| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-23页 |
| 1 甘蔗黑穗病 | 第15-16页 |
| ·甘蔗黑穗病的发生与危害 | 第15页 |
| ·甘蔗抗黑穗病性研究 | 第15-16页 |
| 2 防御酶活性与植物抗病性 | 第16-18页 |
| ·活性氧代谢途径 | 第16-17页 |
| ·苯丙烷代谢途径 | 第17-18页 |
| 3 植物miRNA | 第18-21页 |
| ·miRNA的形成和作用机制 | 第18页 |
| ·植物miRNA的生物学功能研究 | 第18-20页 |
| ·植物miRNA参与发育调控 | 第18-19页 |
| ·植物miRNA参与非生物胁迫应答 | 第19页 |
| ·植物miRNA参与生物胁迫应答 | 第19-20页 |
| ·植物miRNA及其靶基因的预测及验证 | 第20-21页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 5 技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 黑穗病菌侵染后甘蔗活性氧代谢及苯丙烷代谢途径关键酶的活性变化 | 第23-38页 |
| 1 材料与方法 | 第23-29页 |
| ·植物材料及处理 | 第23页 |
| ·甘蔗基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| ·黑穗病菌拷贝数鉴定 | 第24页 |
| ·酶活性测定 | 第24-28页 |
| ·粗酶液提取 | 第24-25页 |
| ·活性氧代谢途径 | 第25-27页 |
| ·过氧化物酶(POD)活性测定 | 第25页 |
| ·超氧化物歧化酶(SOD)活性测定 | 第25-26页 |
| ·过氧化氢酶(CAT)活性测定 | 第26-27页 |
| ·苯丙烷代谢途径 | 第27-28页 |
| ·多酚氧化酶(PPO)活性测定 | 第27页 |
| ·苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性测定 | 第27-28页 |
| ·酪氨酸解氨酶(TAL) | 第28页 |
| ·数据处理 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-36页 |
| ·甘蔗基因组DNA的质量检测 | 第29页 |
| ·甘蔗黑穗病菌菌量分析 | 第29-30页 |
| ·黑穗病菌胁迫下甘蔗活性氧代谢途径关键酶活性变化 | 第30-32页 |
| ·过氧化物酶(POD)活性变化 | 第30-31页 |
| ·过氧化物歧化酶(SOD)活性变化 | 第31页 |
| ·过氧化氢酶(CAT)活性变化 | 第31-32页 |
| ·黑穗病菌胁迫下甘蔗苯丙烷代谢途径关键酶活性变化 | 第32-34页 |
| ·多酚氧化酶(PPO)活性变化 | 第32-33页 |
| ·苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性变化 | 第33页 |
| ·酪氨酸解氨酶(TAL)活性变化 | 第33-34页 |
| ·黑穗病菌侵染初期病原菌菌量与活性氧代谢和苯丙烷代谢途径关键酶活性变化的综合分析 | 第34-36页 |
| 3 讨论 | 第36-38页 |
| ·甘蔗黑穗病菌的菌量分析 | 第36页 |
| ·黑穗病菌侵染初期酶活性的变化分析 | 第36-38页 |
| ·活性氧代谢关键酶应答甘蔗黑穗病菌侵染的调控模式 | 第36-37页 |
| ·苯丙烷代谢关键酶应答甘蔗黑穗病菌侵染的调控模式 | 第37-38页 |
| 第三章 黑穗病菌侵染初期甘蔗降解组测序分析 | 第38-60页 |
| 1 材料与方法 | 第38-42页 |
| ·植物材料及处理 | 第38页 |
| ·主要使用的数据库 | 第38-39页 |
| ·总RNA提取及质量检测 | 第39页 |
| ·降解组文库构建、测序及生物信息学分析 | 第39-40页 |
| ·靶标基因的预测及降解位点分析 | 第40-41页 |
| ·靶标基因的功能注释 | 第41页 |
| ·靶标基因的表达分析 | 第41页 |
| ·靶标基因的差异表达分析 | 第41-42页 |
| ·抗病性相关基因鉴定 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-58页 |
| ·总RNA的质量检测 | 第42页 |
| ·降解组测序数据的概述 | 第42-43页 |
| ·靶标基因的鉴定及分类 | 第43-44页 |
| ·降解位点的特异性和多样性 | 第44-45页 |
| ·靶标基因的注释及功能分类 | 第45-46页 |
| ·靶标基因的差异表达分析 | 第46-56页 |
| ·差异表达靶标基因的筛选 | 第46-47页 |
| ·COG/GO分析 | 第47-51页 |
| ·KEGG分析 | 第51-56页 |
| ·抗病相关靶标基因的鉴定 | 第56-58页 |
| ·YC05-179和ROC22共有的连续性差异表达基因分析 | 第56-57页 |
| ·YC05-179/ROC22特有的连续性差异基因表达分析 | 第57页 |
| ·YC05-179连续性-ROC22非连续性差异基因表达分析 | 第57-58页 |
| ·YC05-179特有的非连续性差异表达基因 | 第58页 |
| 3 讨论 | 第58-60页 |
| 第四章 抗病相关靶标基因及其对应miRNA的表达分析 | 第60-79页 |
| 1 材料与方法 | 第60-70页 |
| ·植物材料及处理 | 第60页 |
| ·主要试剂 | 第60页 |
| ·总RNA的提取与检测 | 第60-61页 |
| ·靶标基因的qRT-PCR表达验证 | 第61-65页 |
| ·引物设计 | 第61-64页 |
| ·cDNA合成 | 第64页 |
| ·总RNA中DNA的去除 | 第64页 |
| ·反转录 | 第64页 |
| ·qRT-PCR表达验证 | 第64-65页 |
| ·靶标基因对应miRNA的qRT-PCR表达验证 | 第65-70页 |
| ·引物设计 | 第65-69页 |
| ·反转录 | 第69页 |
| ·qRT-PCR表达验证 | 第69-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-75页 |
| ·靶标基因和miRNA的引物特异性分析 | 第70-72页 |
| ·靶标基因和相应miRNA的表达分析 | 第72-75页 |
| 3 讨论 | 第75-79页 |
| ·木质素生物合成途径 | 第75-76页 |
| ·泛素介导的蛋白降解途径 | 第76页 |
| ·植物与病原菌互作途径 | 第76-77页 |
| ·植物激素信号转导途径 | 第77-78页 |
| ·抗性相关转录因子 | 第78页 |
| ·miRNA反馈调节 | 第78-79页 |
| 第五章 结论与展望 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
