摘要 | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第8-14页 |
1 我国普通白菜的栽培现状 | 第8页 |
2 植物春化机理研究现状 | 第8-10页 |
3 白菜春化基因及研究现状 | 第10页 |
4 测序技术及表达谱的研究进展 | 第10-12页 |
5 本研究的目的及意义 | 第12-14页 |
第二章 普通白菜春化响应基因表达谱分析 | 第14-50页 |
1 试验材料与方法 | 第14-18页 |
1.1 试验材料 | 第14页 |
1.1.1 植物材料 | 第14页 |
1.1.2 主要仪器与设备 | 第14页 |
1.1.3 基因表达谱测序 | 第14页 |
1.2 材料的种植及处理 | 第14-15页 |
1.3 花芽分化观察及取样 | 第15页 |
1.4 RNA的提取及质量评估 | 第15页 |
1.5 RNA的质量鉴定和电泳检测 | 第15-16页 |
1.6 普通白菜春化数字基因表达谱高通量测序 | 第16页 |
1.7 数字基因表达谱的生物信息学分析 | 第16-17页 |
1.8 实时定量PCR验证 | 第17-18页 |
2 结果与分析 | 第18-45页 |
2.1 样品RNA质量检测 | 第18-19页 |
2.2 测序数据统计与质量评估 | 第19-22页 |
2.2.1 测序数据统计及比对情况 | 第19-20页 |
2.2.2 测序饱和度的分析 | 第20-21页 |
2.2.3 cDNA片段随机性检验 | 第21-22页 |
2.3 基因表达分析 | 第22页 |
2.4 差异表达基因分析 | 第22-38页 |
2.4.1 差异表达基因的筛选 | 第22-24页 |
2.4.2 差异表达基因的GO功能注释 | 第24-34页 |
2.4.3 差异表达基因的KEGG途径分析 | 第34-38页 |
2.5 普通白菜春化基因挖掘 | 第38-44页 |
2.5.1 普通白菜基因表达谱与大白菜春化基因的对应分析 | 第38-39页 |
2.5.2 普通白菜基因表达谱与拟南芥春化基因的对应分析 | 第39-41页 |
2.5.3 普通白菜基因表达谱春化响应基因分析 | 第41-44页 |
2.6 qRT-PCR荧光定量验证及FLC表达分析 | 第44-45页 |
2.6.1 qRT-PCR荧光定量PCR验证 | 第44-45页 |
2.6.2 FLC表达分析 | 第45页 |
3 讨论 | 第45-49页 |
3.1 普通白菜春化基因的挖掘 | 第45-46页 |
3.2 普通白菜春化过程的代谢特点 | 第46-48页 |
3.3 FLC在普通白菜中的表达 | 第48-49页 |
4 结论 | 第49-50页 |
创新点及展望 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
Abstract | 第57-58页 |
攻读硕士期间发表的学术论文 | 第59-61页 |
致谢 | 第61页 |