动力学分析技术 | 第21-22页 |
第三章 结果和讨论 | 第22-36页 |
3.1 模拟轨迹的稳定性评估 | 第22-23页 |
3.2 结构性质与几何性质比较 | 第23-25页 |
3.3 构象柔性 | 第25-27页 |
3.4 本质动力学 | 第27-29页 |
3.5 CD4结合对gp120分子运动的影响 | 第29-31页 |
3.6 CD4结合对gp120构象柔性的影响 | 第31-33页 |
3.7 gp120结合态的分子运动 | 第33-36页 |
第四章 结论 | 第36-38页 |
附录 | 第38-41页 |
附录1 文中主要专业名词及缩略语 | 第38-39页 |
附录2 动力学模拟过程中所用的mdp文件参数 | 第39-41页 |
参考文献 | 第41-44页 |
攻读硕士学位期间完成的科研成果 | 第44-45页 |
致谢 | 第45页 |