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光滑鳖甲抗菌肽基因的克隆、表达及生物学活性研究

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
英文缩略语第11-12页
第一部分 文献综述第12-28页
 1 抗菌肽的作用机制第12-14页
   ·作用于细胞膜的抗菌肽机制第13页
   ·抑制细胞壁合成第13页
   ·抑制核酸和蛋白质的合成第13-14页
 2 抗菌肽的来源第14-21页
   ·动物源抗菌肽第14-15页
     ·哺乳动物源抗菌肽第14-15页
     ·两栖动物抗菌肽第15页
   ·昆虫源抗菌肽第15-18页
     ·双翅肽(Diptericins)第15页
     ·攻击素(Attacins)第15-16页
     ·肉蝇毒素(Sarcotoxins II)第16页
     ·膜翅肽(Hymenoptaecins)第16页
     ·鞘翅肽(Coleoptericin)第16-17页
     ·蛴螬菌素(Holotricin)第17页
     ·天蚕葛佬素(Gloverins)第17页
     ·天蚕素(Cecropin)第17-18页
     ·防御素(Defensins)第18页
   ·来源于海洋生物的抗菌肽第18-19页
     ·虾类抗菌肽第18-19页
     ·蟹类抗菌肽第19页
     ·鱼类抗菌肽第19页
   ·植物源抗菌肽第19-21页
     ·番石榴中富含甘氨酸的抗菌肽Pg-AMP第20页
     ·小麦抗菌肽Tk-AMP第20页
     ·中果咖啡种子中的抗菌肽Cc-GPRs第20页
     ·燕麦多肽Avesin A第20-21页
 3.存在的问题第21-22页
   ·抗菌肽的来源第21页
   ·抗菌肽的安全性第21页
   ·抗菌肽的抗性第21-22页
 4.应用前景第22-23页
 参考文献第23-28页
第二部分 实验部分第28-83页
 第一章 光滑鳖甲抗菌肽的基因克隆及生物信息学分析第28-63页
  引言第28-29页
  1. 材料和试剂第29页
   ·材料第29页
   ·主要试剂第29页
   ·主要实验仪器第29页
  2 方法第29-33页
   ·细菌针刺感染幼虫第29-30页
   ·光滑鳖甲总RNA的提取第30-31页
   ·cDNA模板的合成第31-32页
   ·目的基因的扩增及构建pMD18‐T‐ApAMP55、pMD18‐T‐ApAMP85、pMD18‐T‐ApAMP1015重组质粒第32-33页
   ·光滑鳖甲抗菌肽基因ApAMP85、ApAMP1015、ApAMP55的生物信息学分析第33页
  3.结果与分析第33-58页
   ·光滑鳖甲幼虫总RNA的提取第33-34页
   ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP55基因的克隆第34-35页
   ·ApAMP55基因序列的生物信息学分析第35-42页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP55氨基酸序列分析第35-36页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP55序列比对第36页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP55遗传进化树第36-37页
     ·多肽ApAMP55氨基酸一级结构及理化性质预测分析第37-38页
     ·多肽ApAMP55保守结构域分析第38页
     ·多肽ApAMP55亚细胞定位第38页
     ·多肽ApAMP55信号肽的预测和分析第38-39页
     ·多肽ApAMP55跨膜结构域预测和分析第39-40页
     ·多肽ApAMP55疏水性\亲水性的预测和分析第40-41页
     ·多肽ApAMP55二级结构的预测和分析第41页
     ·多肽ApAMP55三级结构的预测和分析第41-42页
   ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP85基因的克隆第42页
   ·ApAMP85基因序列的生物信息学分析第42-50页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP85氨基酸序列分析第42-43页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP85序列比对第43-44页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP85遗传进化树第44-45页
     ·多肽ApAMP85氨基酸一级结构及理化性质预测分析第45-46页
     ·多肽ApAMP85蛋白的保守结构域分析第46页
     ·多肽ApAMP85亚细胞定位第46页
     ·多肽ApAMP85蛋白信号肽的预测和分析第46-47页
     ·多肽ApAMP85跨膜结构域预测和分析第47-48页
     ·ApAMP85蛋白氨基酸序列疏水性/亲水性的预测和分析第48-49页
     ·ApAMP85蛋白的二级结构预测第49页
     ·ApAMP85蛋白的三级结构预测第49-50页
   ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP1015基因的克隆第50-51页
   ·ApAMP1015基因序列的生物信息学分析第51-58页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP1015氨基酸序列分析第51页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP1015序列比对第51-52页
     ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP1015遗传进化树第52页
     ·多肽ApAMP1015的理化性质预测第52-54页
     ·ApAMP1015蛋白的保守结构域分析第54页
     ·多肽ApAMP1015亚细胞定位第54页
     ·ApAMP1015蛋白信号肽的预测第54-55页
     ·多肽ApAMP1015跨膜结构域预测和分析第55-56页
     ·ApAMP1015蛋白氨基酸序列疏水性/亲水性的预测和分析第56-57页
     ·ApAMP1015蛋白的二级结构预测第57页
     ·ApAMP1015蛋白的三级结构预测第57-58页
  4 讨论第58-60页
  参考文献第60-63页
 第二章 光滑鳖甲抗菌肽原核表达、表达条件优化及生物学活性研究第63-83页
  引言第63-64页
  1 材料和试剂第64页
   ·材料第64页
   ·试剂第64页
   ·主要仪器第64页
  2.方法第64-72页
   ·原核表达载体的构建及鉴定第64-67页
   ·融合蛋白表达菌株的筛选及原核表达第67-68页
   ·融合蛋白TrxA‐ApAMP的亲和纯化及鉴定第68-69页
     ·融合蛋白的亲和纯化第68页
     ·蛋白的透析与浓缩第68页
     ·融合蛋白TrxA-ApAMP的Western blotting鉴定第68-69页
   ·融合蛋白TrxA‐ApAMP1015的原核表达条件的优化第69-71页
     ·IPTG浓度对TrxA-ApAMP1015蛋白表达量的影响第69-70页
     ·不同诱导温度对TrxA-ApAMP1015蛋白表达量的影响第70页
     ·转速对TrxA-ApAMP1015蛋白表达量的影响第70-71页
     ·不同诱导时间对TrxA-ApAMP1015蛋白表达量的影响第71页
   ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP的抗菌活性检测第71-72页
     ·融合蛋白TrxA-ApAMP的表达对宿主菌生长的影响第71页
     ·融合蛋白TrxA-ApAMP的抗菌活性的研究第71-72页
  3.结果与分析第72-78页
   ·光滑鳖甲抗菌肽的表达及鉴定第72-74页
     ·融合蛋白TrxA-ApAMP55的表达与鉴定第72页
     ·融合蛋白ApAMP85的表达与鉴定第72-73页
     ·融合蛋白ApAMP1015表达与鉴定第73-74页
   ·融合蛋白的亲和纯化第74-75页
   ·光滑鳖甲抗菌肽ApAMP1015表达条件的优化第75-77页
     ·不同IPTG浓度对蛋白的表达量的影响第75页
     ·不同诱导温度对蛋白表达量的影响第75-76页
     ·转速对蛋白表达量的影响第76页
     ·不同诱导时间对蛋白表达量的影响第76-77页
   ·光滑鳖甲抗菌肽基因ApAMP的抗菌活性检测第77-78页
  4.讨论第78-81页
  参考文献第81-83页
第三部分 结论与展望第83-85页
 1.结论第83-84页
 2.展望第84-85页
第四部分 附录第85-90页
 附录一 常用试剂的配制第85-89页
 附录二 个人简历第89-90页
致谢第90-91页

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